SCN2B

SCN2B

利用可能な構造

オーソログ検索: PDBe RCSB

PDB IDコードのリスト
2月5日、5月5日

識別子

エイリアス

SCN2B、ATFB14、ナトリウム電位依存性チャネルβサブユニット2

外部ID

オミム: 601327 ; MGI : 106921 ;ホモロジーン: 3373 ;ジーンカード: SCN2B ; OMA : SCN2B - オルソログ

遺伝子の位置（ヒト）

キリスト	11番染色体（ヒト）^{[ 1 ]}

バンド	11q23.3	始める	1億1816万2806塩基対^{[ 1 ]}
バンド	11q23.3	終わり	1億1817万6639塩基対^{[ 1 ]}

遺伝子の位置（マウス）

キリスト	9番染色体（マウス）^{[ 2 ]}

バンド	9 A5.2\|9 24.84 cM	始める	45,029,080 bp ^{[ 2 ]}
バンド	9 A5.2\|9 24.84 cM	終わり	45,041,368 bp ^{[ 2 ]}

RNA発現パターン

人間

マウス（相同遺伝子）

上位の表現

中側頭回
視床の外側核群
小脳皮質
小脳半球
前頭前皮質
小脳の右半球
小脳虫部
上前頭回
一次視覚野
右前頭葉

上位の表現

小脳葉
小脳虫部
外側膝状体
嗅結節
上丘
内側膝状体
ハベヌラ
外側中隔核
外側視床下部
内側背側核

より多くの参照表現データ


より多くの参照表現データ

遺伝子オントロジー
分子機能	心筋細胞の活動電位に関与する電位依存性ナトリウムチャネルの活性ナトリウムチャネル調節活性ナトリウムチャネル活性電位依存性ナトリウムチャネルの活性電位依存性イオンチャネル活性
細胞成分	膜の不可欠な構成要素電位依存性ナトリウムチャネル複合体膜
生物学的プロセス	化学シナプス伝達神経系の発達収縮に関与する心筋細胞の活動電位ナトリウムイオン輸送ナトリウムイオン膜輸送ナトリウムイオン膜輸送体の活性の調節心筋の収縮心臓伝導による心拍数の調節心房心筋細胞膜の脱分極の調節心筋細胞の活動電位中の膜の脱分極イオン膜輸送の調節イオン輸送ピレスロイドへの反応
出典：Amigo / QuickGO

オーソログ

種

人間

ねずみ

エントレズ


6327


72821

アンサンブル


ENSG00000149575


ENSMUSG00000070304

ユニプロット


O60939


Q56A07

RefSeq (mRNA)


NM_004588


NM_001014761

RefSeq（タンパク質）


NP_004579


NP_001014761

場所（UCSC）

11章: 118.16 – 118.18 Mb

9章: 45.03 – 45.04 Mb

PubMed検索

^{[ 3 ]}

^{[ 4 ]}

ウィキデータ

人間の表示/編集

マウスの表示/編集

ナトリウムチャネルサブユニットβ2は、ヒトではSCN2B遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[⁵^]^[⁶^]

参照

ナトリウムチャネル

参考文献

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000149575 – Ensembl、2017年5月
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000070304 – Ensembl、2017年5月
^ 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
^ 「マウスPubMedリファレンス：」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
^ Plummer NW, Meisler MH (1999年5月). 「哺乳類ナトリウムチャネル遺伝子の進化と多様性」. Genomics . 57 (2): 323–31 . doi : 10.1006/geno.1998.5735 . PMID 10198179 .
^ 「Entrez Gene: SCN2B ナトリウムチャネル、電位依存性、タイプ II、ベータ」。

さらに読む

Hartshorne RP, Catterall WA (1984). 「ラット脳由来ナトリウムチャネル．精製およびサブユニット組成」 . J. Biol. Chem . 259 (3): 1667–75 . doi : 10.1016/S0021-9258(17)43460-0 . PMID 6319405 .
Adams MD, Kerlavage AR, Fleischmann RD, et al. (1995). 「8300万ヌクレオチドのcDNA配列に基づくヒト遺伝子多様性と発現パターンの初期評価」(PDF) . Nature . 377 (6547 Suppl): 3–174 . PMID 7566098 .
Isom LL, Ragsdale DS, De Jongh KS, et al. (1996). 「脳ナトリウムチャネルβ2サブユニットの構造と機能：CAMモチーフを有する膜貫通型糖タンパク質」 . Cell . 83 ( 3): 433–42 . doi : 10.1016/0092-8674(95)90121-3 . PMID 8521473. S2CID 13998841 .
Eubanks J, Srinivasan J, Dinulos MB, et al. (1997). 「ヒト脳ナトリウムチャネルβ2サブユニットの構造と染色体局在」NeuroReport . 8 (12): 2775–9 . doi : 10.1097/00001756-199708180-00025 . PMID 9295116 . S2CID 21051920 .
Bolino A, Seri M, Caroli F, et al. (1999). 「CMT4Bの候補遺伝子としてのSCN2B遺伝子の除外」 . Eur. J. Hum. Genet . 6 (6): 629–34 . doi : 10.1038/sj.ejhg.5200220 . PMID 9887383 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウスの完全長cDNA配列の生成と初期解析」 . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
Clark HF, Gurney AL, Abaya E, et al. (2003). 「分泌タンパク質発見イニシアチブ（SPDI）：新規ヒト分泌タンパク質および膜貫通タンパク質同定のための大規模取り組み：バイオインフォマティクスによる評価」. Genome Res . 13 (10): 2265–70 . doi : 10.1101/gr.1293003 . PMC 403697. PMID 12975309 .
太田剛志、鈴木雄志、西川剛志、他 (2004). 「21,243個の完全長ヒトcDNAの完全配列決定と特性解析」 Nat . Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクト：哺乳類遺伝子コレクション（MGC）の現状、品質、および拡大」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928. PMID 15489334 .
Kim DY, Ingano LA, Carey BW, et al. (2005). 「プレセニリン/γセクレターゼを介した電位依存性ナトリウムチャネルβ2サブユニットの切断は細胞接着と遊走を制御する」 . J. Biol. Chem . 280 (24): 23251–61 . doi : 10.1074/jbc.M412938200 . PMID 15833746 .

外部リンク

SCN2B+タンパク質、+ヒト（米国国立医学図書館医学件名表題集（MeSH））
PDBe-KBの UniProt : O60939 (ナトリウムチャネルサブユニットベータ-2)のPDBで利用可能なすべての構造情報の概要。

この記事には、パブリックドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。

膜輸送タンパク質：イオンチャネル（TC 1A）

Ca ²⁺ :カルシウムチャネル

リガンド依存性	イノシトールトリスリン酸受容体 1 2 3 リアノジン受容体 1 2 3
電圧制御型	L型/ Ca _v α 1.1 1.2 1.3 1.4 N型/ Ca _v α2.2 P型/ Ca _v α 2.1 Q型/ Ca _v α2.1 R型/ Ca _v α2.3 T型/ Ca _v α 3.1 3.2 3.3 α ₂ δサブユニット 1 2 βサブユニット β1 β2 β3 β4 γサブユニット γ1 γ2 γ3 γ4 精子の陽イオンチャネル 1 2 3 4 2孔チャネル 1 2

Na ⁺：ナトリウムチャネル

恒常活性	上皮性ナトリウムチャネル α β γ δ
プロトンゲート	アミロライド感受性陽イオンチャネル 1 2 3 4
電圧制御型	Na _v α 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na _v β 1 2 3 4

K ⁺ :カリウムチャネル

カルシウム活性化	BKチャンネル α1 β1 β2 β3 β4 SKチャンネル SK1 SK2 SK3 IKチャンネル IK1 カリウム_{カルシウム} 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1
内向き整流器	K _ATP キル 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 ギルク/キル 3.1 3.2 3.3 3.4 キル 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1
タンデムポアドメイン	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18
電圧制御型	K _v α1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K _v α7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1/hERG 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K _v β 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISKのようなミールピー 1 2 3 シェイカー（遺伝子）

その他

Cl ⁻ :塩化物チャネル	カルシウム活性化塩素イオンチャネルアノクタミン ANO1 ベストロフィン 1 2 塩化物チャネルアクセサリ 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 かあさん KB クリック 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B
H ⁺ :プロトンチャネル	HVCN1
M ⁺ : CNG陽イオンチャネル	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4
M ⁺ : TRPカチオンチャネル	TRPA ( 1 ) TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6
H ₂ O (+溶質):ポリン	アクアポリン 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 電圧依存性アニオンチャネル 1 2 3 一般的な細菌ポリンファミリー
細胞質：ギャップ結合	コネキシンあ GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 イネキシン

ゲート機構により

イオンチャネルクラス	リガンド依存性光ゲート電圧制御型ストレッチ起動

障害も参照

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