ミトコンドリアリボソームタンパク質S12

MRPS12
利用可能な構造
PDBオーソログ検索: PDBe RCSB
識別子
エイリアスMRPS12、MPR-S12、MT-RPS12、RPMS12、RPS12、RPSM12、ミトコンドリアリボソームタンパク質S12
外部IDオミム:603021; MGI : 1346333;ホモロジーン: 6848;ジーンカード:MRPS12; OMA :MRPS12 - オルソログ
オーソログ
人間ねずみ
エントレズ
アンサンブル
ユニプロット
RefSeq (mRNA)

NM_033363
NM_021107
NM_033362

NM_011885
NM_001360250
NM_001360252
NM_001360254

RefSeq(タンパク質)

NP_066930
NP_203526
NP_203527

NP_036015
NP_001347179
NP_001347181
NP_001347183

場所(UCSC)19章: 38.93 – 38.93 Mb7章: 28.44 – 28.44 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
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28Sリボソームタンパク質S12は、ミトコンドリアにおいて、ヒトではMRPS12遺伝子によってコードされるタンパク質である[5] [6] [7]

哺乳類のミトコンドリアリボソームタンパク質は核遺伝子によってコードされており、ミトコンドリア内でのタンパク質合成を助ける。ミトコンドリアリボソーム(ミトリボソーム)は小さな28Sサブユニットと大きな39Sサブユニットからなる。原核生物のリボソームと比較して、ミトリボソームのタンパク質rRNA構成は75%と推定され、この比率は原核生物のリボソームで逆転している。哺乳類のミトリボソームと原核生物のリボソームのもう1つの違いは、後者には5S rRNAが含まれることである。異なる種の間では、ミトリボソームを構成するタンパク質の配列は大きく異なり、時には生化学的特性が異なるため、配列相同性による容易な認識を妨げている。この遺伝子は、リボソームタンパク質S12Pファミリーに属する28Sサブユニットタンパク質をコードしている。コードされているタンパク質はリボソーム小サブユニットの重要な構成要素であり、デコードの忠実度とアミノグリコシド系抗生物質に対する感受性を制御している。ミトコンドリアセリル-tRNA合成酵素遺伝子はこの遺伝子の上流に隣接しており、両遺伝子は常染色体優性難聴遺伝子(DFNA4)の候補遺伝子である可能性がある。この遺伝子には5' UTRが異なるスプライスバリアントが見つかっており、3つのバリアントはすべて同じタンパク質をコードしている。[7]

参考文献

  1. ^ abc ENSG00000128626 GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000283018, ENSG00000128626 – Ensembl、2017年5月
  2. ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000045948 – Ensembl、2017年5月
  3. ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター
  4. ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター
  5. ^ Shah ZH, Migliosi V, Miller SC, Wang A, Friedman TB, Jacobs HT (1998年6月). 「ミトコンドリア遺伝子発現装置の推定構成要素を規定する3つのヒト核遺伝子(RPSM12、TUFM、およびAFG3L1)の染色体位置」Genomics . 48 (3): 384–8 . doi :10.1006/geno.1997.5166. PMID  9545647.
  6. ^ Johnson DF, Hamon M, Fischel-Ghodsian N (1998年12月). 「ヒトミトコンドリアリボソームS12遺伝子の特性解析」. Genomics . 52 (3): 363–8 . doi :10.1006/geno.1998.5448. PMID  9790755.
  7. ^ ab 「Entrez Gene: MRPS12 ミトコンドリアリボソームタンパク質 S12」。

さらに読む

  • Shah ZH, O'Dell KM, Miller SC, et al. (1998). 「ミトリボソームタンパク質S12の核遺伝子における後生動物」. Gene . 204 ( 1– 2): 55– 62. doi :10.1016/S0378-1119(97)00521-0. PMID  9434165.
  • Mariottini P, Shah ZH, Toivonen JM, et al. (1999). 「ヒト細胞におけるミトリボソームタンパク質S12遺伝子の発現は、転写、RNAスプライシング、翻訳のレベルで制御されている」J. Biol. Chem . 274 (45): 31853–62 . doi : 10.1074/jbc.274.45.31853 . PMID  10542210.
  • Cavdar Koc E, Burkhart W, Blackburn K, et al. (2001). 「哺乳類ミトコンドリアリボソームの小サブユニット.存在するリボソームタンパク質群の同定」(PDF) . J. Biol. Chem . 276 (22): 19363–74 . doi : 10.1074/jbc.M100727200 . PMID  11279123. S2CID  26254238.
  • 鈴木 剛志、寺崎 正之、竹本-堀 千恵子、他 (2001). 「哺乳類ミトコンドリアリボソームのプロテオーム解析.28S小サブユニットのタンパク質成分の同定」. J. Biol. Chem . 276 (35): 33181–95 . doi : 10.1074/jbc.M103236200 . PMID  11402041.
  • 塙持 暢、鈴木 剛、上地 剛、他 (2001). 「ヒトミトコンドリアリボソームタンパク質遺伝子:54遺伝子の染色体マッピングとヒト疾患への影響」. Genomics . 77 ( 1–2 ): 65–70 . doi :10.1006/geno.2001.6622. PMID  11543634.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
  • Zhang Z, Gerstein M (2003). 「ヒトゲノムにおける100種類以上のミトコンドリアリボソームタンパク質擬似遺伝子の同定と特性解析」. Genomics . 81 (5): 468–80 . doi :10.1016/S0888-7543(03)00004-1. PMID  12706105.
  • Cui YP, Wang JB, Zhang XY, et al. (2003). 「酵母ツーハイブリッドシステムを用いたECRG2関連タンパク質の同定とECRG2遺伝子との相互作用の可能性」World J. Gastroenterol . 9 (9): 1892–6 . doi : 10.3748/wjg.v9.i9.1892 . PMC  4656638. PMID  12970870 .
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大:哺乳類遺伝子コレクション(MGC)」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928. PMID 15489334  .
  • Stelzl U, Worm U, Lalowski M, et al. (2005). 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワーク:プロテオーム注釈のためのリソース」. Cell . 122 (6): 957–68 . doi :10.1016/j.cell.2005.08.029. hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID  16169070. S2CID  8235923.
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