9番染色体

9番染色体
Gバンド染色後のヒト9番染色体ペア：
1つは母親由来、もう1つは父親由来

ヒト男性核型における9番染色体対
特徴
長さ（bp）150,617,247 bp
（CHM13）
遺伝子の数739（CCDS）[1]
型常染色体
セントロメアの位置亜メタセントリック[2]
(43.0 Mbp [3] )
完全な遺伝子リスト
CCDS遺伝子リスト
HGNC遺伝子リスト
UniProt遺伝子リスト
NCBI遺伝子リスト
外部マップビューア
Ensembl9番染色体
Entrez9番染色体
NCBI9番染色体
UCSC9番染色体
全DNA配列
RefSeqNC_000009 ( FASTA )
ジェンバンクCM000671 ( FASTA )

9番染色体は、ヒトの23対の染色体のうちの1つです。ヒトは通常、他のすべての染色体と同様に、この染色体を2本持っています。9番染色体は約1億3800万塩基対の核酸（DNAの構成要素）から成り、細胞内の全DNAの4.0～4.5%を占めています。

遺伝子

遺伝子数

これらはヒト9番染色体の遺伝子数の推定値の一部です。研究者はゲノムアノテーションに異なるアプローチを使用しているため、各染色体上の遺伝子数の予測は異なります（技術的な詳細については、遺伝子予測を参照してください）。様々なプロジェクトの中で、共同コンセンサスコーディングシーケンスプロジェクト（CCDS）は非常に保守的な戦略を採用しています。そのため、CCDSの遺伝子数予測は、ヒトのタンパク質コード遺伝子の総数の下限を表しています。[4]

推定タンパク質コード遺伝子非コードRNA遺伝子偽遺伝子出典発売日
CCDS739——[1]2016年9月8日
HGNC749246590[5]2017年5月12日
Ensembl775788663[6]2017年3月29日
UniProt812——[7]2018年2月28日
NCBI822830738[8] [9] [10]2017年5月19日

遺伝子リスト

以下は、ヒトの第 9 染色体上の遺伝子の部分的なリストです。完全なリストについては、右側の情報ボックスのリンクを参照してください。

ABO血液型を決定するABO遺伝子は、この染色体の長腕に位置しています。（位置：9q34.2）
  • ABO：ABO組織血液型糖転移酵素
  • ACTL7A :アクチン様タンパク質7Aをコードするタンパク質
  • ADAMTS13 : トロンボスポンジン 1 型モチーフを持つ ADAM メタロペプチダーゼ、13
  • AIF1L：同種移植炎症因子1様
  • ALAD : アミノレブリン酸、デルタ、デヒドラターゼ
  • ALS4：筋萎縮性側索硬化症4
  • ANGPTL2：アンジオポエチン関連タンパク質2
  • ASS：アルギニノコハク酸合成酵素
  • BANCR : タンパク質をコードするBRAF活性化非タンパク質コードRNA
  • BNC2：ジンクフィンガータンパク質バソヌクリン-2
  • C9orf64：9番染色体のオープンリーディングフレーム64
  • C9orf78 : コード化タンパク質未解析タンパク質 C9orf78
  • SHOC1 : キアズマ1の不足
  • C9orf25 : 9番染色体のオープンリーディングフレーム25をコードするタンパク質
  • C9orf43 : 9番染色体のオープンリーディングフレーム43をコードするタンパク質
  • C9orf135 : 9番染色体のオープンリーディングフレーム135をコードするタンパク質
  • C9orf152：9番染色体のオープンリーディングフレーム152
  • C9orf156 : 9番染色体のオープンリーディングフレーム156をコードするタンパク質
  • CAAP1：カスパーゼ活性およびアポトーシス阻害因子1
  • CARD19：カスパーゼリクルートメントドメインファミリーメンバー19
  • CBWD1：COBWドメイン含有タンパク質1
  • CCDC180 : コイルドコイルドメイン含有タンパク質180
  • CCL21：ケモカイン（CCモチーフ）リガンド21、SCYA21
  • CCL27：ケモカイン（CCモチーフ）リガンド27、SCYA27
  • CFAP157：繊毛および鞭毛関連タンパク質157
  • CHMP5：荷電多小胞体タンパク質5
  • CNTLN : セントライン
  • CDKN2BAS : CDKN2BアンチセンスRNA 1またはINK4遺伝子座のアンチセンス非コードRNA（ANRIL）
  • COL5A1：コラーゲン、V型、アルファ1
  • DDX31：DEADボックスポリペプチド31
  • DENND1A : DENN ドメイン含有タンパク質 1A
  • ENG : エンドグリン (オスラー・レンドゥ・ウェーバー症候群 1)
  • ENTPD2 :エクトヌクレオシド三リン酸ジホスホヒドロラーゼ2をコードする酵素
  • EQTN：エクアトリン
  • FAM73B : 配列類似性73のメンバーBを持つファミリー
  • FAM120A : 配列類似度120のメンバーAを持つファミリー
  • FAM122a :配列類似性122Aを持つタンパク質ファミリーをコードする
  • FBP1：フルクトース-1,6-ビスホスファターゼ1
  • FIBCD1 : 1を含むフィブリノーゲンCドメインをコードするタンパク質
  • FOCAD : フォカドヘシン
  • FXN：フラタキシン
  • GALT：ガラクトース-1-リン酸ウリジリルトランスフェラーゼ
  • GAS1：成長停止特異的タンパク質1
  • GCNT1：グルコサミニル（N-アセチル）トランスフェラーゼ1
  • GLE1L：核孔タンパク質GLE1
  • GPR107：Gタンパク質共役受容体107
  • GRHPR：グリオキシル酸レダクターゼ/ヒドロキシピルビン酸レダクターゼ
  • GSN：細胞質および血漿ゲルゾリン
  • HAUS6 : HAUS オーグミン様複合サブユニット 6
  • HEMGN : ヘモゲンタンパク質をコードする
  • IFN1@ : インターフェロン、タイプ1、クラスター
  • IKBKAP：B細胞におけるκ軽鎖ポリペプチド遺伝子エンハンサーの阻害剤、キナーゼ複合体関連タンパク質
  • INSL6：インスリン様6
  • ISCA1：鉄硫黄クラスターアセンブリ1ホモログ、ミトコンドリア
  • KIAA1958 : タンパク質 KIAA1958
  • KYAT1：キヌレニンアミノトランスフェラーゼ1
  • LINGO2：ロイシンリッチリピートとIgドメインを含む2
  • LOC101928193 : タンパク質 LOC101928193 をコードする
  • MGC50722 : タンパク質 MGC50722、未分類タンパク質 LOC399693
  • MIR181A2HG : MIR181A2宿主遺伝子をコードするタンパク質
  • MIR7-1：マイクロRNA 7-1
  • MSMP：前立腺関連マイクロセミノプロテインをコードするタンパク質
  • MTAP：S-メチル-5'-チオアデノシンホスホリラーゼ
  • NAA35 : N(α)-アセチルトランスフェラーゼ35をコードするタンパク質、NatC補助サブユニット
  • NANS：N-アセチルノイラミン酸合成酵素
  • NINJ1 : ニンジュリン-1
  • NOL6：核小体タンパク質6
  • NUDT2：ヌディックス加水分解酵素2
  • OBP2B : 嗅覚結合タンパク質2Bをコードするタンパク質
  • OLFM1：オルファクトメジン1
  • PHF2：PHDフィンガータンパク質2
  • PHPT1：ホスホヒスチジンホスファターゼ1
  • PIP5K1B：ホスファチジルイノシトール-4-リン酸5-キナーゼ1型ベータ
  • PLAA : ホスホリパーゼ A-2 活性化タンパク質
  • PMPCA：ミトコンドリアプロセシングαサブユニット
  • PRUNE2：タンパク質プルーンホモログ2
  • PTCH1：タンパク質パッチ1膜受容体タンパク質
  • RABGAP1：RAB GTPase活性化タンパク質1
  • REXO4：RNAエキソヌクレアーゼ4
  • RNF183 :リングフィンガータンパク質183をコードするタンパク質
  • SARDH：ミトコンドリアサルコシン脱水素酵素
  • SIT1：シグナル伝達閾値を調節する膜貫通アダプター1
  • SLC25A25-AS1 : SLC25A25アンチセンスRNA 1をコードするタンパク質
  • SNORD24 : 核小体RNAをコードするタンパク質、C/Dボックス24
  • SPAG8：精子関連抗原8
  • SPIN1 : スピンドリン1
  • ST6GALNAC4 : ST6 (α-N-アセチルノイラミニル-2,3-β-ガラクトシル-1,3)-N-アセチルガラクトサミニド α-2,6-シアリルトランスフェラーゼ 4 をコードする酵素。シアリルトランスフェラーゼ 3C (SIAT3-C) またはシアリルトランスフェラーゼ 7D (SIAT7-D) としても知られる。
  • ST6GALNAC6 : ST6 N-アセチルガラクトサミニドα-2,6-シアリルトランスフェラーゼ6
  • STOML2：ストマチン様タンパク質2
  • STRBP : 精子細胞核周囲 RNA 結合タンパク質
  • TEX10 : 精巣発現 10
  • TGFBR1：トランスフォーミング成長因子β受容体I型
  • TMC1：膜貫通チャネル様タンパク質1
  • TMEM215 :膜貫通タンパク質215をコードするタンパク質
  • TMEM268：膜貫通タンパク質268
  • TOR2A :タンパク質Torsin-2Aをコードする
  • TSC1：結節性硬化症複合体1
  • TTC39B：テトラトリコペプチドリピートタンパク質39B
  • UBAC1：ユビキチン関連ドメイン含有タンパク質1
  • UBAP1：ユビキチン関連タンパク質1
  • UBAP2：ユビキチン関連タンパク質2
  • ZBTB43 : ジンクフィンガーとBTBドメイン43を含む
  • ZCCHC6 : ジンクフィンガー、6を含むCCHCドメイン
  • ZDHHC21 : 21を含むジンクフィンガーDHHC型
  • ZNF79：ジンクフィンガータンパク質79
  • ZNF367 : タンパク質ジンクフィンガー367をコードする
  • ZNF510：ジンクフィンガータンパク質510

疾患と障害

以下の疾患は、9番染色体上の遺伝子に関連する疾患の一部です

細胞遺伝学的バンド

ヒト9番染色体のGバンド表意文字
解像度850bphsのヒト染色体9番のGバンド[15]
クロノスアーム[16]バンド[17]ISCN
スタート[18]		ISCN
停止[18]		塩基対
開始		塩基対
停止		染色[19]密度
9p24.301271220万グネグ
9p24.21272682,200,0014,600,000gpos25
9p24.12684514,600,0019,000,000グネグ
9p234516779,000,00114,200,000gpos75
9p22.367784614,200,00116,600,000グネグ
9p22.284698716,600,00118,500,000gpos25
9p22.1987108518,500,00119,900,000グネグ
9p21.31085129719,900,00125,600,000gpos100
9p21.21297139525,600,00128,000,000グネグ
9p21.11395162128,000,00133,200,000gpos100
9p13.31621191733,200,00136,300,000グネグ
9p13.21917203036,300,00137,900,000gpos25
9p13.12030217137,900,00139,000,000グネグ
9p122171231239,000,00140,000,000gpos50
9p11.22312252340,000,00142,200,000グネグ
9p11.12523265042,200,00143,000,000アセン
9q112650287643,000,00145,500,000アセン
9q122876346845,500,00161,500,000gvar
9q133468360961,500,00165,000,000グネグ
9q21.113609379265,000,00169,300,000gpos25
9q21.123792387669,300,00171,300,000グネグ
9q21.133876406071,300,00176,600,000gpos50
9q21.24060422976,600,00178,500,000グネグ
9q21.314229444078,500,00181,500,000gpos50
9q21.324440463881,500,00184,300,000グネグ
9q21.334638483584,300,00187,800,000gpos50
9q22.14835507487,800,00189,200,000グネグ
9q22.25074517389,200,00191,200,000gpos25
9q22.315173531491,200,00193,900,000グネグ
9q22.325314545593,900,00196,500,000gpos25
9q22.335455563896,500,00199,800,000グネグ
9q31.15638589299,800,001105,400,000gpos100
9q31.258926005105,400,001108,500,000グネグ
9q31.3600561461億850万1億1210万gpos25
9q3261466456112,100,001114,900,000グネグ
9q33.164566681114,900,0011億1980万gpos75
9q33.2668168221億1980万11億2,310万グネグ
9q33.3682269491億2,310万1億2,750万gpos25
9q34.11694972171億2750万1億3060万グネグ
9q34.12721773021億3060万1億3110万gpos25
9q34.13730274431億3,110万1億3,310万グネグ
9q34.2744375551億3,310万1億3,450万gpos25
9q34.3755579501億3,450万1億3,839万4,717グネグ

参考文献

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ウィキメディア・コモンズには、ヒト9番染色体に関連するメディアがあります
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