TCOF1

TCOF1
識別子
エイリアスTCOF1、MFD1、TCS、TCS1、トリークル、トリークルリボソーム生合成因子1
外部IDオミム：606847; MGI : 892003;ホモロジーン: 68049;ジーンカード：TCOF1; OMA :TCOF1 - オルソログ
オーソログ
種人間ねずみ
エントレズ

6949

21453

アンサンブル

ENSG00000070814

ENSMUSG00000024613

ユニプロット

Q13428

O08784

RefSeq (mRNA)

NM_001198984
NM_011552

RefSeq（タンパク質）

NP_001185913
NP_035682

場所（UCSC）5番目の文字: 150.36 – 150.4 Mb18章: 60.95 – 60.98 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
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トリークルリボソーム生合成因子1（TCOF1）は、ヒトではTCOF1遺伝子によってコードされるタンパク質です。[5] [6] TCOF1は、LIS1相同ドメインを持つ核小体タンパク質をコードします。 [7]トリークルタンパク質は、上流結合因子（UBF）との相互作用を介してrRNA遺伝子の転写に関与しています。この遺伝子の変異は、頭蓋顔面の発達異常を伴う疾患であるトリーチャーコリンズ症候群と関連付けられています。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする代替転写スプライスバリアントが見つかっていますが、現在までに特徴付けられているのは3つだけです。[6]

遺伝子

TCOF1遺伝子は、 5番染色体の長腕（q）の32番と33.1番の間、塩基対150,357,629から塩基対150,400,308に位置している。[8]

関数

TCOF1は、細胞内でリボソームRNA （rRNA）と呼ばれる分子の生成に関与しています。[7] TCOF1は、 rRNAが生成される核内の小さな領域である核小体で活性化します。 [9]リボソームと呼ばれる細胞構造の主要成分として、rRNAはタンパク質の組み立てに不可欠です。[10]このタンパク質は、顔の骨やその他の組織になる構造の初期胚発生中に活性化します。 [11]このタンパク質の正確な機能は不明ですが、研究者は、顔の骨や関連構造の発達に重要な役割を果たしていると考えています。[12]

UBFとの相互作用以外にも、糖蜜は核小体タンパク質pNop56との相互作用によって成熟リボソームRNAの前駆体のメチル化に関与していることが示唆されている。 [13]

臨床的意義

トリーチャーコリンズ症候群の患者では、TCOF1遺伝子に120以上の変異が確認されています。これらの変異のほとんどは、TCOF1遺伝子内の少数のDNA構成要素（塩基対）の挿入または欠失です。TCOF1変異により、異常に小さく機能しないトリークルタンパク質が生成されるか、細胞がこのタンパク質を生成できなくなります。研究者らは、トリークルタンパク質の減少により、顔面骨や組織になる胚の一部におけるrRNAの生成が減少すると推測しています。トリーチャーコリンズ症候群に見られる顔面発達の特定の問題が、トリークルタンパク質の減少によってどのように引き起こされるのかは分かっていません。例えば、これらの患者のTCOF遺伝子の変異は、しばしば口蓋裂を引き起こします。[14]

モデル生物

チンド犬におけるこの遺伝子の変異は、チンド犬とボクサー犬の間で観察される頭蓋の違いと関連している。[15]

参考文献

  1. ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000070814 – Ensembl、2017年5月
  2. ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000024613 – Ensembl、2017年5月
  3. ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  4. ^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  5. ^ Jabs EW, Li X, Coss CA, Taylor EW, Meyers DA, Weber JL (1991年9月). 「トリーチャー・コリンズ症候群の遺伝子座位5q31.3----q33.3へのマッピング」. Genomics . 11 (1): 193– 198. doi : 10.1016/0888-7543(91)90118-X . PMID  1765376.
  6. ^ ab "Entrez Gene: TCOF1 Treacher Collins-Franceschetti 症候群 1".
  7. ^ ab Valdez BC, Henning D, So RB, Dixon J, Dixon MJ (2004年7月). 「トリーチャー・コリンズ症候群（TCOF1）遺伝子産物は、上流結合因子との相互作用によりリボソームDNA遺伝子転写に関与する」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 101 (29): 10709– 10714. Bibcode :2004PNAS..10110709V. doi : 10.1073/pnas.0402492101 . PMC 489999. PMID  15249688 . 
  8. ^ 「染色体5: 150,357,629-150,400,308 - 領域の詳細 - Homo_sapiens - Ensemblゲノムブラウザ113」asia.ensembl.org . 2025年2月26日閲覧。
  9. ^ Wise CA, Chiang LC, Paznekas WA, Sharma M, Musy MM, Ashley JA, et al. (1997年4月). 「TCOF1遺伝子は、コード領域全体にわたってトリーチャー・コリンズ症候群の変異を示す推定核小体リン酸化タンパク質をコードする」米国科学アカデミー紀要. 94 (7): 3110– 3115. doi :10.1073/pnas.94.7.3110. PMC 20330. PMID 9096354  . 
  10. ^ 「リボソーム、転写、翻訳 | Scitableで科学を学ぶ」www.nature.com . 2025年2月25日閲覧。
  11. ^ 「TCOF1遺伝子：MedlinePlus Genetics」medlineplus.gov . 2025年2月25日閲覧。
  12. ^ Dixon J, Jones NC, Sandell LL, Jayasinghe SM, Crane J, Rey JP, 他 (2006年9月). 「Tcof1/Treacleは、頭蓋顔面異常を引き起こす神経堤細胞の形成および増殖不全に必須である」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 103 (36): 13403– 13408. doi :10.1073/pnas.0603730103. PMC 1557391. PMID 16938878  . 
  13. ^ Gonzales B, Henning D, So RB, Dixon J, Dixon MJ, Valdez BC (2005年7月). 「トリーチャー・コリンズ症候群（TCOF1）遺伝子産物はpre-rRNAメチル化に関与している」. Human Molecular Genetics . 14 (14): 2035– 2043. doi : 10.1093/hmg/ddi208 . PMID  15930015.
  14. ^ Dixon MJ, Marazita ML, Beaty TH, Murray JC (2011年3月). 「口唇裂・口蓋裂：遺伝的および環境的影響の理解」. Nature Reviews. Genetics . 12 (3): 167–78 . doi :10.1038/nrg2933. PMC 3086810. PMID 21331089  . 
  15. ^ Kim RN, Kim DS, Choi SH, Yoon BH, Kang A, Nam SH, 他 (2012年6月). 「大規模並列シーケンシングによる飼い犬（韓国チンド犬）のゲノム解析」. DNA Research . 19 (3​​): 275– 287. doi :10.1093/dnares/dss011. PMC 3372376. PMID  22474061 . 

さらに読む

  • Splendore A, Silva EO, Alonso LG, Richieri-Costa A, Alonso N, Rosa A, 他 (2000年10月). 「トリーチャー・コリンズ症候群患者におけるTCOF1遺伝子の高い変異検出率は、変異のクラスター化と16の新たな病原性変化を明らかにする」. Human Mutation . 16 (4): 315– 322. doi : 10.1002/1098-1004(200010)16:4<315::AID-HUMU4>3.0.CO;2-H . PMID  11013442. S2CID  36109746.
  • Dixon MJ, Dixon J, Raskova D, Le Beau MM, Williamson R, Klinger K, 他 (1992年7月). 「トリーチャー・コリンズ症候群遺伝子座の遺伝学的および物理的マッピング：染色体5q32-33.2への局在の精密化」. Human Molecular Genetics . 1 (4): 249– 253. doi :10.1093/hmg/1.4.249. PMID  1303194.
  • 丸山 憲一、菅野 誠（1994年1月）. 「オリゴキャッピング：真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡便法」.遺伝子. 138 ( 1–2 ): 171–174 . doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
  • Dixon MJ, Dixon J, Houseal T, Bhatt M, Ward DC, Klinger K, 他 (1993年5月). 「トリーチャー・コリンズ症候群の遺伝子座位の位置を、5q32-33.1における3つの新たなマイクロサテライトマーカー間の狭い範囲に絞り込む」American Journal of Human Genetics . 52 (5): 907– 914. PMC  1682053. PMID  8488840 .
  • 「トリーチャー・コリンズ症候群の病因に関与する遺伝子の位置クローニング。トリーチャー・コリンズ症候群共同研究グループ」ネイチャー・ジェネティクス12 ( 2): 130– 136. 1996年2月. doi :10.1038/ng0296-130. PMID  8563749. S2CID  34312227.
  • Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1996年9月). 「正規化と減算：遺伝子発見を促進する2つのアプローチ」. Genome Research . 6 (9): 791–806 . doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID  8889548.
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  • Emes RD, Ponting CP (2001年11月). 「滑脳症、トリーチャー・コリンズ症候群、口腔・顔面・指症候群1型を結びつける新たな配列モチーフ、微小管ダイナミクス、そして細胞移動」. Human Molecular Genetics . 10 (24): 2813– 2820. doi : 10.1093/hmg/10.24.2813 . PMID  11734546.
  • Splendore A, Jabs EW, Passos-Bueno MR (2002年7月). 「異なる集団の患者におけるTCOF1のスクリーニング：変異ホットスポットの確認と、タンパク質糖蜜の重要な機能ドメインを示唆する新規ミスセンス変異の同定」. Journal of Medical Genetics . 39 (7): 493– 495. doi :10.1136/jmg.39.7.493. PMC 1735178.  PMID 12114482  .
  • 太田 誠、塩見 雄一、杉本 健、小布施 千恵子、釣本 剛 (2002年10月). 「ヒト細胞ライセート中の増殖細胞核抗原（PCNA）結合タンパク質を同定するためのプロテオミクスアプローチ．新規PCNA結合タンパク質としてのヒトCHL12/RFCs2-5複合体の同定」. The Journal of Biological Chemistry . 277 (43): 40362– 40367. doi : 10.1074/jbc.M206194200 . PMID  12171929.
  • GeneReviews/NCBI/NIH/UWのトリーチャーコリンズ症候群または下顎顔面骨異形成症に関するエントリ
  • ジーンカード
  • 米国国立医学図書館の医学主題標目表（MeSH）におけるTCOF1+タンパク質、+ヒト
  • UCSC ゲノム ブラウザにおける TCOF1 ヒト遺伝子の位置。
  • UCSC ゲノム ブラウザにおける TCOF1 ヒト遺伝子の詳細。


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