ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
MRPS17 利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス MRPS17 、HSPC011、MRP-S17、RPMS17、S17mt、ミトコンドリアリボソームタンパク質S17 外部ID オミム :611980; MGI : 1913508; ホモロジーン : 9320; ジーンカード :MRPS17; OMA :MRPS17 - オルソログ RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) 上位の表現 腓腹筋 太ももの筋肉 骨格筋組織 左心室 生殖腺 横行結腸粘膜 ランゲルハンス島 前頭前皮質 背外側前頭前皮質 肝臓の右葉
上位の表現 心室中隔 右腎臓 卵黄嚢 心内膜クッション 胚 近位尿細管 神経管 肝臓の左葉 下顎突出 胚
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バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 細胞成分 ミトコンドリア内膜 リボソーム 細胞内解剖学的構造 ミトコンドリア ミトコンドリア小リボソームサブユニット 生物学的プロセス ミトコンドリアの翻訳伸長 ミトコンドリアの翻訳終結 タンパク質生合成 ミトコンドリア翻訳 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) RefSeq(タンパク質) NP_079726 NP_001343883 NP_001343884 NP_001343885 NP_001343886 NP_001343887 NP_001343888
場所(UCSC) 7章: 55.95 – 55.96 Mb 5 章: 129.72 – 129.72 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
ミトコンドリアの28Sリボソームタンパク質S17は、 ヒトでは MRPS17 遺伝子によってコードされている タンパク質 である 。 [5] [6]
哺乳類の ミトコンドリアリボソームタンパク質は 核遺伝子 によってコードされており、 ミトコンドリア 内での タンパク質合成 を助ける 。ミトコンドリアリボソーム(ミトリボソーム)は小さな 28Sサブユニットと大きな39Sサブユニットからなる。原核生物のリボソームと比較して、 タンパク質 と rRNA の構成比は75%と推定され 、この比率は原核生物のリボソームで逆転している。哺乳類のミトリボソームと原核生物のリボソームのもう1つの違いは、後者には 5S rRNAが 含まれていることである。異なる種の間では、ミトリボソームを構成するタンパク質の配列は大きく異なり、時には生化学的特性が異なるため、 配列相同性による容易な認識を妨げている。この遺伝子は 、リボソームタンパク質 S17Pファミリーに属する28Sサブユニットタンパク質をコードしている 。コードされているタンパク質は、ヒトのミトコンドリアと原核生物のリボソームタンパク質間で中程度に保存されている。この遺伝子に対応する 擬似遺伝子 は染色体1p、3p、6q、14p、18q、Xqに存在する。 [6]
参考文献 ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000239789 – Ensembl 、2017年5月 ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000034211 – Ensembl 、2017年5月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ Cavdar Koc E, Burkhart W, Blackburn K, Moseley A, Spremulli LL (2001年5月). 「哺乳類ミトコンドリアリボソームの小サブユニット。存在するリボソームタンパク質の完全な同定」. J Biol Chem . 276 (22): 19363–74 . CiteSeerX 10.1.1.501.8919 . doi : 10.1074/jbc.M100727200 . PMID 11279123. ^ ab 「Entrez Gene: MRPS17 ミトコンドリアリボソームタンパク質 S17」。
さらに読む Mao M, Fu G, Wu JS, et al. (1998). 「発現配列タグと効率的な完全長cDNAクローニングによるヒトCD34+造血幹/前駆細胞で発現する遺伝子の同定」 Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 95 (14): 8175–80 . Bibcode :1998PNAS...95.8175M. doi : 10.1073/pnas.95.14.8175 . PMC 20949. PMID 9653160. Zhang QH, Ye M, Wu XY, et al. (2001). 「CD34陽性造血幹/前駆細胞で発現する300個の未解明遺伝子に対するオープンリーディングフレームcDNAのクローニングと機能解析」 Genome Res . 10 (10): 1546–60 . doi :10.1101/gr.140200. PMC 310934 . PMID 11042152. 鈴木 剛志、寺崎 正之、竹本-堀 千恵子、他 (2001). 「哺乳類ミトコンドリアリボソームのプロテオーム解析.28S小サブユニットのタンパク質成分の同定」. J. Biol. Chem . 276 (35): 33181–95 . doi : 10.1074/jbc.M103236200 . PMID 11402041. 塙持 暢、鈴木 剛、上地 剛、他 (2001). 「ヒトミトコンドリアリボソームタンパク質遺伝子:54遺伝子の染色体マッピングとヒト疾患への影響」. Genomics . 77 ( 1–2 ): 65–70 . doi :10.1006/geno.2001.6622. PMID 11543634. Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 . Zhang Z, Gerstein M (2003). 「ヒトゲノムにおける100種類以上のミトコンドリアリボソームタンパク質擬似遺伝子の同定と特性解析」. Genomics . 81 (5): 468–80 . doi :10.1016/S0888-7543(03)00004-1. PMID 12706105. Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクト:哺乳類遺伝子コレクション(MGC)の現状、品質、そして拡大」 Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 . Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, et al. (2006). 「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、in vivo、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」. Cell . 127 (3): 635–48 . doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573.