SNTG1

SNTG1
識別子
エイリアスSNTG1、G1SYN、SYN4、シントロフィンガンマ1
外部IDオミム：608714; MGI : 1918346;ホモロジーン: 56834;ジーンカード：SNTG1; OMA :SNTG1 - オルソログ
オーソログ
種人間ねずみ
エントレズ

54212

71096

アンサンブル

ENSG00000147481

ENSMUSG00000025909

ユニプロット

Q9NSN8

Q925E1

RefSeq (mRNA)

NM_001290390
NM_001290392
NM_001290393
NM_027671

RefSeq（タンパク質）

NP_001277319
NP_001277321
NP_001277322
NP_081947

場所（UCSC）8章: 49.91 – 50.8 Mb1章: 8.36 – 9.3 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
人間の表示/編集マウスの表示/編集

ガンマ1シントロフィンは、ヒトではSNTG1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]

この遺伝子によってコードされるタンパク質は、シントロフィンファミリーのメンバーです。シントロフィンは細胞質表層膜タンパク質であり、典型的には2つのプレクストリン相同（PH）ドメイン、最初のPHドメインを二分するPDZドメイン、およびジストロフィン結合を媒介するC末端ドメインを含みます。この遺伝子は脳で特異的に発現します。この遺伝子の転写バリアントは報告されていますが、その全長は未だ解明されていません。[6]

参考文献

  1. ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000147481 – Ensembl、2017年5月
  2. ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000025909 – Ensembl、2017年5月
  3. ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  4. ^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  5. ^ ピルソ G、ミラベラ M、リッチ E、ベルシト A、アボンダンツァ C、セルビデイ S、プカ AA、トナーリ P、プカ GA、ニグロ V (2000 年 6 月)。 「ガンマ 1 およびガンマ 2 シントロフィン、神経細胞に局在する 2 つの新規ジストロフィン結合タンパク質」。Ｊバイオルケム．275 (21): 15851–60 .土井: 10.1074/jbc.M000439200。PMID  10747910。
  6. ^ ab "Entrez Gene: SNTG1 シントロフィン、ガンマ 1".

さらに読む

  • Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). 「in vitro部位特異的組換えを用いたDNAクローニング」Genome Res . 10 (11): 1788–95 . doi :10.1101/gr.143000. PMC  310948. PMID  11076863 .
  • Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). 「ヒト遺伝子およびタンパク質のカタログ作成に向けて：新規完全タンパク質コードヒトcDNA500個の配列決定と解析」Genome Res . 11 (3): 422–35 . doi :10.1101/gr.GR1547R. PMC 311072.  PMID 11230166  .
  • Hogan A, Shepherd L, Chabot J, et al. (2001). 「γ1-シントロフィンとジアシルグリセロールキナーゼζの相互作用。PDZ相互作用による核局在の制御」J. Biol. Chem . 276 (28): 26526–33 . doi : 10.1074/jbc.M104156200 . PMID  11352924.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
  • Widberg CH, Bryant NJ, Girotti M, et al. (2003). 「トモシンはt-SNAREタンパク質であるシンタキシン4およびSNAP23と相互作用し、インスリン刺激によるGLUT4の転座に関与する」J. Biol. Chem . 278 (37): 35093–101 . doi : 10.1074/jbc.M304261200 . PMID  12832401.
  • Buxton P, Zhang XM, Walsh B, et al. (2004). 「非神経細胞においてSNAP23と相互作用する普遍的に発現するSNARE結合タンパク質としてのSnapinの同定と特性解析」Biochem. J. 375 ( Pt 2): 433–40 . doi :10.1042/BJ20030427. PMC 1223698.  PMID 12877659  .
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大：哺乳類遺伝子コレクション（MGC）」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928.  PMID 15489334  .
  • Wiemann S, Arlt D, Huber W, et al. (2004). 「ORFeomeから生物学へ：機能ゲノミクスパイプライン」Genome Res . 14 (10B): 2136–44 . doi :10.1101/gr.2576704. PMC  528930. PMID  15489336 .
  • Barrios-Rodiles M, Brown KR, Ozdamar B, et al. (2005). 「哺乳類細胞における動的シグナル伝達ネットワークのハイスループットマッピング」. Science . 307 (5715): 1621–5 . Bibcode :2005Sci...307.1621B. doi :10.1126/science.11​​05776. PMID :  15761153. S2CID  : 39457788.
  • Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, et al. (2006). 「LIFEdbデータベース 2006」Nucleic Acids Res 34 (データベース号): D415–8. doi :10.1093/nar/gkj139. PMC  1347501. PMID  16381901 .
  • Chen Z, Hague C, Hall RA, Minneman KP (2006). 「シントロフィンはPDZドメインを介した相互作用を通じてα1Dアドレナリン受容体を制御する」. J. Biol. Chem . 281 (18): 12414–20 . doi : 10.1074/jbc.M508651200 . PMID  16533813.


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