ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| CLCC1 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | CLCC1、MCLC、塩化物チャネルCLIC類似1 |
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| 外部ID | オミム:617539; MGI : 2385186;ホモロジーン:9032;ジーンカード:CLCC1; OMA :CLCC1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 3番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 3|3 F3 | 始める | 108,561,229 bp [2] |
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| 終わり | 108,586,156 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - 上腕二頭筋腱
- 口腔粘膜細胞
- アキレス腱
- 内淡蒼球
- 子宮内膜間質細胞
- 膵臓の体
- ランゲルハンス島
- 腓腹筋
- 結腸上皮
- 脳梁
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| | 上位の表現 | - 精母細胞
- 精嚢
- 肋間筋
- 一次卵母細胞
- 右腎臓
- 耳下腺
- 小脳葉
- 中央隆起
- 生殖腺隆起
- 太ももの筋肉
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 | - 膜の不可欠な構成要素
- ゴルジ体
- 小胞体
- 膜
- 核
- 塩化物チャネル複合体
- 細胞内膜小器官
| | 生物学的プロセス | | | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オーソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_015127 NM_001048210 NM_001278202 NM_001278203 |
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NM_001177770 NM_001177771 NM_145543 NM_001355632 |
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| RefSeq(タンパク質) | NP_001041675 NP_001265131 NP_001265132 NP_055942 NP_001364387
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NP_001364388 NP_001364389 NP_001364390 NP_001364391 NP_001364392 NP_001364393 NP_001364394 NP_001364395 NP_001364396 NP_001364397 NP_001364398 NP_001364399 |
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NP_001171241 NP_001171242 NP_663518 NP_001342561 |
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| 場所(UCSC) | 1 章: 108.93 – 108.96 Mb | 3 章: 108.56 – 108.59 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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塩化物チャネルCLIC様1(CLCC1とも呼ばれる )はヒト遺伝子である。[5] [6]
この遺伝子によってコードされるタンパク質は塩素イオンチャネルであり、S . cerevisiaeのMID-1伸張活性化チャネルと配列的に類似している。CLCC1は、小胞体やゴルジ体を含む細胞内コンパートメントの膜に局在する。精巣で高発現し、脾臓、肝臓、腎臓、心臓、脳、肺でも中等度の発現を示す。[6]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000121940 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000027884 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 永瀬 剛志、石川 功、須山 正治、菊野 亮、宮島 暢志、田中 明、小谷 秀、野村 暢志、小原 修 (1998年10月). 「未同定ヒト遺伝子のコード配列の予測. XI. 脳由来の新規cDNAクローン100個の完全配列。in vitroで巨大タンパク質をコードする」. DNA Res . 5 (5): 277–86 . doi : 10.1093/dnares/5.5.277 . PMID 9872452.
- ^ ab 長澤 正之、神崎 正之、飯野 雄二、森下 雄二、小島 郁夫 (2001年6月). 「小胞体、ゴルジ体、核に発現する新規塩素イオンチャネルの同定」. J. Biol. Chem . 276 (23): 20413–8 . doi : 10.1074/jbc.M100366200 . PMID 11279057.
さらに読む
- 永瀬 剛志、石川 功、須山 正之、他 (1998). 「未同定ヒト遺伝子のコード配列の予測 XI. 脳由来の新規cDNAクローン100個の完全配列(in vitroで巨大タンパク質をコードする). DNA Res . 5 (5): 277–86 . doi : 10.1093/dnares/5.5.277 . PMID 9872452.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2002). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- 木村 功、若松 明、鈴木 雄一、他 (2006). 「転写調節の多様化:ヒト遺伝子の推定代替プロモーターの大規模同定と特性解析」Genome Res . 16 (1): 55– 65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560 .
- 鈴木雄三、山下亮、城田正之、他 (2004). 「ヒトとマウスの遺伝子の配列比較により、プロモーター領域に相同ブロック構造が明らかになった」. Genome Res . 14 (9): 1711–8 . doi :10.1101/gr.2435604. PMC 515316. PMID 15342556 .
- 長沢正之、神崎正之、飯野雄一、他 (2001). 「小胞体、ゴルジ体、核に発現する新規塩素イオンチャネルの同定」J. Biol. Chem . 276 (23): 20413–8 . doi : 10.1074/jbc.M100366200 . PMID 11279057.
- 太田 剛志、鈴木 雄志、西川 剛志、他 (2004). 「21,243個の完全長ヒトcDNAの完全配列決定と特性解析」Nat. Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039.
外部リンク
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| リガンド依存性 | |
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| 電圧制御型 | - L型/ Ca v α
- N型/ Ca v α2.2
- P型/ Ca v α
- Q型/ Ca v α2.1
- R型/ Ca v α2.3
- T型/ Ca v α
- α 2 δサブユニット
- βサブユニット
- γサブユニット
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