ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
シルパ 利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2JJS、2JJT、2UV3、2WNG、4CMM
識別子 エイリアス SIRPA 、BIT、CD172A、MFR、MYD-1、P84、PTPNS1、SHPS1、SIRP、シグナル調節タンパク質α、シグナル調節タンパク質α 外部ID オミム :602461; MGI : 108563; ホモロジーン : 7246; ジーンカード :SIRPA; OMA :SIRPA - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) キリスト 染色体2(マウス) [2] バンド 2 F1|2 63.19 cM 始める 129,434,755 bp [2] 終わり 129,474,148 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) 上位の表現 右前頭葉 ブロードマン領域9 小脳の右半球 中心後回 視床の外側核群 前頭前皮質 上前頭回 扁桃体 中側頭回 側坐核
上位の表現 骨髄間質 顆粒球 前頭前皮質 上前頭回 一次視覚野 海馬歯状回顆粒細胞 小脳皮質 脛大腿関節 嗅周皮質 嗅内皮質
より多くの参照表現データ
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能 SH3ドメイン結合 タンパク質ホスファターゼ結合 GTPase調節因子活性 異型細胞間接着に関与するタンパク質結合 細胞間接着メディエーター活性 タンパク質抗原結合 タンパク質チロシンキナーゼ結合 細胞成分 膜の不可欠な構成要素 細胞膜 細胞外エクソソーム 膜 三次顆粒膜 フィコリン-1リッチ顆粒膜 細胞膜の不可欠な構成要素 細胞表面 生物学的プロセス 細胞接着 白血球遊走 好中球脱顆粒 タンパク質リン酸化の負の制御 遺伝子発現の調節 細胞の移動 細胞間接着の正の調節 インターフェロンγ産生の調節 インターロイキン-1β産生の調節 インターロイキン-6産生の調節 腫瘍壊死因子産生の調節 インターフェロンβ産生の負の調節 インターロイキン-6産生の負の調節 腫瘍壊死因子産生の負の調節 異型細胞間接着 単球の血管外漏出 一酸化窒素生合成プロセスの負の調節 一酸化窒素生合成プロセスの調節 JNKカスケードの負の制御 炎症反応の負の調節 貪食作用の負の調節 貪食作用の正の調節 触媒活性の調節 T細胞活性化の正の調節 過酸化水素に対する細胞反応 ERK1およびERK2カスケードの負の制御 リポ多糖に対する細胞反応 インターフェロンガンマに対する細胞応答 インターロイキン-1に対する細胞応答 インターロイキン-12に対する細胞応答 マクロファージ炎症性タンパク質1α産生の負の調節 ケモカイン(CCモチーフ)リガンド5産生の負の制御 細胞間接着 炎症反応に関与するサイトカイン産生の負の調節 I-κBリン酸化の負の制御 出典:Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001040022 NM_001040023 NM_080792 NM_001330728
NM_001177646 NM_001177647 NM_001291019 NM_001291020 NM_001291021 NM_001291022 NM_007547 NM_001355158 NM_001355160
RefSeq(タンパク質) NP_001035111 NP_001035112 NP_001317657 NP_542970
NP_001171118 NP_001277948 NP_001277949 NP_001277950 NP_001277951 NP_031573 NP_001342087 NP_001342089
場所(UCSC) 20章: 1.89 – 1.94 MB 2 章: 129.43 – 129.47 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
シグナル調節タンパク質α (SIRPα)は、主に骨髄細胞で発現されるが、幹細胞 [ 要出典 ] やニューロン でも発現されるSIRPファミリーの調節性膜糖タンパク質である。
SIRPαは抑制受容体として機能し、広く発現している膜貫通タンパク質 CD47 (別名「私を食べないで」シグナル)と相互作用する。この相互作用は、宿主細胞の 貪食作用 などの 自然免疫細胞 のエフェクター機能を負に制御する。SIRPαは マクロファージ 膜上を横方向に拡散し、貪食シナプスに蓄積してCD47に結合し、「自己」シグナルを送る。これにより、マクロファージによる細胞骨格を集中的に利用する貪食プロセスが阻害される。 [5]これは、 MHCクラスI 分子がIg様受容体または Ly49受容体を介して NK細胞 に 伝達する自己シグナルに類似している 。 [6] [7] 注:右に示されているタンパク質はSIRPαではなくCD47である。
構造 SIRPαの細胞質領域は、ラット、マウス、ヒトの間で高度に保存されています。細胞質領域には、 ITIMとして機能する可能性のある チロシン 残基が多数含まれています 。CD47が結合すると、SIRPαはリン酸化され、SHP1や SHP2 などのホスファターゼをリクルートします。 [8] 細胞外領域には、3つの 免疫グロブリンスーパーファミリー ドメイン(1つのVセットIgSFドメインと2つのC1セット IgSF ドメイン)が含まれています。SIRPβとγは類似した細胞外構造を持ちますが、細胞質領域が異なり、対照的な種類のシグナルを発します。SIRPαの多型はリガンド結合 IgSF Vセットドメインに見られますが、リガンド結合には影響しません。この多型は病原体結合の受容体を保護するために重要であるという考えがあります。 [6] [9]
リガンド SIRPαは 、生細胞と死細胞を区別する抗貪食シグナルである CD47 を認識します。CD47は、単一の免疫グロブリン様細胞外ドメインと5つの膜貫通領域を有しています。SIRPαとCD47の相互作用は、受容体の エンドサイトーシスまたは切断、あるいは サーファクタントタンパク質 との相互作用によって変化します。 サーファクタントタンパク質A および D は可溶性リガンドであり、肺において高発現しており、 CD47 と同じSIRPα領域に結合し、競合的に結合を阻害します。 [9] [10]
シグナリング SIRPαの細胞外ドメインは CD47 に結合し、その細胞質ドメインを介して細胞内シグナルを伝達する。CD47への結合は、 SIRPαの NH2末端 V様ドメインを介して媒介される。細胞質領域には4つの ITIMが 含まれており、リガンド結合後にリン酸化される。このリン酸化はチロシンキナーゼ SHP2の活性化を媒介する。SIRPαは、ホスファターゼ SHP1 、アダプタータンパク質 SCAP2 、および FYN 結合タンパク質にも結合することが示されている。SHPホスファターゼが膜にリクルートされると、細胞表面への ミオシン 蓄積が阻害され、 貪食 が阻害される 。 [9] [10]
癌 癌細胞は SIRPαを活性化し、 マクロファージによる破壊を阻害する CD47を 高発現している。ある研究では、癌細胞上の CD47に拮抗し、癌細胞の 貪食を 増加させるSIRPαの高親和性変異体を作製した 。 [11] 別の研究(マウス)では、抗SIRPα抗体が単独で、または他の癌治療との相乗効果で、マクロファージによる癌の増殖と転移を抑制することが明らかになった。 [12] [13]
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さらに読む Oldenborg PA (2013). 「CD47:健康時と疾患時における造血細胞の多様な機能を制御する細胞表面糖タンパク質」 ISRN Hematology . 2013 614619. doi : 10.1155/2013/614619 . PMC 3564380. PMID 23401787 . 山内 徹、竹中 和也、浦田 俊、島 哲、菊重 裕、徳山 哲 他(2013年2月)。 「多型 Sirpa は、効率的なヒト細胞の生着を達成するための NOD ベースのマウス系統の遺伝的決定因子です。」 血 。 121 (8): 1316–1325 。 土井 : 10.1182/blood-2012-06-440354 。 PMID 23293079。 Oldenborg PA (2004年7月). 「赤血球系細胞および自己免疫におけるCD47の役割」. 白血病・リンパ腫 . 45 (7): 1319– 1327. doi :10.1080/1042819042000201989. PMID 15359629. S2CID 12642148. Margolis RL, Breschel TS, Li SH, Kidwai AS, Antonarakis SE, McInnis MG, et al. (1995年7月). 「ヒト脳由来のCCAトリヌクレオチドリピートを含むcDNAクローンの特性解析」. 体細胞・分子遺伝学 . 21 (4): 279– 284. doi :10.1007/BF02255782. PMID 8525433. S2CID 22174220. 大西 浩、久保田 正之、大竹 暁、佐藤 健、佐野 誠(1996年10月)「新規脳分子のチロシン活性化モチーフによるタンパク質チロシンホスファターゼSH-PTP2の活性化」 The Journal of Biological Chemistry . 271 (41): 25569– 25574. doi : 10.1074/jbc.271.41.25569 . PMID 8810330. 藤岡雄一、的崎毅、野口毅、岩松明生、山尾毅、高橋暢雄、他 (1996年12月). 「マイトジェンおよび細胞接着に応答してSH2ドメイン含有タンパク質チロシンホスファターゼSHP-2に結合する新規膜糖タンパク質SHPS-1」. Molecular and Cellular Biology . 16 (12): 6887– 6899. doi :10.1128/MCB.16.12.6887. PMC 231692. PMID 8943344 . 佐野 誠・大西 秀・大森 明・長谷川 淳・久保田 正治 (1997年7月). 「BIT、脳内の免疫抗原受容体様分子」. FEBS Letters . 411 ( 2–3 ): 327–334 . doi : 10.1016/S0014-5793(97)00724-2 . PMID 9271230. S2CID 39554802. Brooke GP、Parsons KR、Howard CJ(1998年1月)「牛の単球および樹状細胞亜集団に発現し、CD4 T細胞への結合を媒介するSIRPαファミリータンパク質チロシンホスファターゼ結合タンパク質2種のクローニング」 European Journal of Immunology . 28 (1): 1– 11. doi : 10.1002/(SICI)1521-4141(199801)28:01<1::AID-IMMU1>3.0.CO;2-V . PMID 9485180. Timms JF, Carlberg K, Gu H, Chen H, Kamatkar S, Nadler MJ, 他 (1998年7月). 「マクロファージにおけるSH2含有タンパク質チロシンホスファターゼSHP-1の主要な結合タンパク質および基質の同定」. Molecular and Cellular Biology . 18 (7): 3838– 3850. doi :10.1128/mcb.18.7.3838. PMC 108968. PMID 9632768 . Veillette A, Thibaudeau E, Latour S (1998年8月). 「マクロファージにおける阻害性受容体SHPS-1の高発現とタンパク質チロシンホスファターゼSHP-1との関連」. The Journal of Biological Chemistry . 273 (35): 22719– 22728. doi : 10.1074/jbc.273.35.22719 . PMID 9712903. Jiang P, Lagenaur CF, Narayanan V (1999年1月). 「インテグリン関連タンパク質はP84神経接着分子のリガンドである」. The Journal of Biological Chemistry . 274 (2): 559– 562. doi : 10.1074/jbc.274.2.559 . PMID 9872987. 大西 秀雄、山田 正之、久保田 正治、畑中 秀雄、佐野 誠(1999年4月). 「神経 栄養因子誘導によるチロシンリン酸化とBITとSHP-2の会合」. Journal of Neurochemistry . 72 (4): 1402– 1408. doi : 10.1046/j.1471-4159.1999.721402.x . PMID 10098842. S2CID 83600875. Timms JF, Swanson KD, Marie-Cardine A, Raab M, Rudd CE, Schraven B, et al. (1999年8月). 「SHPS-1はマクロファージにおいて、接着制御された多タンパク質複合体を形成するための足場となる」. Current Biology . 9 (16): 927– 930. Bibcode : 1999CBio....9..927T. doi : 10.1016/S0960-9822(99)80401-1 . PMID 10469599. S2CID 16056124. Seiffert M, Cant C, Chen Z, Rappold I, Brugger W, Kanz L, et al. (1999年12月). 「ヒトシグナル調節タンパク質は正常細胞に発現するが、白血病性骨髄細胞の一部には発現せず、そのカウンターレセプターであるCD47を介した細胞接着を媒介する」 Blood . 94 (11): 3633– 3643. doi :10.1182/blood.V94.11.3633. PMID 10572074. S2CID 11033417. 佐野 誠、大西 秀、久保田 正治 (1999年12月). 「マウスBIT/SHPS-1の遺伝子構造」. The Biochemical Journal . 344 (Pt 3): 667– 675. doi :10.1042/0264-6021:3440667. PMC 1220688. PMID 10585853 . Yang J, Cheng Z, Niu T, Liang X, Zhao ZJ, Zhou GW (2000年2月). 「タンパク質チロシンホスファターゼSHP-1の基質特異性の構造的基盤」. The Journal of Biological Chemistry . 275 (6): 4066– 4071. doi : 10.1074/jbc.275.6.4066 . PMID 10660565. Stofega MR, Argetsinger LS, Wang H, Ullrich A, Carter-Su C (2000年9月). 「シグナル調節タンパク質αによる成長ホルモン受容体/JAK2シグナル伝達の負の制御」. The Journal of Biological Chemistry . 275 (36): 28222– 28229. doi : 10.1074/jbc.M004238200 . PMID 10842184. Wu CJ, Chen Z, Ullrich A, Greene MI, O'Rourke DM (2000年8月). 「シグナル制御タンパク質(SIRP)によるEGFRを介したホスホイノシチド-3-OHキナーゼ(PI3-K)シグナル伝達と神経膠芽腫の表現型の阻害」. Oncogene . 19 (35): 3999– 4010. doi :10.1038/sj.onc.1203748. PMID 10962556. S2CID 9020984. Latour S, Tanaka H, Demeure C, Mateo V, Rubio M, Brown EJ, et al. (2001年9月). 「CD47とその相同受容体シグナル調節タンパク質αによるヒトT細胞および樹状細胞の双方向性抑制制御:IL-12応答性のダウンレギュレーションと樹状細胞活性化の抑制」. Journal of Immunology . 167 (5): 2547– 2554. doi : 10.4049/jimmunol.167.5.2547 . PMID 11509594. この記事には、 パブリック ドメイン である 米国国立医学図書館 のテキストが組み込まれています。
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