ヒトに存在するタンパク質
RPL9 利用可能な構造 PDB オーソログ検索： PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2CQL、4UG0、4V6X、5AJ0、3J92、4UJC、3J7P、4UJE、3J7Q、3J7R、4D67、4UJD、4V5Z、4D5Y、3J7O
識別子 別名 RPL9 、L9、NPC-A-16、リボソームタンパク質L9 外部ID OMIM : 603686; MGI : 1298373; HomoloGene : 90855; GeneCards : RPL9; OMA : RPL9 - オーソログ 遺伝子の位置（ マウス ） 染色体 5番染色体（マウス） [2] バンド 5|5 C3.1 開始 65,545,707 bp [2] 終了 65,548,787 bp [2]
RNA発現 パターン Bgee ヒト マウス （相同遺伝子） 最もよく発現している 左卵巣 右卵巣 胃粘膜 アキレス腱 右卵管 神経節隆起 乳腺 脳梁 鼻粘膜の嗅覚領域 胆嚢
最もよく発現している 海馬歯状回顆粒細胞 脳室帯 胚盤胞 胚 胚 桑実胚 唇 上前頭回 一次視覚野 精母細胞
その他の参考発現データ
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能 rRNA結合 タンパク質結合 RNA結合 リボソームの構造構成要素 細胞成分 細胞質 リボソーム 膜 接着斑 細胞内解剖学的構造 細胞質大リボソームサブユニット 核 細胞外マトリックス 生物学的プロセス 細胞質翻訳 タンパク質生合成 ウイルス転写 SRP依存性共翻訳タンパク質の膜への標的化 翻訳開始 核転写されたmRNAの分解過程、ナンセンス変異を介した分解 rRNA処理 出典：Amigo / QuickGO
ウィキデータ
60Sリボソームタンパク質L9 は、 ヒトでは RPL9 遺伝子によってコードされる タンパク質 である。 [5] [6] [7]
リボソームは タンパク質合成を 触媒する 細胞小 器官 であり、小さな 40S サブユニットと大きな 60S サブユニットから構成されています。これらのサブユニットは、4種類の RNA と約80種類の構造的に異なるタンパク質で構成されています。この遺伝子は、 60Sサブユニットの構成要素である リボソームタンパク質 をコードしています。このタンパク質はリボソームタンパク質のL6Pファミリーに属し、 細胞質 に局在しています。リボソームタンパク質をコードする遺伝子に典型的に見られるように、この遺伝子には複数の処理済み 擬遺伝子が ゲノム中に散在しています。この遺伝子には、同じタンパク質をコードする2つの 選択的スプライシング 転写変異体が見つかっています。 [7]
参考文献 ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000163682 – Ensembl 、2017年5月 ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000047215 – Ensembl 、2017年5月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ 「マウスPubMedリファレンス：」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ Mazuruk K, Schoen TJ, Chader GJ, Iwata T, Rodriguez IR (1996年4月). 「ヒトリボソームタンパク質L9遺伝子の構造的構成と染色体局在」. Biochim Biophys Acta . 1305 (3): 151– 62. doi :10.1016/0167-4781(95)00201-4. PMID 8597601. ^ 堀 N、村川 K、的場 R、福島 A、大久保 K、松原 K (1993 年 11 月)。 「新しいヒトリボソームタンパク質配列、ラットL9の相同体」。 核酸 研究 21 (18): 4395. 土井 :10.1093/nar/21.18.4395。 PMC 310081 。 PMID 8415001。 ^ ab 「Entrez Gene: RPL9 リボソームタンパク質 L9」。
さらに詳しい情報 Wool IG, Chan YL, Glück A (1996). 「哺乳類リボソームタンパク質の構造と進化」. Biochem. Cell Biol . 73 ( 11–12 ): 933–47 . doi :10.1139/o95-101. PMID 8722009 Kenmochi N, Kawaguchi T, Rozen S, et al. (1998). 「ヒトリボソームタンパク質遺伝子75種の地図」 Genome Res . 8 (5): 509–23 . doi : 10.1101/gr.8.5.509 . PMID 9582194. Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, et al. (2002). 「ヒト核小体の指向性プロテオーム解析」. Curr. Biol . 12 (1): 1– 11. Bibcode :2002CBio...12....1A. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . PMID 11790298. S2CID 14132033. Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 . Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大：哺乳類遺伝子コレクション（MGC）」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 . Andersen JS, Lam YW, Leung AK, et al. (2005). 「核小体プロテオームダイナミクス」. Nature . 433 (7021): 77– 83. Bibcode :2005Natur.433...77A. doi :10.1038/nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740. Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップの構築に向けて」 Nature . 437 (7062): 1173–8 . Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026. Oh JH, Yang JO, Hahn Y, et al. (2006). 「ヒト胃癌のトランスクリプトーム解析」. Mamm. Genome . 16 (12): 942–54 . doi :10.1007/s00335-005-0075-2. PMID 16341674. S2CID 69278.
外部リンク PDBe-KBは、ヒト60Sリボソームタンパク質L9のPDBに登録されているすべての構造情報の概要を提供します
