16番染色体
| 16番染色体 | |
|---|---|
 Gバンド染色後のヒト16番染色体ペア。1 つは母親由来、もう1つは父親由来。 | |
 ヒト男性の核型図における16番染色体対。 | |
| 特徴 | |
| 長さ（bp） | 96,330,374 bp (CHM13) |
| 遺伝子の数 | 795（CCDS）[1] |
| タイプ | 常染色体 |
| セントロメアの位置 | メタセントリック[2] （36.8 Mbp [3]） |
| 完全な遺伝子リスト | |
| CCDS | 遺伝子リスト |
| HGNC | 遺伝子リスト |
| ユニプロット | 遺伝子リスト |
| NCBI | 遺伝子リスト |
| 外部マップビューア | |
| アンサンブル | 16番染色体 |
| エントレズ | 16番染色体 |
| NCBI | 16番染色体 |
| UCSC | 16番染色体 |
| 完全なDNA配列 | |
| 参照シーケンス | NC_000016 (ファスタ) |
| ジェンバンク | CM000678 (ファスタ) |
16番染色体は、ヒトの23対の染色体のうちの1つです。通常、ヒトはこの染色体を2本持っています。16番染色体は約9000万塩基対（DNAの構成要素）に及び、細胞内の全DNAの約3%弱を占めています。
遺伝子
遺伝子の数
以下は、ヒト16番染色体の遺伝子数の推定値の一部です。研究者によってゲノムアノテーションの手法が異なるため、各染色体上の遺伝子数の予測値は異なります（技術的な詳細については、遺伝子予測を参照してください）。様々なプロジェクトの中でも、共同コンセンサスコーディングシーケンスプロジェクト（CCDS）は非常に保守的な戦略を採用しています。そのため、CCDSによる遺伝子数予測は、ヒトのタンパク質コード遺伝子の総数の下限値を表しています。[4]
| 推定 | タンパク質コード遺伝子 | 非コードRNA遺伝子 | 偽遺伝子 | ソース | 発売日 |
|---|---|---|---|---|---|
| CCDS | 795 | — | — | [1] | 2016年9月8日 |
| HGNC | 802 | 251 | 365 | [5] | 2017年5月12日 |
| アンサンブル | 865 | 1,046 | 462 | [6] | 2017年3月29日 |
| ユニプロット | 838 | — | — | [7] | 2018年2月28日 |
| NCBI | 912 | 652 | 502 | [8] [9] [10] | 2017年5月19日 |
遺伝子リスト
以下は、ヒトの 16 番染色体上の遺伝子の部分的なリストです。完全なリストについては、右側の情報ボックスのリンクを参照してください。
- AARS1 :アラニル-tRNA合成酵素1をコードする酵素
- ACSF3 :アシルCoA合成酵素ファミリーメンバー3をコードする酵素
- ACSM2B :アシルコエンザイムA合成酵素ACSM2Bをコードする酵素、ミトコンドリア
- ACSM3 :アシルコエンザイムA合成酵素ACSM3をコードする酵素、ミトコンドリア2
- ADHD1: 注意欠陥多動性障害、感受性、1
- ARL6IP1 : ADPリボシル化因子様タンパク質6相互作用タンパク質1をコードするタンパク質
- ARMC5
- BMIQ5: 体格指数定量的形質遺伝子座5
- C16orf58 : 16番染色体のオープンリーディングフレーム58をコードするタンパク質
- C16orf71 :タンパク質をコードする未解析タンパク質 16番染色体オープンリーディングフレーム71
- C16orf82 :
- C16orf84 :
- C16orf95 :
- C16orf96 : C16orf96タンパク質をコードする、または染色体16のオープンリーディングフレーム96、
- CARHSP1：カルシウム調節性熱安定性タンパク質1
- CASP16P :タンパク質カスパーゼ16をコードする、擬似遺伝子
- CCDC113 :コイルドコイルドメイン含有タンパク質113をコードするタンパク質
- Ccdc78 :コイルドコイルドメイン含有タンパク質78 (CCDC78) をコードする
- CDIPT：CDP-ジアシルグリセロール-イノシトール3-ホスファチジルトランスフェラーゼ
- CFDP1：頭蓋顔面発達タンパク質1
- CHDS1: 冠動脈性心疾患、感受性、1
- CIAPIN1：アナモルシン（元々はサイトカイン誘導アポトーシス阻害剤1）
- CKLF：ケモカイン様因子
- CLUAP1 :
- CMTM2 : CKLF様MARVEL膜貫通ドメイン含有タンパク質2をコードするタンパク質
- CCDC135 :コイルドコイルドメイン含有タンパク質135をコードするタンパク質
- COTL1 :コアクトシン様タンパク質をコードするタンパク質
- CPNE7 :コピン7タンパク質をコードする
- CTRL：キモトリプシン様プロテアーゼ
- DCTPP1 : dCTPピロホスファターゼ1をコードする酵素
- DEL16P12.1P11.2：染色体16p12.2-p11.2欠失症候群
- DEL16p13.3、RSTSS：染色体16p13.3欠失症候群（ルビンスタイン・テイビ欠失症候群）
- DHX38 : DEAHボックスヘリカーゼ38
- DUP16p13.3、C16DUPq13.3：染色体16p13.3重複症候群
- EMP2：上皮膜タンパク質2
- ENKD1 : エンクリンドメイン含有タンパク質 1
- ERAF：αヘモグロビン安定化タンパク質
- FAHD1：フマリルアセト酢酸加水分解酵素ドメイン含有タンパク質1
- FAM57B : 配列類似性57のメンバーBを持つファミリー
- FBRS：おそらくフィブロシン1長鎖転写タンパク質
- FOXC2-AS1 : FOXC2アンチセンスRNA 1をコードするタンパク質
- GLG1：ゴルジ体タンパク質1
- HBAP1：ヘモグロビンα擬遺伝子1
- HBHR、ATR1：アルファサラセミア/精神遅滞症候群1型
- HIRIP3 : HIRA相互作用タンパク質3をコードするタンパク質
- IBD8：炎症性腸疾患8
- IHPS2: 乳児肥大性幽門狭窄症2
- ITFG3 :タンパク質をコードするタンパク質 ITFG3
- JPT2 :木星微小管関連ホモログ2をコードするタンパク質
- KDM8 :リジン脱メチル化酵素8をコードするタンパク質
- KIAA0895L : 未解析タンパク質 KIAA0895類似体
- LINC00273はタンパク質をコードする長鎖インタージェニック非タンパク質コードRNA 273である。
- LOC124220 :タンパク質チモーゲン顆粒タンパク質16ホモログBをコードする
- LOC81691 :
- LUC7L :推定RNA結合タンパク質Luc7様1をコードするタンパク質
- LYPLA3 :グループXVホスホリパーゼA2をコードする酵素
- MC1R：メラノコルチン1受容体
- MCOPCT1: 白内障を伴う小眼球症1
- METRN：グリア細胞分化制御因子メテオリンをコードするタンパク質
- METTL26/JFP2 :タンパク質をコードする染色体16のオープンリーディングフレーム13
- MKL2 : MKL/ミオカルディン様タンパク質2をコードするタンパク質
- MPHOSPH6 : M期リン酸化タンパク質6をコードする酵素
- MT1G :メタロチオネイン-1Gをコードするタンパク質
- MT1X :メタロチオネイン1Xをコードするタンパク質
- NIP30 : エンコードタンパク質NIP30タンパク質
- NOB1 : RNA結合タンパク質NOB1をコードするタンパク質
- NOMO1 :タンパク質Nodal modulator 1をコードする
- NPW :神経ペプチドWをコードするタンパク質
- NUBP2 :ヌクレオチド結合タンパク質2をコードするタンパク質
- NUPR1 :核タンパク質1をコードするタンパク質
- OGFOD1 :
- PDF : ペプチドデホルミラーゼをコードする酵素、ミトコンドリア
- PDPR：ピルビン酸脱水素酵素ホスファターゼ調節サブユニットをコードするタンパク質
- PKDTS: 結節性硬化症を伴う乳児重症多発性嚢胞腎
- PMFBP1 :ポリアミン調節因子1結合タンパク質1をコードするタンパク質
- POLR3K : DNA指向性RNAポリメラーゼIIIサブユニットRPC10をコードする酵素
- PRMT7 :タンパク質アルギニンメチルトランスフェラーゼ7をコードするタンパク質
- PRR35 :プロリンリッチ35タンパク質をコードする
- RPS15A :タンパク質40Sリボソームタンパク質S15aをコードする
- RSL1D1 :リボソームL1ドメイン含有タンパク質1をコードするタンパク質
- SHCBP1 : SHC SH2ドメイン結合タンパク質1をコードするタンパク質
- SLZ1 : SLX1構造特異的エンドヌクレアーゼサブユニットホモログBをコードするタンパク質（S. cerevisiae）
- SNAI3-AS1 : SNAI3アンチセンスRNA 1をコードするタンパク質
- SNORD71 :タンパク質をコードする小核小体RNA、C/Dボックス71
- SPSB3 : SplA/リアノジン受容体ドメインとSOCSボックスを含むタンパク質3をコードする
- SRCAP :ヘリカーゼSRCAPをコードする酵素
- TANGO6 :タンパク質輸送およびゴルジ体組織化タンパク質6ホモログをコードする
- TAO2: セリン/スレオニンタンパク質キナーゼTAO2をコードする
- TBC1D24 : TBC1ドメインファミリーのタンパク質をコードする、メンバー24
- TEDC2 :タンパク質チューブリンε・δ複合体2をコードする
- TELO2 :テロメア長調節タンパク質 TEL2 ホモログをコードするタンパク質
- TMEM112 :リパーゼ成熟因子1をコードする酵素
- TMEM8A :膜貫通タンパク質8Aをコードするタンパク質
- TNRC6A :トリヌクレオチド反復配列含有遺伝子6Aタンパク質をコードするタンパク質
- 結節性硬化症複合体腫瘍抑制因子：エンコード[[]] FALSE
- TSR3 : エンコーディング
- UNKL : エンコードタンパク質RING フィンガータンパク質 unkempt-like
- VAT1L :小胞アミン輸送タンパク質1ホモログ（T. californica）様タンパク質をコードする
- VPS35L : VPS35エンドソームタンパク質選別因子をコードするタンパク質
- WFDC1 : WAP 4ジスルフィドコアドメインタンパク質1をコードするタンパク質
- ZG16
- ZNF23 :タンパク質ジンクフィンガータンパク質23をコードする
- ZNF200 :タンパク質ジンクフィンガータンパク質200をコードする
- ZNF263 :タンパク質ジンクフィンガー263をコードする
- ZNF629 :タンパク質ジンクフィンガー629をコードする
- ZNF843 :タンパク質ジンクフィンガー843をコードする
病気と障害
- 注意欠陥多動性障害（ADHD）
- アスペルガー症候群
- 自閉症スペクトラム障害[11] [12]
- 常染色体優性多発性嚢胞腎（PKD-1）
- バッテン病
- マロン酸・メチルマロン酸尿症（CMAMMA）
- 家族性地中海熱（FMF）
- 共感覚
- サラセミア
- 16トリソミー
- モルキオ症候群
- ハオ・ファウンテン症候群
関連する特性
細胞遺伝学的バンド
ヒト染色体16のGバンド表意文字
| キリスト | 腕[18] | バンド[19] | ISCN スタート[20] | ISCN 停止[20] | ベースペア 開始 | ベースペア ストップ | ステイン[21] | 密度 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16 | p | 13.3 | 0 | 352 | 1 | 780万 | グネグ | |
| 16 | p | 13.2 | 352 | 596 | 7,800,001 | 10,400,000 | gpos | 50 |
| 16 | p | 13.13 | 596 | 813 | 10,400,001 | 12,500,000 | グネグ | |
| 16 | p | 13.12 | 813 | 948 | 12,500,001 | 14,700,000 | gpos | 50 |
| 16 | p | 13.11 | 948 | 1070 | 14,700,001 | 16,700,000 | グネグ | |
| 16 | p | 12.3 | 1070 | 1246 | 16,700,001 | 21,200,000 | gpos | 50 |
| 16 | p | 12.2 | 1246 | 1409 | 21,200,001 | 24,200,000 | グネグ | |
| 16 | p | 12.1 | 1409 | 1558 | 24,200,001 | 28,500,000 | gpos | 50 |
| 16 | p | 11.2 | 1558 | 1856 | 28,500,001 | 35,300,000 | グネグ | |
| 16 | p | 11.1 | 1856 | 2045 | 35,300,001 | 36,800,000 | アセン | |
| 16 | q | 11.1 | 2045 | 2194 | 36,800,001 | 38,400,000 | アセン | |
| 16 | q | 11.2 | 2194 | 2709 | 38,400,001 | 47,000,000 | グヴァル | |
| 16 | q | 12.1 | 2709 | 2953 | 47,000,001 | 52,600,000 | グネグ | |
| 16 | q | 12.2 | 2953 | 3142 | 52,600,001 | 56,000,000 | gpos | 50 |
| 16 | q | 13 | 3142 | 3346 | 56,000,001 | 57,300,000 | グネグ | |
| 16 | q | 21 | 3346 | 3657 | 57,300,001 | 66,600,000 | gpos | 100 |
| 16 | q | 22.1 | 3657 | 4023 | 66,600,001 | 70,800,000 | グネグ | |
| 16 | q | 22.2 | 4023 | 4118 | 70,800,001 | 72,800,000 | gpos | 50 |
| 16 | q | 22.3 | 4118 | 4294 | 72,800,001 | 74,100,000 | グネグ | |
| 16 | q | 23.1 | 4294 | 4551 | 74,100,001 | 79,200,000 | gpos | 75 |
| 16 | q | 23.2 | 4551 | 4659 | 79,200,001 | 81,600,000 | グネグ | |
| 16 | q | 23.3 | 4659 | 4768 | 81,600,001 | 84,100,000 | gpos | 50 |
| 16 | q | 24.1 | 4768 | 4930 | 84,100,001 | 87,000,000 | グネグ | |
| 16 | q | 24.2 | 4930 | 5025 | 87,000,001 | 88,700,000 | gpos | 25 |
| 16 | q | 24.3 | 5025 | 5120 | 88,700,001 | 90,338,345 | グネグ |
参考文献
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- ^ 「検索結果 - 16[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ( ("genetype miscrna"[Properties] OR "genetype ncrna"[Properties] OR "genetype rrna"[Properties] OR "genetype trna"[Properties] OR "genetype scrna"[Properties] OR "genetype snrna"[Properties] OR "genetype snorna"[Properties]) NOT "genetype protein coding"[Properties] AND alive[prop]) - Gene」。NCBI 。 2017年5月19日。2017年5月20日閲覧。
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- ^ 細胞遺伝学的バンドの命名法については、記事locus を参照してください。
- ^ ab これらの値（ISCN開始/終了）は、ISCN書籍『国際ヒト細胞遺伝学命名法』（2013年）のバンド/表意文字の長さに基づいています。任意の単位です。
- ^ gpos : G バンドで陽性に染色される領域。通常、 AT が豊富で遺伝子が乏しい。gneg : G バンドで陰性に染色される領域。通常、CGが豊富で遺伝子が豊富。acenセントロメア 。var : 可変領域。stalk :茎。
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外部リンク
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- 「16番染色体」。ヒトゲノムプロジェクト情報アーカイブ 1990–2003 。 2017年5月6日閲覧。
