ABCB9

ABCB9
識別子
エイリアス	ABCB9、EST122234、TAPL、ATP結合カセットサブファミリーBメンバー9
外部ID	オミム: 605453 ; MGI : 1861729 ;ホモロジーン: 10491 ;ジーンカード: ABCB9 ; OMA : ABCB9 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 12番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 12q24.31 始める 1億2292万951塩基対[ 1 ] 終わり 122,981,649 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 5番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 5|5 F 始める 1億2419万9593bp [ 2 ] 終わり 1億2423万3861bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 口腔粘膜細胞 浅側頭動脈 迷走神経背側運動核 右前頭葉 男性生殖細胞 小脳の右半球 精子 卵母細胞 前頭前皮質 腹側被蓋野 上位の表現 第四脳室脈絡叢 嗅周皮質 上前頭回 嗅内皮質 一次視覚野 小脳皮質 嗅結節 一次運動野 CA3領域 延髄 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 ヌクレオチド結合 ATPase活性 タンパク質ホモ二量体化活性 膜透過輸送体の活性 ABC型オリゴペプチドトランスポーター活性 ATP結合 ABC型ペプチドトランスポーター活性 ATPase共役膜輸送体の活性 タンパク質結合 ペプチド膜輸送活性 細胞成分 膜の不可欠な構成要素 初期エンドソーム 膜 小胞体膜の不可欠な構成要素 小胞体 リソソーム リソソーム膜 細胞内膜小器官 生物学的プロセス 膜輸送 ペプチド輸送 MHCクラスIを介した抗原処理とペプチド抗原の提示 タンパク質輸送 オリゴペプチド膜輸送 輸送 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 23457 56325 アンサンブル ENSG00000150967 ENSMUSG00000029408 ユニプロット Q9NP78 Q9JJ59 RefSeq (mRNA) NM_001243013 NM_001243014 NM_019624 NM_019625 NM_203444 NM_203445 NM_019875 RefSeq（タンパク質） NP_001229942 NP_001229943 NP_062570 NP_062571 NP_982269 NP_063928 場所（UCSC） 12章: 122.92 – 122.98 Mb 5番目の文字: 124.2 – 124.23 MB PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
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ATP結合カセットサブファミリーBメンバー9は、ヒトではABCB9遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[ 5 ] [ 6 ]}

この遺伝子によってコードされる膜関連タンパク質は、ATP結合カセット（ABC）トランスポータースーパーファミリーのメンバーである。ABCタンパク質は、細胞外膜および細胞内膜を介して様々な分子を輸送する。ABC遺伝子は7つの異なるサブファミリー（ABC1、MDR/TAP、MRP、ALD、OABP、GCN20、White）に分類される。このタンパク質はMDR/TAPサブファミリーのメンバーである。MDR/TAPサブファミリーのメンバーは、多剤耐性と抗原提示に関与している。このハーフトランスポーターの機能はまだ解明されていないが、リソソームにおいて何らかの役割を果たしている可能性がある。この遺伝子の選択的スプライシングにより、異なる基質特異性を持つと考えられる異なるアイソフォームが生じる。 ^{[ 6 ]}

参照

• ATP結合カセットトランスポーター

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000150967 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000029408 – Ensembl、2017年5月
3. 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Allikmets R, Gerrard B, Hutchinson A, Dean M (1997年2月). 「ヒトABCスーパーファミリーの特性評価：発現配列タグデータベースを用いた21個の新規遺伝子の単離とマッピング」Hum Mol Genet . 5 ( 10): 1649–55 . doi : 10.1093/hmg/5.10.1649 . PMID 8894702 . 
6. 「Entrez遺伝子：ABCB9 ATP結合カセット、サブファミリーB（MDR/TAP）、メンバー9」。

さらに読む

• Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). 「正規化と減算：遺伝子発見を促進する2つのアプローチ」 Genome Res 6 ( 9): 791–806 . doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID  8889548 .
• Zhang F, Zhang W, Liu L, et al. (2000). 「リソソームに局在するATP結合カセットタンパク質ABCB9の特性解析」 . J. Biol. Chem . 275 (30): 23287–94 . doi : 10.1074/jbc.M001819200 . PMID  10748049 .
• 永瀬 剛志、菊野 亮、石川 功、他 (2000). 「未同定ヒト遺伝子のコード配列の予測 XVII. 脳由来の新規cDNAクローン100個の完全配列。in vitroで巨大タンパク質をコードする」 . DNA Res . 7 (2): 143–50 . doi : 10.1093/dnares/7.2.143 . PMID  10819331 .
• 小林 明、笠野 正之、前田 毅、他 (2000). 「ABCトランスポーターの半分型TAPLはげっ歯類とヒトの間で高度に保存されており、ヒト遺伝子はTAP1およびTAP2とは異なりインターフェロンγに反応しない」 . J. Biochem . 128 (4): 711–8 . doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022805 . PMID  11011155 .
• 斉藤 誠、飯田 明、関根 明、他 (2002). 「日本人におけるATP結合カセットサブファミリーB（ABCB/MDR/TAP）の9つのメンバーをコードする遺伝子における326の遺伝的変異」 . J. Hum. Genet . 47 (1): 38– 50. doi : 10.1007/s10038-002-8653-6 . PMID  11829140 .
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウスの完全長cDNA配列の生成と初期解析」 . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• 小林 明、堀 誠、吹田 暢、前田 正治 (2003). 「抗原プロセシング様タンパク質（TAPL, ABCB9）に関連するヒトトランスポーターの遺伝子構成：選択的スプライシングバリアントとプロモーター活性の解析」Biochem. Biophys. Res. Commun . 309 (4): 815–22 . doi : 10.1016/j.bbrc.2003.08.081 . PMID  13679046 .
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• 本間 功、菊野 理恵、永瀬 毅、他 (2004). 「ヒト脳には不安定なタンパク質ドメインをコードする選択的スプライスバリアントが存在する」J. Mol. Biol . 343 (5): 1207–20 . doi : 10.1016/j.jmb.2004.09.028 . PMID  15491607 .
• Wolters JC, Abele R, Tampé R (2005). 「ホモ二量体ATP結合カセットトランスポーターTAP-like (ABCB9)によるペプチドの選択的かつATP依存性転座」 . J. Biol. Chem . 280 (25): 23631–6 . doi : 10.1074/jbc.M503231200 . PMID  15863492 .
• Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, et al. (2006). 「転写調節の多様化：ヒト遺伝子の推定代替プロモーターの大規模同定と特性解析」 . Genome Res . 16 (1): 55– 65. doi : 10.1101/gr.4039406 . PMC  1356129. PMID  16344560 .
• Ohashi-Kobayashi A, Ohashi K, Du WB, et al. (2006). 「酵母で発現させたヒトTAP様タンパク質（ABCB9）の薬剤耐性活性の検討」Biochem. Biophys. Res. Commun . 343 (2): 597– 601. doi : 10.1016/j.bbrc.2006.03.002 . PMID  16554024 .

外部リンク

• 米国国立医学図書館の医学主題標目表（MeSH）におけるABCB9+タンパク質、+ヒト
• UCSC ゲノム ブラウザのヒトABCB9ゲノムの位置とABCB9遺伝子の詳細ページ。

この記事には、パブリック ドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。

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