ミトコンドリアリボソームタンパク質S35

MRPS35
利用可能な構造
PDB	オーソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	3J9M
識別子
エイリアス	MRPS35、MDS023、MRP-S28、MRPS28、HDCMD11P、ミトコンドリアリボソームタンパク質S35
外部ID	オミム：611995; MGI : 2385255;ホモロジーン：11048;ジーンカード：MRPS35; OMA :MRPS35 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
キリスト	12番染色体（ヒト）
終わり	27,756,295 bp
遺伝子の位置（マウス）
キリスト	6番染色体（マウス）
終わり	146,975,489 bp
RNA発現パターン
	上位の表現
	直腸; ; 横行結腸粘膜; ; アキレス腱; ; 前脛骨筋; ; 腓腹筋; ; 回腸粘膜; ; 三角筋; ; 腹直筋の骨格筋組織; ; 右副腎; ; 右副腎皮質;
	上位の表現
	心室中隔; ; 右腎臓; ; 胚; ; 胚; ; 右心室; ; 心室の心筋; ; 心室帯; ; 近位尿細管; ; 胚葉上層; ; 太ももの筋肉;
	より多くの参照表現データ
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遺伝子オントロジー
分子機能	リボソームの構造構成要素; RNA結合;
細胞成分	ミトコンドリア内膜; リボソーム; ミトコンドリア小リボソームサブユニット; ミトコンドリア;
生物学的プロセス	ミトコンドリアの翻訳伸長; ミトコンドリアの翻訳終結; ミトコンドリア翻訳;
	出典：Amigo / QuickGO
オーソログ
	60488
	232536
	ENSG00000061794
	ENSMUSG00000040112
	P82673
	Q8BJZ4
	NM_021821 ; NM_001190864
	NM_145573
	NP_001177793 ; NP_068593
	NP_663548
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

ミトコンドリアの28Sリボソームタンパク質S35は、ヒトではMRPS35遺伝子によってコードされているタンパク質である。^[5]^[6]

哺乳類ミトコンドリアリボソームタンパク質は核遺伝子によってコードされており、ミトコンドリア内でのタンパク質合成を助ける。ミトコンドリアリボソーム（ミトリボソーム）は、小さな28Sサブユニットと大きな39Sサブユニットからなる。ミトコンドリアリボソームのタンパク質とrRNAの比率は、原核生物リボソームの約75%と推定されるが、原核生物リボソームではこの比率が逆転している。哺乳類ミトリボソームと原核生物リボソームのもう一つの違いは、後者が5S rRNAを含むことである。種によって、ミトリボソームを構成するタンパク質の配列は大きく異なり、時には生化学的性質も異なるため、配列相同性による容易な認識が妨げられている。この遺伝子は、文献において紛らわしい命名法が用いられてきた28Sサブユニットタンパク質をコードしている。この遺伝子に対応する擬遺伝子は、染色体3p、5q、および10qに存在する。^[6]

参考文献

^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000061794 – Ensembl、2017年5月
^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000040112 – Ensembl、2017年5月
^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
^ Cavdar Koc E, Burkhart W, Blackburn K, Moseley A, Spremulli LL (2001年5月). 「哺乳類ミトコンドリアリボソームの小サブユニット。存在するリボソームタンパク質の完全な同定」. J Biol Chem . 276 (22): 19363–74 . doi : 10.1074/jbc.M100727200 . PMID 11279123.
^ ab 「Entrez Gene: MRPS35 ミトコンドリアリボソームタンパク質 S35」。

さらに読む

大月剛志、太田剛志、西川剛志、他 (2007). 「シグナル配列とキーワードトラップを用いたin silicoによる、オリゴキャップcDNAライブラリーからの分泌タンパク質または膜タンパク質をコードする全長ヒトcDNAの選択」DNA Res . 12 (2): 117–26 . doi : 10.1093/dnares/12.2.117 . PMID 16303743.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大：哺乳類遺伝子コレクション（MGC）」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
石口浩、泉浩、鳥越剛、他 (2004). 「ZNF143はDNA損傷に応答して遺伝子発現を活性化し、シスプラチン修飾DNAに結合する」. Int. J. Cancer . 111 (6): 900–9 . doi :10.1002/ijc.20358. PMID 15300802. S2CID 37308382.
Zhang Z, Gerstein M (2003). 「ヒトゲノムにおける100種類以上のミトコンドリアリボソームタンパク質擬似遺伝子の同定と特性解析」. Genomics . 81 (5): 468–80 . doi :10.1016/S0888-7543(03)00004-1. PMID 12706105.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
塙持暢、鈴木剛、上地剛、他 (2001). 「ヒトミトコンドリアリボソームタンパク質遺伝子：54遺伝子の染色体マッピングとヒト疾患への影響」. Genomics . 77 ( 1–2 ): 65–70 . doi :10.1006/geno.2001.6622. PMID 11543634.
Koc EC, Burkhart W, Blackburn K, et al. (2001). 「プロテオミクスアプローチを用いた哺乳類ミトコンドリアリボソーム小サブユニット由来の4つのタンパク質の同定」. Protein Sci . 10 (3): 471–81 . doi :10.1110/ps.35301. PMC 2374141. PMID 11344316 .

外部リンク

PDBe-KBの UniProt : P82673 (28S リボソームタンパク質 S35、ミトコンドリア)についてPDBで入手可能なすべての構造情報の概要。

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[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000061794 – Ensembl、2017年5月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000040112 – Ensembl、2017年5月

[3] 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[4] 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[pmid11279123-5] Cavdar Koc E, Burkhart W, Blackburn K, Moseley A, Spremulli LL (2001年5月). 「哺乳類ミトコンドリアリボソームの小サブユニット。存在するリボソームタンパク質の完全な同定」. J Biol Chem . 276 (22): 19363–74 . doi : 10.1074/jbc.M100727200 . PMID 11279123.

[entrez-6] 「Entrez Gene: MRPS35 ミトコンドリアリボソームタンパク質 S35」。