EIF4B

EIF4B
利用可能な構造
PDBオーソログ検索: PDBe RCSB
識別子
エイリアスEIF4B、EIF-4B、PRO1843、真核生物翻訳開始因子4B
外部IDオミム：603928; MGI : 95304;ホモロジーン: 83162;ジーンカード：EIF4B; OMA :EIF4B - オルソログ
オルソログ
種人間ねずみ
エントレズ

1975

75705

アンサンブル

ENSG00000063046

ENSMUSG00000058655

ユニプロット

P23588

Q8BGD9

RefSeq (mRNA)

NM_001300821
NM_001417
NM_018507
NM_001330654

NM_145625

RefSeq（タンパク質）

NP_001287750
NP_001317583
NP_001408

NP_663600

場所（UCSC）12章: 53.01 – 53.04 Mb15章: 101.98 – 102.01 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
人間の表示/編集マウスの表示/編集

真核生物翻訳開始因子4Bは、ヒトではEIF4B遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5]

構造

EIF4Bは、 N末端付近に単一の折り畳まれたRNA認識モチーフ（RRM）を特徴とし、古典的なβαβββαβトポロジーを採用しています。このRRMはRNA結合を担いますが、RNAとの相互作用は比較的弱く、隣接するN末端およびC末端の延長によって高親和性結合が促進されます。RRMの下流約400アミノ酸を含むEIF4Bタンパク質の大部分は本質的に無秩序であり、本質的に無秩序な領域（IDR）を形成します。このIDRは安定した三次元構造をとらず、代わりに動的な相互作用、自己会合、そして特定の細胞条件下での大きなオリゴマーや生体分子凝縮体の形成を可能にします。IDR内のアルギニンリッチモチーフ（ARM）と一致する短いらせんセグメントは、RNA結合にさらに寄与します。[6] [7]

哺乳類のeIF4Bは二量体として作用し、他の研究では本質的に無秩序な領域（ IDR ）を介して高次オリゴマーも形成できることが示されている。[7]

関数

真核生物翻訳開始因子4B（EIF4B）は、真核細胞での効率的なキャップ依存性翻訳に不可欠なマルチドメインタンパク質です。構造的には、EIF4BはN末端付近に1つの折り畳まれたRNA認識モチーフ（RRM）を含んでいます。 [6] [8] [9]このRRMはRNA結合を担っていますが、単独ではRNAと比較的弱く相互作用します。高親和性結合は隣接するN末端およびC末端延長部によって促進されます。[6] [10] RRMの下流約400アミノ酸を含むEIF4Bタンパク質の大部分は本質的に無秩序であり、本質的に無秩序な領域（IDR）を形成します。[7]このIDRは安定した3次元構造をとらず、代わりに動的な相互作用、自己会合、および特定の細胞条件下での大きなオリゴマーと生体分子凝縮物の形成を可能にします。[7] IDR内の短いらせん構造は、アルギニンリッチモチーフ（ARM）と重なり、RNA結合にさらに寄与する。[7] IDRの柔軟で非常に動的な性質により、EIF4BはeIF4Aのヘリカーゼ活性の刺激や、翻訳開始機構の他の構成要素の組み立てのサポートなど、翻訳開始に不可欠な多様な分子相互作用を調整することができる。[11]

EIF4Bは、真核細胞におけるキャップ依存性翻訳開始過程において重要なタンパク質です。その主な機能は、DEADボックスRNAヘリカーゼであるeIF4Aのヘリカーゼ活性を増強することであり、mRNAの5'非翻訳領域（UTR）における二次構造の巻き戻しを刺激することで促進します[9]。[11] [12]この巻き戻し活性は、リボソームがmRNAをスキャンし、開始コドンを効率的に特定するために不可欠です。eIF4Bはまた、eIF3やeIF4Fなどの他の翻訳開始因子と相互作用することで足場として機能し、翻訳開始複合体の組み立てを促進します。[13]さらに、eIF4BのRNA結合能は、RNA認識モチーフ（RRM）とアルギニンリッチモチーフ（ARM）の両方を介して、リボソーム上のmRNAのリクルートと安定化を直接サポートし、タンパク質合成の効率的かつ正確な開始を保証します。[6] [10] eIF4Bの多面的な機能は、翻訳出力の制御と細胞条件へのタンパク質合成の適応に不可欠です。[14]

eIF4BはeIF4Aの酵素/RNAヘリカーゼ活性と相互作用して刺激し、RNAとATPの結合活性を高め、eIF3Aサブユニットを介してeIF3複合体に結合することが示されています。[15]この相互作用の結果、真核生物の小さなリボソームサブユニット（40S）がmRNAにリクルートされ、それが今度は伸長につながる後のステップの準備を整えます。

臨床的意義

eIF4Bは癌細胞で過剰発現しており、いくつかの研究ではeIF4Bが特定の種類の癌の治療における潜在的な治療標的であると指摘されている。[16]

参照

参考文献

  1. ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000063046 – Ensembl、2017年5月
  2. ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000058655 – Ensembl、2017年5月
  3. ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  4. ^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  5. ^ 「Entrez Gene: EIF4B 真核生物翻訳開始因子4B」。
  6. ^ abcd Fleming K, Ghuman J, Yuan X, Simpson P, Szendröi A, Matthews S, et al. (2003年8月). 「真核生物翻訳開始因子4BのRNA認識モチーフの溶液構造とRNA相互作用」.生化学. 42 (30): 8966– 8975. doi :10.1021/bi034506g. PM​​ID  12885229.
  7. ^ abcde Swain BC, Sarkis P, Ung V, Rousseau S, Fernandez L, Meltonyan A, et al. (2024-10-10). 「ヒトeIF4Bの不規則領域が動的な自己会合ランドスケープを編成する」. Nature Communications . 15 (1) 8766. Bibcode :2024NatCo..15.8766S. doi :10.1038/s41467-024-53136-1. ISSN  2041-1723. PMC 11464913. PMID 39384813  . 
  8. ^ 「真核生物翻訳開始因子4B、RNA認識モチーフ」InterPro . IPR033107.
  9. ^ 「真核生物翻訳開始因子4B（eIF-4B）および類似タンパク質に見られるRNA認識モチーフ（RRM）」InterPro.CD12402 .
  10. ^ ab Méthot N, Pause A, Hershey JW, Sonenberg N (1994年4月). 「翻訳開始因子eIF-4Bは、リボ核タンパク質コンセンサス配列とは異なる独立したRNA結合領域を含む」. Molecular and Cellular Biology . 14 (4): 2307– 2316. doi :10.1128/mcb.14.4.2307. PMC 358597. PMID  8139536 . 
  11. ^ ab Harms U, Andreou AZ, Gubaev A, Klostermeier D (2014年7月). 「eIF4B、eIF4G、およびRNAはeIF4Aのコンフォメーションサイクルを調節することで、翻訳開始におけるeIF4Aの活性を制御する」. Nucleic Acids Research . 42 (12): 7911–22 . doi :10.1093/nar/gku440. PMC 4081068. PMID  24848014 . 
  12. ^ Cheng S, Gallie DR (2006年8月). 「小麦真核生物開始因子4BはRNAとeIFiso4G、eIF4A、およびポリ(A)結合タンパク質の集合を組織化する」. The Journal of Biological Chemistry . 281 (34): 24351–64 . doi : 10.1074/jbc.M605404200 . PMID  16803875.
  13. ^ Shahbazian D, Roux PP, Mieulet V, Cohen MS, Raught B, Taunton J, et al. (2006年6月). 「mTOR/PI3KとMAPK経路はeIF4Bに収束し、そのリン酸化と活性を制御する」. The EMBO Journal . 25 (12): 2781– 2791. doi :10.1038/sj.emboj.7601166. PMC 1500846. PMID 16763566  . 
  14. ^ Shahbazian D, Parsyan A, Petroulakis E, Hershey J, Sonenberg N (2010年10月). 「eIF4Bは生存と増殖を制御し、プロトオンコゲンシグナル伝達経路によって制御される」. Cell Cycle . 9 (20): 4106–9 . doi :10.4161/cc.9.20.13630. PMC 3055195. PMID 20948310  . 
  15. ^ Merrick WC (2015年10月). 「eIF4F：回顧展」. The Journal of Biological Chemistry . 290 (40): 24091– 24099. doi : 10.1074/jbc.R115.675280 . PMC 4591800. PMID  26324716 . 
  16. ^ Chen K, Yang J, Li J, Wang X, Chen Y, Huang S, et al. (2016-02-03). 「eIF4BはAbl形質転換体における発癌性PimおよびPI3K/Akt/mTORシグナル伝達経路の収束標的であり、重要なエフェクターである」. Oncotarget . 7 (9): 10073– 10089. doi :10.18632/oncotarget.7164. ISSN  1949-2553. PMC 4891105. PMID 26848623  . 

さらに読む

  • van Heugten HA, Kasperaitis MA, Thomas AA, Voorma HO (1991年4月). 「真核生物開始因子（eIF）2は、eIF-4BおよびeIF-4Fによるキャップ認識を刺激するキャップ結合タンパク質であるという証拠」. Journal of Biological Chemistry . 266 (11): 7279– 7284. doi : 10.1016/S0021-9258(20)89641-0 . PMID  2016328.
  • Milburn SC, Hershey JW, Davies MV, Kelleher K, Kaufman RJ (1990年9月). 「真核生物開始因子4B cDNAのクローニングと発現：配列決定により共通のRNA認識モチーフが同定される」. The EMBO Journal . 9 (9): 2783– 2790. doi :10.1002/j.1460-2075.1990.tb07466.x. PMC  551988. PMID  2390971 .
  • Howe JG, Hershey JW (1984年5月). 「HeLa細胞由来の細胞骨格フレームワーク分画と翻訳開始因子およびリボソームの会合」. Cell . 37 (1): 85–93 . doi : 10.1016/0092-8674(84)90303-9 . PMID  6722878.
  • 丸山 憲治、菅野 誠 (1994年1月). 「オリゴキャッピング：真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡便法」.遺伝子. 138 ( 1–2 ): 171–174 . doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
  • Naranda T, Strong WB, Menaya J, Fabbri BJ, Hershey JW (1994年5月). 「開始因子eIF-4Bの2つの構造ドメインはRNAへの結合に関与している」. Journal of Biological Chemistry . 269 (20): 14465– 14472. doi : 10.1016/S0021-9258(17)36646-2 . PMID  8182051.
  • Méthot N, Song MS, Sonenberg N (1996年10月). 「アスパラギン酸、アルギニン、チロシン、グリシンを豊富に含む領域（DRYG）は、真核生物の転写開始因子4B（eIF4B）の自己会合およびeIF3との相互作用を媒介する」. Molecular and Cellular Biology . 16 (10): 5328– 5334. doi :10.1128/MCB.16.10.5328. PMC 231531.  PMID 8816444  .
  • 鈴木雄三、中川吉智、丸山健、須山明生、菅野誠一 (1997年10月). 「全長エンリッチドcDNAライブラリーおよび5'末端エンリッチドcDNAライブラリーの構築と特性解析」. Gene . 200 ( 1–2 ): 149–156 . doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID  9373149.
  • Richter NJ, Rogers GW, Hensold JO, Merrick WC (1999年12月). 「ヒト真核生物開始因子4Hのさらなる生化学的および速度論的特性解析」. Journal of Biological Chemistry . 274 (50): 35415– 35424. doi : 10.1074/jbc.274.50.35415 . PMID  10585411.
  • Bushell M, Wood W, Clemens MJ, Morley SJ (2000年2月). 「アポトーシスにおける真核生物タンパク質合成開始因子の完全性と関連性の変化」. European Journal of Biochemistry . 267 (4): 1083– 1091. doi : 10.1046/j.1432-1327.2000.01101.x . PMID  10672017.
  • Bushell M, Wood W, Carpenter G, Pain VM, Morley SJ, Clemens MJ (2001年6月). 「哺乳類タンパク質合成真核生物開始因子4BとポリA結合タンパク質との相互作用のカスパーゼおよびウイルスプロテアーゼによる切断による阻害」Journal of Biological Chemistry . 276 (26): 23922– 23928. doi : 10.1074/jbc.M100384200 . PMID  11274152.
  • Fleming K, Ghuman J, Yuan X, Simpson P, Szendröi A, Matthews S, et al. (2003年8月). 「真核生物翻訳開始因子4BのRNA認識モチーフの溶液構造とRNA相互作用」.生化学. 42 (30): 8966– 8975. doi :10.1021/bi034506g. PM​​ID  12885229.
  • ロート B、ペイレッティ F、ギングラス AC、リヴィングストン M、シャバジアン D、メイユール GL、他。 (2004 年 4 月)。 「真核生物の翻訳開始因子 4B Ser422 のリン酸化は S6 キナーゼによって調節される」。EMBO ジャーナル。23 (8): 1761 ～ 1769 年。土井:10.1038/sj.emboj.7600193。PMC  394247。PMID  15071500。
  • Doepker RC, Hsu WL, Saffran HA, Smiley JR (2004年5月). 「単純ヘルペスウイルスビリオンの宿主シャットオフタンパク質は翻訳開始因子eIF4BおよびeIF4Hによって刺激される」. Journal of Virology . 78 (9): 4684– 4699. doi :10.1128/JVI.78.9.4684-4699.2004. PMC  387725. PMID  15078951 .
  • Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, 他 (2004年8月). 「HeLa細胞核リン酸化タンパク質の大規模解析」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 101 (33): 12130– 12135. Bibcode :2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC  514446. PMID  15302935 .
  • 鈴木雄三、山下亮、城田正之、榊原雄三、千葉淳、水島-菅野淳、他 (2004年9月). 「ヒト遺伝子とマウス遺伝子の配列比較により、プロモーター領域に相同ブロック構造が認められる」. Genome Research . 14 (9): 1711– 1718. doi :10.1101/gr.2435604. PMC 515316.  PMID 15342556  .
  • Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, et al. (2006年11月). 「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、in vivo、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」. Cell . 127 (3): 635– 648. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID  17081983. S2CID  7827573.
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