PDGFC

PDGFC
識別子
エイリアスPDGFC、ファロテイン、SCDGF、血小板由来成長因子C
外部IDオミム：608452; MGI : 1859631;ホモロジーン: 9423;ジーンカード：PDGFC; OMA :PDGFC - オルソログ
オーソログ
種人間ねずみ
エントレズ

56034

54635

アンサンブル

ENSG00000145431

ENSMUSG00000028019

ユニプロット

Q9NRA1

Q8CI19

RefSeq (mRNA)

NM_016205

NM_019971
NM_001357746

RefSeq（タンパク質）

NP_057289

NP_064355
NP_001344675

場所（UCSC）4号線: 156.76 – 156.97 Mb3 章: 80.94 – 81.12 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
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血小板由来成長因子 C （PDGF-Cとも呼ばれる）は、345 アミノ酸からなるタンパク質で、ヒトではPDGFC 遺伝子によってコードされている。[5] [6]血小板由来成長因子は結合組織の成長、生存および機能に重要であり、2 つのポリペプチド鎖PDGF-AおよびPDGF-Bを含むジスルフィド結合二量体で構成される。PDGF-C は、独自の 2 ドメイン構造と発現パターンを持つ PDGF/VEGF ファミリーの成長因子のメンバーである。PDGF-C はこれまで PDGF-A および PDGF-B とは同一視されていなかったが、これはおそらく、PDGF-C が潜在性成長因子として合成・分泌され、受容体への結合および活性化のために N 末端 CUB ドメインのタンパク質分解による除去を必要とするためと考えられる。[7]

関数

この遺伝子によってコードされるタンパク質は、血小板由来増殖因子ファミリーのメンバーである。このファミリーの4つのメンバーは、間葉系細胞の分裂促進因子であり、8つのシステインからなるコアモチーフを特徴とする。この遺伝子産物はホモ二量体のみを形成するようである。血小板由来増殖因子αおよびβポリペプチドとは異なり、 CUBドメインと呼ばれる特殊なN末端ドメインを有する。[6]

PDGF-CはPDGFR-αシグナル伝達経路の重要な構成要素であり、口蓋形成および外皮組織の形態形成において特異的な役割を果たす。複合変異体の表現型は、PDGF-CとPDGF-AがPDGFR-αの主要なリガンドとして機能する可能性を示唆している。[8]

マウスノックアウト研究では、PDGF-Cが口蓋形成に必要であることが示されている。ヒト研究では、口唇裂および口蓋裂の病因においていくつかの遺伝子（PVRL1、IRF6、およびMSX1）が病因的役割を担っていることが示唆されているが、これらの遺伝子のマウスホモログの発現レベルは、口蓋裂を発症するPdgfc−/−変異体胚において変化が見られなかった。これは、これらの遺伝子の活性が口蓋形成におけるPDGF-Cシグナル伝達とは無関係であることを示唆しており、PDGF-Cシグナル伝達は口蓋形成における新たな経路である。[9]

相互作用

PDGFCはPDGFRAと相互作用することが示されている。[10]

PDGF-Cはタンパク質分解活性を持つ潜在性成長因子であり、そのプロセシング酵素はPDGF-Cシグナル伝達に間接的に関連する可能性のある他のCLP関連遺伝子によって制御されている可能性がある。特に、PDGFC遺伝子がマッピングされているヒト4番染色体上の30cM領域はCLP26と強い連鎖関係を示しており、臨床遺伝学的データはPDGFC遺伝子多型と口唇裂および口蓋裂との潜在的な関連性を示唆している。[8]

参考文献

  1. ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000145431 – Ensembl、2017年5月
  2. ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000028019 – Ensembl、2017年5月
  3. ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  4. ^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  5. ^ Hamada T, Ui-Tei K, Miyata Y (2000年6月). 「発達中の脊髄由来の新規遺伝子SCDGFはPDGF/VEGFファミリーのユニークなメンバーである」. FEBS Lett . 475 (2): 97– 102. doi : 10.1016/S0014-5793(00)01640-9 . PMID  10858496. S2CID  19634520.
  6. ^ ab 「Entrez Gene: PDGFC 血小板由来成長因子C」。
  7. ^ リー X、ポンテン A、アーセ K、カールソン L、アブラムソン A、ウテーラ M、ベックストローム G、ヘルストローム M、ボストロム H、リー H、ソリアーノ P、ベツホルツ C、ヘルディン CH、アリタロ K、オストマン A、エリクソン U (2000 年 5 月)。 「PDGF-C は、PDGF α 受容体の新しいプロテアーゼ活性化リガンドです。」ナット。セルバイオル。2 (5): 302–9 .土井:10.1038/35010579。PMID  10806482。S2CID 25066476  。
  8. ^ ab Ding H, Wu X, Boström H, Kim I, Wong N, Tsoi B, O'Rourke M, Koh GY, Soriano P, Betsholtz C, Hart TC, Marazita ML, Field LL, Tam PP, Nagy A (2004年10月). 「口蓋形成とPDGFR-αシグナル伝達におけるPDGF-Cの特異的要件」. Nat. Genet . 36 (10): 1111–6 . doi : 10.1038/ng1415 . PMID  15361870.
  9. ^ Choi SJ, Marazita ML, Hart PS, Sulima PP, Field LL, McHenry TG, Govil M, Cooper ME, Letra A, Menezes R, Narayanan S, Mansilla MA, Granjeiro JM, Vieira AR, Lidral AC, Murray JC, Hart TC (2009年12月). 「PDGF-C調節領域SNP rs28999109はプロモーター転写活性を低下させ、CL/Pと関連する」. European Journal of Human Genetics . 17 (11): 774– 84. doi :10.1038/ejhg.2008.245. PMC 2788748. PMID 19092777  . 
  10. ^ Gilbertson DG, Duff ME, West JW, Kelly JD, Sheppard PO, Hofstrand PD, Gao Z, Shoemaker K, Bukowski TR, Moore M, Feldhaus AL, Humes JM, Palmer TE, Hart CE (2001年7月). 「血小板由来成長因子C（PDGF-C）はPDGFαおよびβ受容体に結合する新規成長因子である」. J. Biol. Chem . 276 (29): 27406–14 . doi : 10.1074/jbc.M101056200 . PMID  11297552.

さらに読む

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  • Tsai YJ, Lee RK, Lin SP, Chen YH (2000). 「ヒト生殖器官における新規血小板由来成長因子様遺伝子ファロテインの同定」Biochim. Biophys. Acta . 1492 (1): 196– 202. doi :10.1016/s0167-4781(00)00066-x. PMID  11004490.
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