IGFBP7

IGFBP7
識別子
エイリアス	IGFBP7、AGM、FSTL2、IBP-7、IGFBP-7、IGFBP-7v、IGFBPRP1、MAC25、PSF、RAMSVPS、TAF、インスリン様成長因子結合タンパク質7
外部ID	オミム: 602867 ; MGI : 1352480 ;ホモロジーン: 1193 ;ジーンカード: IGFBP7 ; OMA : IGFBP7 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 4番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 4q12 始める 57,030,773 bp [ 1 ] 終わり 57,110,385 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 5番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 5|5 C3.3 始める 77,497,087 bp [ 2 ] 終わり 77,555,888 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 大静脈 腎髄質 伏在静脈 脈絡叢上皮 心膜 浅側頭動脈 下行胸部大動脈 右冠動脈 尿道 上行大動脈 上位の表現 上行大動脈 大動脈弁 水晶体上皮 右腎臓 大動脈領域の中膜 近位尿細管 腎小体 頸動脈小体 右肺 腸間膜リンパ節 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 タンパク質結合 成長因子結合 インスリン様成長因子結合 細胞外マトリックスの構造成分 細胞成分 細胞外マトリックス 細胞外エクソソーム 細胞外空間 小胞体腔 細胞外領域 コラーゲン含有細胞外マトリックス 生物学的プロセス 細胞増殖の調節 細胞集団増殖の負の調節 細胞接着 レチノイン酸への反応 ホルモン刺激に対する細胞反応 ステロイド生合成プロセスの調節 熱に対する反応 胚移植 有機環状化合物への反応 コルチゾールへの反応 翻訳後タンパク質修飾 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 3490 29817 アンサンブル ENSG00000163453 ENSMUSG00000036256 ユニプロット Q16270 Q61581 RefSeq (mRNA) NM_001553 NM_001253835 NM_001159518 NM_008048 RefSeq（タンパク質） NP_001240764 NP_001544 NP_001152990 NP_032074 場所（UCSC） 4章: 57.03 – 57.11 Mb 5番目の文字: 77.5 – 77.56 MB PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
人間の表示/編集 マウスの表示/編集

インスリン様成長因子結合タンパク質7は、ヒトにおいてIGFBP7遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]}このタンパク質の主な機能は、組織におけるインスリン様成長因子（IGF）の利用可能性の調節と、IGFの受容体への結合の調節である。IGFBP7は、 IGFBP1-6と比較してIGFへの親和性が低い。^{[ 8 ] [ 9 ]}また、細胞接着を刺激する。このタンパク質は、いくつかの癌に関与している。^{[ 10 ]}

構造

編集された部位は、IGFBP7のインスリン成長因子結合ドメインとヘパリン結合ドメイン内に見つかりました。この領域は、タンパク質分解切断部位でもあります。編集された部位の構造解析により、編集された部位に対応する2つのアミノ酸は、IGF-1への結合に直接関与しているのではなく、その両側の領域にあることが判明しました。^{[ 11 ]}編集されていない転写産物の位置78には、残基バリン-49の近くにアルギニンがあります。このバリンは、IGF-1のフェニルアラニンとの疎水性相互作用に重要です。この位置のグリシンへの置換は、さらなる柔軟性をもたらしてループ構造の変化をもたらし、それによって複合体を安定化させる疎水性相互作用を破壊すると考えられています。アミノ酸位置98には、編集されていない転写産物にリジンが含まれています。編集版では、その位置はアルギニンです。その長い側鎖がこれらの弱い相互作用を維持できると考えられています。^{[ 12 ]}

関数

編集された領域には、ヘパリン結合部位が提案されており、タンパク質分解切断の認識配列の一部でもある。ヘパリン結合は、タンパク質の細胞結合および細胞接着機能を阻害する。^{[ 13 ]}アミノ酸97位で起こる切断は、ヘパリン結合を減少させるが、タンパク質の増殖刺激活性を調節する。^{[ 14 ]}編集部位はこのヘパリン結合領域内に発生するため、編集の影響はヘパリン結合およびタンパク質分解切断に影響を及ぼし、その結果、下流に他の影響を及ぼす可能性がある。タンパク質はこれらのプロセスに関与していることが示唆されているため、編集はアポトーシス、細胞増殖の調節、および血管新生に影響を与える可能性があると考えられている。^{[ 10 ]}

学習と記憶

欧州神経科学研究所ゲッティンゲン校（ドイツ）の研究では、恐怖消去によって誘導されるIGF2 /IGFBP7シグナル伝達が、生後17～19日の新生児海馬ニューロンの生存を促進することが明らかになった。これは、IGF2シグナル伝達と成人の神経新生を強化する治療戦略が、 PTSDなどの過度の恐怖記憶に関連する疾患の治療に適している可能性を示唆している。^{[ 15 ]}同じグループは、アルツハイマー病ではIGFBP7レベルが上昇し、DNAメチル化を介して制御されていることも発見した。野生型マウスでIGFBP7が上昇すると、記憶障害を引き起こす。アルツハイマー病のような記憶障害を発症したマウスでIGFBP7の機能を阻害すると、記憶機能が回復する。これらのデータは、IGFBP7が記憶の固定の重要な制御因子であり、アルツハイマー病のバイオマーカーとして使用できる可能性があることを示唆している。^{[ 16 ]}

RNA編集

このタンパク質のpre-mRNAはRNA編集の対象となる。2つの編集部位は、以前にdbSNPにおいて一塩基多型として記録されていた。^{[ 12 ]}

種類

A から I へのRNA 編集は、RNA に作用するアデノシンデアミナーゼ (ADAR) のファミリーによって触媒されます。ADAR は、pre-mRNA の二本鎖領域内のアデノシンを特異的に認識し、それらを脱アミノ化してイノシンにします。イノシンは、細胞の翻訳機構によってグアノシンとして認識されます。ADAR ファミリーには、ADAR 1 ～ 3 の 3 つのメンバーがあり、酵素として活性なメンバーは ADAR 1 と ADAR 2 のみです。ADAR3 は脳で制御的な役割を果たしていると考えられています。ADAR1 と ADAR 2 は組織で広く発現していますが、ADAR 3 は脳に限定されています。RNA の二本鎖領域は、編集部位の近くの領域にある残基間の塩基対形成によって形成されます。この残基は通常は隣接するイントロンにありますが、エクソン配列の場合もあります。編集領域と塩基対を形成する領域は、編集相補配列 (ECS) として知られています。 IGFBP7のpre-mRNAは編集酵素の発現スペクトルに基づいてADAR1の基質であると考えられている。^{[ 17 ]}

サイト

このタンパク質のpre-mRNAは2つの部位で編集されています。これらの編集部位はインスリン成長因子ドメイン内にあります。

赤/緑

最終的なタンパク質のアミノ酸位置 78 でアルギニン (R) からグリシン (G) への置換が行われます。

K/R

アミノ酸位置 95 に K から R への置換があります。

編集相補配列（ECS）は、編集部位から約200塩基対上流のコード配列内の領域に位置している。ECSは140 bpの二重鎖構造を形成する。^{[ 12 ]} これら2つの編集部位のAからGまでの不一致は、同じ組織サンプルから得られた対応するcDNAとゲノムDNA配列を解析することにより、RNA編集によるものであることが実験的に確認された。^{[ 10 ]}興味深いことに、対合するためにイントロン配列を必要としないRNAは、理論上は成熟mRNAとして編集を受け続ける可能性がある。3つ目の候補編集部位では、配列解析でRNA編集の証拠は見られなかった。これは、RNA編集プロセスが組織特異的であるか、編集が低頻度で起こることを示している可能性がある。もう1つの考えられる説明は、これらの編集が特定のゲノム多型に関連しているというものである。^{[ 10 ]}編集部位はアンチセンス転写産物とも重複しており、これも二本鎖RNA構造を形成してADARに適した基質を作り出す可能性がある。^{[ 12 ]}

規制

編集は幅広い組織で観察されています。ヒトの脳では、アミノ酸95番目のK/R部位での編集が非常に多く見られます。^{[ 10 ]}

相互作用

IGFBP7はインスリン様成長因子1、^{[ 8 ] [ 14 ]} VPS24、^{[ 18 ]}およびIGF-1受容体（IGF1R ）と相互作用することが示されている。^{[ 19 ]}

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000163453 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000036256 – Ensembl、2017年5月
3. 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Murphy M, Pykett MJ, Harnish P, Zang KD, George DL (1993年9月). 「髄膜腫において発現が異なる遺伝子の同定と特徴づけ」. Cell Growth & Differentiation . 4 (9): 715– 722. PMID 7694637 . 
6. 山内 孝文、梅田 文文、正門 正治、伊佐治 正治、水島 聡、縄田 秀一 (1994年10月). 「ヒト二倍体線維芽細胞の無血清培養上清からのプロスタサイクリン刺激因子の精製および分子クローニング」 . The Biochemical Journal . 303 (Pt 2) (Pt 2): 591– 598. doi : 10.1042/ bj3030591 . PMC 1137368. PMID 7980422 .  
7. 「Entrez Gene: IGFBP7 インスリン様成長因子結合タンパク質7」。
8. Oh Y, Nagalla SR, Yamanaka Y, Kim HS, Wilson E, Rosenfeld RG (1996年11月). 「インスリン様成長因子結合タンパク質（IGFBP）-7の合成と特性解析。組換えヒトmac25タンパク質はIGF-Iおよび-IIに特異的に結合する」 . The Journal of Biological Chemistry . 271 (48): 30322– 30325. doi : 10.1074/jbc.271.48.30322 . PMID 8939990 . 
9. Kim HS, Rosenfeld RG, Oh Y (1997年6月). 「インスリン様成長因子結合タンパク質（IGFBP）の生物学的役割」 . Experimental & Molecular Medicine . 29 (2): 85– 96. doi : 10.1038/emm.1997.13 . ISSN 2092-6413 . S2CID 12150421 .  
10. Gommans WM, Tatalias NE, Sie CP, Dupuis D, Vendetti N, Smith L, et al. (2008年10月). 「ヒトSNPデータベースのスクリーニングにより、A-to-I RNA編集の再コーディング部位が同定された」 . RNA . 14 (10): 2074– 2085. doi : 10.1261/rna.816908 . PMC 2553741. PMID 18772245 .  
11. Kuang Z, Yao S, Keizer DW, Wang CC, Bach LA, Forbes BE, 他 (2006年12月). 「インスリン様成長因子結合タンパク質-2（IGFBP-2）のC末端ドメインの構造、ダイナミクス、ヘパリン結合」. Journal of Molecular Biology . 364 (4): 690– 704. doi : 10.1016/j.jmb.2006.09.006 . PMID 17020769 . 
12. Levanon EY, Hallegger M, Kinar Y, Shemesh R, Djinovic-Carugo K, Rechavi G, et al. (2005). 「進化的に保存されたヒトにおけるアデノシンからイノシンへのRNA編集標的」 . Nucleic Acids Research . 33 (4): 1162– 1168. arXiv : q-bio/0502045 . Bibcode : 2005q.bio ..... 2045L . doi : 10.1093/nar/gki239 . PMC 549564. PMID 15731336 .  
13. 岸部 淳、山田 聡、岡田 雄三、佐藤 淳、伊藤 明、宮崎 功、他 (2000年5月). 「ヒト癌細胞ECV-304に索状構造を誘導する腫瘍由来接着因子/アンジオモジュリンへの結合におけるヘパラン硫酸の構造要件」 . The Journal of Biological Chemistry . 275 (20): 15321– 15329. doi : 10.1074/jbc.275.20.15321 . PMID 10809767 . 
14. Ahmed S, Yamamoto K, Sato Y, Ogawa T, Herrmann A, Hirai S, et al. (2003年10月). 「IGFBP関連タンパク質1（TAF/angiomodulin/mac25）のタンパク質分解による生理活性の調節」.生化学および生物理学的研究通信. 310 (2): 612– 618. doi : 10.1016/j.bbrc.2003.09.058 . PMID 14521955 . 
15. Agis-Balboa RC, Arcos-Diaz D, Wittnam J, Govindarajan N, Blom K, Burkhardt S, et al. (2011年8月). 「海馬インスリン-成長因子2経路は恐怖記憶の消去を制御する」 . The EMBO Journal . 30 (19): 4071– 4083. doi : 10.1038/emboj.2011.293 . PMC 3209781. PMID 21873981 .  
16. アグベメンヤ HY、アギス・バルボア RC、ブルクハルト S、デラール I、フィッシャー A (2014 年 2 月)。 「インスリン成長因子結合タンパク質 7 は、認知症を治療するための新しい標的です。」病気の神経生物学。62 : 135–143。土井: 10.1016/j.nbd.2013.09.011。PMID 24075854。S2CID 38244657。  
17. Hartner JC, Schmittwolf C, Kispert A, Müller AM, Higuchi M, Seeburg PH (2004年2月). 「RNA編集酵素ADAR1の欠損によるマウス胎児の肝崩壊」 . The Journal of Biological Chemistry . 279 (6): 4894– 4902. doi : 10.1074/jbc.M311347200 . PMID 14615479 . 
18. Wilson EM, Oh Y, Hwa V, Rosenfeld RG (2001年9月). 「IGF結合タンパク質関連タンパク質1と新規タンパク質である神経内分泌分化因子との相互作用は、前立腺癌細胞の神経内分泌分化を引き起こす」 . The Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism . 86 (9): 4504– 4511. doi : 10.1210/jcem.86.9.7845 . PMID 11549700 . 
19. Evdokimova V, Tognon CE, Benatar T, Yang W, Krutikov K, Pollak M, et al. (2012年12月). 「IGFBP7はIGF-1受容体に結合し、インスリン様成長因子によるその活性化を阻害する」. Science Signaling . 5 (255): ra92. doi : 10.1126/scisignal.2003184 . PMID 23250396. S2CID 24794913 .  

さらに読む

• Swisshelm K, Ryan K, Tsuchiya K, Sager R (1995年5月). 「老化ヒト乳腺上皮細胞におけるインスリン成長因子様結合タンパク質（mac25）の発現増強とレチノイン酸による発現誘導」 . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 92 (10): 4472– 4476. Bibcode : 1995PNAS...92.4472S . doi : 10.1073/ pnas.92.10.4472 . PMC  41966. PMID  7538673 .
• Oh Y, Nagalla SR, Yamanaka Y, Kim HS, Wilson E, Rosenfeld RG (1996年11月). 「インスリン様成長因子結合タンパク質（IGFBP）-7の合成と特性解析。組換えヒトmac25タンパク質はIGF-IおよびIGF-IIに特異的に結合する」 . The Journal of Biological Chemistry . 271 (48): 30322– 30325. doi : 10.1074/jbc.271.48.30322 . PMID  8939990 .
• Wilson EM, Oh Y, Rosenfeld RG (1997年4月). 「IGFBP-7抗体の作製と特性解析：ヒト体液およびHs578Tヒト乳がん培養上清における31kD IGFBP-7の同定」 . The Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism . 82 (4): 1301– 1303. doi : 10.1210/jc.82.4.1301 . PMID  9100611 .
• 関口 暢、梅田 文雄、正門 正治、小野 雄一、橋本 剛、縄田 秀一 (1997年10月). 「糖尿病および動脈硬化性ヒト冠動脈におけるプロスタサイクリン刺激因子（PSF）の免疫組織化学的研究」.糖尿病. 46 (10): 1627–1632 . doi : 10.2337/diabetes.46.10.1627 . PMID  9313760 .
• Yamanaka Y, Wilson EM, Rosenfeld RG, Oh Y (1997年12月). 「インスリン様成長因子結合タンパク質によるインスリン受容体活性化の阻害」 . The Journal of Biological Chemistry . 272 (49): 30729– 30734. doi : 10.1074/jbc.272.49.30729 . PMID  9388210 .
• Sato J, Hasegawa S, Akaogi K, Yasumitsu H, Yamada S, Sugahara K, et al. (1999年11月). 「細胞表面のヘパラン硫酸と相互作用するアンジオモジュリン（AGM/TAF/Mac25）の細胞結合部位の同定」. Journal of Cellular Biochemistry . 75 (2): 187– 195. doi : 10.1002/(SICI)1097-4644(19991101)75:2<187::AID-JCB1>3.0.CO;2-R . PMID  10502291 . S2CID  25296323 .
• Girard JP, Baekkevold ES, Yamanaka T, Haraldsen G, Brandtzaeg P, Amalric F (1999年12月). 「内皮細胞の不均一性：抑制サブトラクティブハイブリダイゼーションを特徴とするヒト高内皮細静脈の特殊化表現型」 .アメリカ病理学誌. 155 (6): 2043– 2055. doi : 10.1016/S0002-9440(10)65523 - X . PMC  1866921. PMID  10595934 .
• Degeorges A, Wang F, Frierson HF, Seth A, Sikes RA (2000年6月). 「正常ヒト組織におけるIGFBP-rP1の分布」. The Journal of Histochemistry and Cytochemistry . 48 (6): 747– 754. doi : 10.1177 / 002215540004800603 . PMID  10820148. S2CID  25403967 .
• Kato MV (2000年2月). 「アクチビン結合活性を有する分泌型腫瘍抑制因子mac25」 .分子医学. 6 (2): 126– 135. doi : 10.1007/BF03401780 . PMC  1949932. PMID  10859029 .
• Allen JT, Bloor CA, Kedia RK, Knight RA, Spiteri MA (2000年4月). 「ヒト肺における成長ホルモン放出因子、成長ホルモン、インスリン様成長因子-1およびその結合タンパク質の発現」. Neuropeptides . 34 (2): 98– 107. doi : 10.1054 / npep.2000.0802 . PMID  10985926. S2CID  27683573 .
• Wilson EM, Oh Y, Hwa V, Rosenfeld RG (2001年9月). 「IGF結合タンパク質関連タンパク質1と新規タンパク質である神経内分泌分化因子との相互作用は、前立腺癌細胞の神経内分泌分化を引き起こす」 . The Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism . 86 (9): 4504– 4511. doi : 10.1210/jcem.86.9.7845 . PMID  11549700 .
• Wilson HM, Birnbaum RS, Poot M, Quinn LS, Swisshelm K (2002年5月). 「インスリン様成長因子結合タンパク質関連タンパク質1は、老化様メカニズムを介してMCF-7乳がん細胞の増殖を阻害する」. Cell Growth & Differentiation . 13 (5): 205– 213. PMID  12065244 .
• 臼井 剛志、村井 剛志、田中 剛志、山口 功、長久保 大輔、李 CM、他 (2002年11月). 「リンパ組織における高内皮細静脈細胞におけるmac25/angiomodulin発現の特徴づけと活性化内皮細胞の誘導マーカーとしての同定」 .国際免疫学. 14 (11): 1273– 1282. doi : 10.1093/intimm/dxf102 . PMID  12407018 .
• Plymate SR, Haugk KH, Sprenger CC, Nelson PS, Tennant MK, Zhang Y, 他 (2003年2月). 「マンガンスーパーオキシドディスムターゼ（SOD-2）の増加は、Mac25/インスリン様成長因子結合タンパク質関連タンパク質-1による前立腺腫瘍抑制機構の一部である」. Oncogene . 22 ( 7): 1024– 1034. doi : 10.1038/sj.onc.1206210 . PMID  12592389. S2CID  8062437 .
• Domínguez F, Avila S, Cervero A, Martín J, Pellicer A, Castrillo JL, et al. (2003年4月). 「遺伝子発見のための複合アプローチにより、インスリン様成長因子結合タンパク質関連タンパク質1がヒト子宮内膜受容能に関与する新規遺伝子として同定された」 . The Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism . 88 (4): 1849– 1857. doi : 10.1210/jc.2002-020724 . PMID  12679483 .
• López-Bermejo A, Khosravi J, Corless CL, Krishna RG, Diamandi A, Bodani U, et al. (2003年7月). 「抗インスリン様成長因子結合タンパク質関連タンパク質1（IGFBP-rP1/MAC25）モノクローナル抗体の作製と免疫測定：ヒト血清中のIGFBP-rP1の定量、ならびにヒト体液および組織における分布」 . The Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism . 88 (7): 3401– 3408. doi : 10.1210/jc.2002-021315 . PMID  12843194 .
• 長久保 大輔、村井 孝文、田中 剛志、臼井 俊一、松本 誠、関口 憲一、他 (2003年7月). 「高内皮細静脈分泌タンパク質mac25/アンジオモジュリンは、ケモカインを含む複数の高内皮細静脈関連分子と相互作用する」 . Journal of Immunology . 171 (2): 553– 561. doi : 10.4049/jimmunol.171.2.553 . PMID  12847218 .

「 https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=IGFBP7&oldid=1301323452」より取得