ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| ネクチン1 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オーソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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3ALP、3SKU、3U83、4FMF、4MYW |
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| 識別子 |
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| エイリアス | NECTIN1、CD111、CLPED1、ED4、HIgR、HV1S、HVEC、OFC7、PRR、PRR1、PVRR、PVRR1、SK-12、ネクチン-1、PVRL1、ネクチン細胞接着分子1 |
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| 外部ID | オミム:600644; MGI : 1926483;ホモロジーン: 2138;ジーンカード: NECTIN1; OMA :NECTIN1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 9番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 9|9 A5.1 | 始める | 43,655,281 bp [2] |
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| 終わり | 43,743,955 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - 腹部の皮膚
- 脚の皮膚
- 乳首
- 咽頭粘膜
- 舌体
- 歯肉上皮
- 視床の外側核群
- 視床下核
- 外陰部
- 外淡蒼球
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| | 上位の表現 | - リップ
- 網膜の神経層
- 大臼歯
- 海馬歯状回顆粒細胞
- 視覚皮質
- 胚葉上層
- 一次視覚野
- 脱落膜
- 性器結節
- 小脳皮質
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | - タンパク質ホモ二量体化活性
- 共受容体の活動
- ウイルス受容体活性
- タンパク質結合
- タンパク質ヘテロ二量体形成活性
- ビリオン結合
- シグナル伝達受容体結合
- 炭水化物結合
- 細胞接着分子の結合
- 同一のタンパク質結合
- シグナル伝達受容体の活性
| | 細胞成分 | - 膜の不可欠な構成要素
- 膜
- 細胞内膜小器官
- 細胞膜
- 成長円錐膜
- シナプス
- 細胞膜の不可欠な構成要素
- 細胞外領域
- 軸索
- 細胞接合
- ニューロン投射
- カテニン複合体
- シナプス前膜
- 頂端接合複合体
- 細胞間接触領域
- 細胞間接合
- 接着結合
- 樹状突起
- 海馬苔状線維からCA3シナプスへ
- シナプス前活性領域膜の不可欠な構成要素
| | 生物学的プロセス | - 細胞膜細胞接着分子を介した異好性細胞間接着
- 細胞認識
- デスモソーム組織
- シナプス形成の調節
- 軸索誘導
- 細胞接着
- 鉄イオン輸送
- カメラ型眼における水晶体の形態形成
- カメラ型眼における網膜の発達
- 免疫反応
- ウイルスの宿主細胞への侵入
- エナメル質の石灰化
- ウイルスプロセス
- 接着結合組織
- カメラ型眼の形態形成
- 細胞膜接着分子を介した同種親和性細胞接着
- シグナル伝達
- 細胞接合部へのタンパク質の局在
- 細胞間接着
- 宿主細胞へのウイルス粒子の付着
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オーソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_203286 NM_002855 NM_032767 NM_203285 |
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| RefSeq(タンパク質) | |
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NP_002846 NP_976030 NP_976031 |
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| 場所(UCSC) | 11章: 119.62 – 119.73 MB | 9章: 43.66 – 43.74 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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ポリオウイルス受容体関連タンパク質1(PVRL1)は、ネクチン1およびCD111(旧称ヘルペスウイルス侵入メディエーターC、HVEC )としても知られ、免疫グロブリンスーパーファミリー(IgSF)に属するヒトタンパク質であり、ネクチンの一種とも考えられています。[5] 3つの細胞外免疫グロブリンドメイン、1つの膜貫通ヘリックス、そして細胞質末端を持つ膜タンパク質です。このタンパク質はCa 2+非依存性細胞接着を媒介するため、IgSF細胞接着分子(IgSF CAM)として特徴付けられます。
関数
PVRL1は、幅広い組織に見られる接着分子であり、上皮組織の接着結合やニューロンの化学シナプスなど、様々な接合部に局在します。PVRL1の細胞質末端は、アクチンに結合する足場タンパク質であるアファジンと結合することができます。
化学シナプスにおいて、PVRL1はPVRL3(ネクチン3)と相互作用し、両タンパク質は脳発達の初期段階から老化脳まで、神経組織中に存在します。これら2つのタンパク質は化学シナプスに沿って非対称に局在することが分かっており、PVRL1は主に軸索側、PVRL3は樹状突起側に局在します。
このタンパク質は、ウイルスの糖タンパク質D(gD)と相互作用することで、単純ヘルペスウイルスの細胞侵入を媒介する重要な役割を担っていることが明らかになっています。 [6]
参照
相互作用
PVRL1はMLLT4と相互作用することが示されている。[7]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000110400 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000032012 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「Entrez遺伝子:PVRL1ポリオウイルス受容体関連1(ヘルペスウイルス侵入メディエーターC;ネクチン)」。
- ^ Cocchi F, Lopez M, Menotti L, Aoubala M, Dubreuil P, Campadelli-Fiume G (1999). 「ヘルペスウイルスIg様受容体(HIgR)のVドメインは、単純ヘルペスウイルス1型(Herpes Simplex Virus-1)の細胞侵入における主要な機能領域であり、ウイルス糖タンパク質Dと物理的に相互作用する」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 95 (26): 15700–5 . doi : 10.1073/pnas.95.26.15700 . PMC 28107. PMID 9861033 .
- ^ 高橋 功、中西 秀、宮原 正治、万代 健、佐藤 健、佐藤 明、西岡 秀、青木 淳、野本 明、溝口 明、高井 雄一 (1999年5月). 「ネクチン/PRR:PDZドメイン含有タンパク質アファディンとの相互作用を介してカドヘリンをベースとした接着結合部にリクルートされる免疫グロブリン様細胞接着分子」. J. Cell Biol . 145 (3): 539–49 . doi :10.1083/jcb.145.3.539. PMC 2185068. PMID 10225955 .
さらに読む
- Bustos T, Simosa V, Pinto-Cisternas J, Abramovits W, Jolay L, Rodriguez L, Fernandez L, Ramela M (1992). 「常染色体劣性外胚葉性異形成症:I. 未記載の異形成/奇形症候群」Am. J. Med. Genet . 41 (4): 398– 404. doi :10.1002/ajmg.1320410403. PMID 1776626.
- Lopez M, Eberlé F, Mattei MG, Gabert J, Birg F, Bardin F, Maroc C, Dubreuil P (1995). 「ポリオウイルス受容体遺伝子に関連するヒト遺伝子の相補DNA解析と染色体局在」. Gene . 155 (2): 261–5 . doi :10.1016/0378-1119(94)00842-G. PMID 7721102.
- Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). 「正規化と減算:遺伝子発見を促進する2つのアプローチ」Genome Res . 6 (9): 791– 806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548.
- Geraghty RJ, Krummenacher C, Cohen GH, Eisenberg RJ, Spear PG (1998). 「ポリオウイルス受容体関連タンパク質1とポリオウイルス受容体を介したアルファヘルペスウイルスの侵入」. Science . 280 (5369): 1618–20 . Bibcode :1998Sci...280.1618G. doi :10.1126/science.280.5369.1618. PMID :9616127.
- 鈴木 健、ブストス T、スプリッツ RA (1998). 「マルガリータ島外胚葉性異形成症(ED4)遺伝子の11q23への連鎖不平衡マッピング」Am. J. Hum. Genet . 63 (4): 1102–7 . doi :10.1086/302072. PMC 1377504. PMID 9758630 .
- コッチ F、メノッティ L、ミランドラ P、ロペス M、カンパデッリ フィウメ G (1998)。 「ポリオウイルス受容体に関連する免疫グロブリンサブファミリーの新規メンバーの細胞外ドメインは、ヒト細胞における単純ヘルペスウイルス1型および2型に対する真の受容体の属性を有する。」J.ヴィロル72 (12): 9992–10002。土井:10.1128/JVI.72.12.9992-10002.1998。PMC 110516。PMID 9811737。
- Cocchi F, Lopez M, Menotti L, Aoubala M, Dubreuil P, Campadelli-Fiume G (1999). 「ヘルペスウイルスIg様受容体(HIgR)のVドメインは、単純ヘルペスウイルス1型の細胞侵入における主要な機能領域であり、ウイルス糖タンパク質Dと物理的に相互作用する」Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 95 (26): 15700–5 . doi : 10.1073/pnas.95.26.15700 . PMC 28107. PMID 9861033.
- 高橋 功、中西 秀、宮原 正治、万代 健、佐藤 健、佐藤 明、西岡 秀、青木 淳、野本 明、溝口 明、高井 雄一 (1999). 「ネクチン/PRR:免疫グロブリン様細胞接着分子はPDZドメイン含有タンパク質アファディンとの相互作用を介してカドヘリンをベースとした接着結合部にリクルートされる」J. Cell Biol . 145 (3): 539–49 . doi :10.1083/jcb.145.3.539. PMC 2185068. PMID 10225955 .
- 宮原 正之、中西 秀、高橋 健、佐藤-堀川 憲、橘 健、高井 雄一 (2000). 「ネクチンとアファディンの相互作用は細胞間接触部位におけるクラスター形成に必要であるが、シス二量体形成やトランス相互作用には必要ではない」J. Biol. Chem . 275 (1): 613–8 . doi : 10.1074/jbc.275.1.613 . PMID 10617658.
- 鈴木 功、Hu D、Bustos T、Zlotogora J、Richieri-Costa A、Helms JA、Spritz RA (2000). 「口唇裂・口蓋裂外胚葉性異形成症における細胞間接着分子/ヘルペスウイルス受容体をコードするPVRL1の変異」Nat. Genet . 25 (4): 427–30 . doi :10.1038/78119. PMID 10932188. S2CID 6169893.
- Lopez M, Cocchi F, Avitabile E, Leclerc A, Adelaide J, Campadelli-Fiume G, Dubreuil P (2001). 「単純ヘルペスウイルス(HSV)受容体ネクチン1(またはPRR1-HIgR-HveC)の新規可溶性アイソフォームは、HSV感染感受性を正および負に調節する」J. Virol . 75 (12): 5684–91 . doi :10.1128/JVI.75.12.5684-5691.2001. PMC 114282. PMID 11356977 .
- Sözen MA, Suzuki K, Tolarova MM, Bustos T, Fernández Iglesias JE, Spritz RA (2001). 「PVRL1遺伝子の変異は、ベネズエラ北部における散発性、非症候群性の口唇裂・口蓋裂と関連する」Nat. Genet . 29 (2): 141–2 . doi :10.1038/ng740. PMID 11559849. S2CID 8641206.
- Struyf F, Posavad CM, Keyaerts E, Van Ranst M, Corey L, Spear PG (2002). 「免疫血清陰性者におけるヘルペスウイルス侵入メディエーター遺伝子、ネクチン-1、およびネクチン-2の多型の探索」J. Infect. Dis . 185 (1): 36– 44. doi : 10.1086/338116 . PMID 11756979.
- Fabre S, Reymond N, Cocchi F, Menotti L, Dubreuil P, Campadelli-Fiume G, Lopez M (2002). 「ネクチンのトランス相互作用におけるIg様Vドメインの重要な役割。ネクチン3とネクチン4は、ネクチン1 Vドメインの予測されるCC'-C"-Dβストランドに結合する。」J. Biol. Chem . 277 (30): 27006–13 . doi : 10.1074/jbc.M203228200 . PMID 12011057.
- Yoon M, Spear PG (2002). 「接着結合の破壊によりネクチン-1が遊離し、単純ヘルペスウイルスおよび仮性狂犬病ウイルスの侵入受容体として機能する」J. Virol . 76 (14): 7203–8 . doi :10.1128/JVI.76.14.7203-7208.2002. PMC 136315. PMID 12072519 .
- Struyf F, Martinez WM, Spear PG (2002). 「ネクチン-1およびネクチン-2のN末端ドメインの変異は、様々なアルファヘルペスウイルスの侵入およびネクチン-ネクチン相互作用の要件の違いを明らかにする」J. Virol . 76 (24): 12940–50 . doi :10.1128/JVI.76.24.12940-12950.2002. PMC 136698. PMID 12438620 .
- 武國 功、池田 渉、藤戸 剛、森本 功、竹内 正、門田 正、高井 雄一 (2003). 「発達期マウスの神経上皮細胞における細胞極性タンパク質PAR-3の細胞間接着分子ネクチンへの直接結合」J. Biol. Chem . 278 (8): 5497– 500. doi : 10.1074/jbc.C200707200 . PMID 12515806.
- Krummenacher C, Baribaud I, Eisenberg RJ, Cohen GH (2003). 「単純ヘルペスウイルス感染におけるネクチン-1と糖タンパク質Dの細胞内局在」. J. Virol . 77 (16): 8985–99 . doi :10.1128/JVI.77.16.8985-8999.2003. PMC 167240. PMID 12885915 .
- Bender FC, Whitbeck JC, Ponce de Leon M, Lou H, Eisenberg RJ, Cohen GH (2003). 「単純ヘルペスウイルスの侵入時における糖タンパク質Bと脂質ラフトの特異的な会合」. J. Virol . 77 (17): 9542–52 . doi :10.1128/JVI.77.17.9542-9552.2003. PMC 187402. PMID 12915568 .
外部リンク
- PVRL1+タンパク質、+ヒト(米国国立医学図書館医学件名表題集(MeSH))
この記事には、パブリック ドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。
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