ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
UBE2H 利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス UBE2H 、E2-20K、GID3、UBC8、UBCH、UBCH2、ユビキチン結合酵素 E2 H 外部ID オミム :601082; MGI : 104632; ホモロジーン : 103894; ジーンカード :UBE2H; OMA :UBE2H - オルソログ EC番号 2.3.2.24 遺伝子の位置( マウス ) キリスト 6番染色体(マウス) [2] バンド 6 A3.3|6 12.52 cM 始める 30,211,288 bp [2] 終わり 30,304,538 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) 上位の表現 二次卵母細胞 右副腎皮質 結腸上皮 伏在静脈 内淡蒼球 上腕二頭筋の骨格筋組織 羊水 ランゲルハンス島 左副腎 精巣上体頭
上位の表現 血 網膜色素上皮 吻側回遊流 脛大腿関節 黒質 髄質集合管 上行大動脈 毛様体 顆頭 窩
より多くの参照表現データ
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能 トランスフェラーゼ活性 ヌクレオチド結合 タンパク質結合 ATP結合 ユビキチン結合酵素活性 ユビキチンタンパク質リガーゼ結合 ユビキチンタンパク質リガーゼ活性 ユビキチンタンパク質転移酵素活性 細胞成分 生物学的プロセス タンパク質K48結合ユビキチン化 ユビキチン依存性タンパク質分解プロセス プロテアソームを介したユビキチン依存性タンパク質分解プロセス タンパク質K11結合ユビキチン化 タンパク質のユビキチン化 出典:Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001202498 NM_003344 NM_182697
NM_001169576 NM_001169577 NM_009459
RefSeq(タンパク質) NP_001189427 NP_003335 NP_874356 NP_003335.1
NP_001163047 NP_001163048 NP_033485
場所(UCSC) 7章: 129.83 – 129.95 Mb 6章: 30.21 – 30.3 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
ユビキチン結合酵素E2H は、ヒトでは UBE2H 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6]
ユビキチン によるタンパク質の修飾は、 異常なタンパク質や短寿命タンパク質を分解対象とする重要な細胞機構です。 ユビキチン化に は、少なくとも3種類の 酵素 が関与します。ユビキチン活性化酵素(E1)、ユビキチン結合酵素(E2)、そして ユビキチンタンパク質リガーゼ (E3)です。この遺伝子は、E2ユビキチン結合酵素ファミリーのメンバーをコードしています。コードされている タンパク質配列は 、マウス ホモログ と100%同一であり、カエルおよびゼブラフィッシュホモログと98%同一です。この遺伝子には、選択的スプライシングを受けた2つの転写バリアントが見つかっており、それぞれ異なる アイソフォーム をコードしています。 [6]
参考文献 ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000186591 – Ensembl 、2017年5月 ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000039159 – Ensembl 、2017年5月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ カイザー P、ゾウフェルト W、ホッファラー L、コフラー B、ザクセンマイヤー C、ヘルツォーク H、イェンチュ S、シュヴァイガー M、シュナイダー R (1994 年 4 月)。 「酵母UBC8と相同なヒトユビキチン結合酵素」。 Jバイオルケム . 269 (12): 8797–802 。 土井 : 10.1016/S0021-9258(17)37039-4 。 PMID 8132613。 ^ ab "Entrez Gene: UBE2H ユビキチン結合酵素 E2H (UBC8 ホモログ、酵母)".
さらに読む Wefes I, Mastrandrea LD, Haldeman M, et al. (1995). 「末期赤血球分化におけるユビキチン結合酵素の誘導」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 92 (11): 4982–6 . Bibcode :1995PNAS...92.4982W. doi : 10.1073/pnas.92.11.4982 . PMC 41831. PMID 7761435 . Kaiser P, Mandl S, Schweiger M, Schneider R (1996). 「ヒトユビキチン結合酵素UbcH2における機能的に独立したドメインの特性評価」. FEBS Lett . 377 (2): 193–6 . Bibcode :1995FEBSL.377..193K. doi : 10.1016/0014-5793(95)01323-7 . PMID 8543049. S2CID 24431321. 林田 誠、山崎 健、浅田 勇、他 (2000). 「7q32におけるインプリントMEST/PEG1領域を挟む物理地図および転写産物地図の構築」. Genomics . 66 (2): 221–5 . doi :10.1006/geno.2000.6206. PMID 10860668. Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 . Scherer SW, Cheung J, MacDonald JR, et al. (2003). 「ヒト7番染色体:DNA配列と生物学」. Science . 300 (5620): 767–72 . Bibcode :2003Sci...300..767S. doi :10.1126/science.1083423. PMC 2882961. PMID 12690205 . Hillier LW, Fulton RS, Fulton LA, et al. (2003). 「ヒト7番染色体のDNA配列」. Nature . 424 (6945): 157–64 . Bibcode :2003Natur.424..157H. doi : 10.1038/nature01782 . PMID 12853948. S2CID 19637860. Vourc'h P, Martin I, Bonnet-Brilhault F, et al. (2005). 「自閉症における染色体7q32上のUBE2H遺伝子の変異スクリーニングと関連研究」 Psychiatr. Genet . 13 (4): 221–5 . doi :10.1097/00041444-200312000-00005. PMID 14639049. S2CID 25469223. 太田 剛志、鈴木 雄志、西川 剛志、他 (2004). 「21,243個の完全長ヒトcDNAの完全配列決定と特性解析」 Nat. Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039. S2CID 21903526. Bartee E、Mansouri M、Hovey Nerenberg BT、他(2004)。 「ウイルス免疫回避タンパク質に関連するヒトユビキチンリガーゼによる主要組織適合性複合体クラスIの下方制御」。 J. ヴィロル 78 (3): 1109–20 . 土井 :10.1128/JVI.78.3.1109-1120.2004。 PMC 321412 。 PMID 14722266。 Chuang TH, Ulevitch RJ (2004). 「Triad3A、Toll様受容体を制御するE3ユビキチンタンパク質リガーゼ」 Nat. Immunol . 5 (5): 495– 502. doi :10.1038/ni1066. PMID 15107846. S2CID 39773935. Kim HJ, Chong KH, Kang SW, et al. (2005). 「酵母ツーハイブリッドスクリーニングによるシクロフィリンAのCD99結合タンパク質としての同定」. Immunol. Lett . 95 (2): 155–9 . doi :10.1016/j.imlet.2004.07.001. PMID 15388255. Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大:哺乳類遺伝子コレクション(MGC)」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 . Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップの構築に向けて」 Nature . 437 (7062): 1173–8 . Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.