デオキシリボヌクレアーゼI

Dnase1
識別子
エイリアスデオキシリボヌクレアーゼ IAI788650DNaseIDnl1
外部IDHomoloGene : 3826 ; GeneCards : [1] ; OMA : - オルソログ
オーソログ
人間ねずみ
エントレズ
アンサンブル
ユニプロット
RefSeq (mRNA)

NM_010061 NM_001357143

該当なし

RefSeq(タンパク質)

NP_034191 NP_001344072

NP_034191 NP_001344072

場所(UCSC)16章: 3.85 – 3.86 Mb該当なし
PubMed検索[ 1 ]該当なし
ウィキデータ
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デオキシリボヌクレアーゼI(通常DNase Iと呼ばれる)は、ヒト遺伝子DNASE1 によってコードされるDNaseファミリーのエンドヌクレアーゼである。[ 2 ] DNase Iは、ピリミジンヌクレオチドに隣接するホスホジエステル結合でDNAを優先的に切断するヌクレアーゼであり、3'位に遊離ヒドロキシル基を持つ5'-リン酸末端ポリヌクレオチドを生成し、平均してテトラヌクレオチドを生成する。一本鎖DNA、二本鎖DNA、およびクロマチンに作用する。廃棄物管理エンドヌクレアーゼとしての役割に加えて、アポトーシス中のDNA断片化を担うデオキシリボヌクレアーゼの1つであることが示唆されている。[ 3 ]

DNase Iは細胞骨格タンパク質アクチンに結合します。アクチンモノマーには非常に高い(ナノモル未満)親和性で結合し、アクチンポリマーにはより低い親和性で結合します。この相互作用の機能は不明です。しかし、アクチンに結合したDNase Iは酵素活性を持たないため、DNase-アクチン複合体は遺伝情報の損傷を防ぐDNase Iの貯蔵形態である可能性があります。このタンパク質は核膜の チモーゲン顆粒に貯蔵され、エンドヌクレアーゼ的にDNAを切断することで機能します。

DNASE 1遺伝子には、少なくとも6つの常染色体共優性対立遺伝子(DNASE1*1からDNASE1*6)が特徴付けられており、本記録ではDNASE1*2の配列が示されている。この遺伝子の変異、およびその酵素産物を不活性化する因子は、自己免疫疾患である全身性エリテマトーデス(SLE)と関連付けられている。[ 4 ] [ 5 ]このタンパク質の組み換え型は、喀痰中の細胞外DNAを加水分解して粘稠度を低下させることで、嚢胞性線維症の症状の一つを治療するために使用される。[ 6 ]この遺伝子の選択的転写スプライスバリアントが観察されているが、十分に特徴付けられていない。[ 2 ]

ゲノミクスでは

ゲノミクスでは、DNase Iの過敏性部位は、開いたアクセス可能なクロマチンによって特徴付けられると考えられているため、DNase I感受性アッセイは、ゲノムのどの領域に活性遺伝子が含まれている可能性が高いかを特定するためにゲノミクスで広く使用されている方法論です[ 7 ]

DNase I配列特異性

最近、DNase Iは実験条件に依存する可能性があるものの、ある程度の配列特異性を示すことが報告されている[ 8 ]。高い基質特異性を持つ他の酵素とは対照的に、DNase Iは絶対的な配列特異性を持って切断するわけではない。しかし、3'末端にCまたはGを含む部位での切断は効率が低い。

参考文献

  1. ^ 「ヒトPubMedリファレンス:」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター
  2. ^ a b「Entrez遺伝子:DNASE1デオキシリボヌクレアーゼI」
  3. ^ Samejima, K. & Earnshaw, WC (2005). 「ゲノム破壊:アポトーシスにおけるヌクレアーゼの役割」Nat Rev Mol Cell Biol . 6 (9): 677– 88. doi : 10.1038/nrm1715 . PMID 16103871 . S2CID 13948545 .  
  4. ^ Hakkim A, Fürnrohr BG, Amann K, Laube B, Abed UA, Brinkmann V, Herrmann M, Voll RE, Zychlinsky A (2010). 「好中球細胞外トラップ分解障害はループス腎炎と関連する」 . Proc Natl Acad Sci USA . 107 (21): 9813–8 . Bibcode : 2010PNAS..107.9813H . doi : 10.1073/pnas.0909927107 . PMC 2906830. PMID 20439745 .  
  5. ^ Yasutomo K, Horiuchi T, Kagami S, et al. (2001). 「全身性エリテマトーデス患者におけるDNASE1遺伝子の変異」Nat . Genet . 28 (4): 313–4 . doi : 10.1038/91070 . PMID 11479590. S2CID 21277651 .  
  6. ^ Shak S, Capon DJ, Hellmiss R, et al. (1991). 「組換えヒトDNase Iは嚢胞性線維症患者の痰の粘度を低下させる」 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 87 ( 23): 9188–92 . doi : 10.1073/pnas.87.23.9188 . PMC 55129. PMID 2251263 .  
  7. ^ Boyle AP, Davis S, Shulha HP, Meltzer P, Margulies EH, Weng Z, Furey TS, Crawford GE (2008). 「ゲノム全体にわたるオープンクロマチンの高解像度マッピングと特性評価」 . Cell . 132 (2): 311– 322. doi : 10.1016/ j.cell.2007.12.014 . PMC 2669738. PMID 18243105 .  
  8. ^ Koohy, Hashem; Down, Thomas A.; Hubbard, Tim J.; Mariño-Ramírez, Leonardo (2013年7月26日). 「クロマチンアクセシビリティデータセットはDNase I酵素の配列特異性に起因するバイアスを示す」 . PLOS ONE . 8 (7) e69853. Bibcode : 2013PLoSO...869853K . doi : 10.1371/journal.pone.0069853 . PMC 3724795. PMID 23922824 .  

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