ヒトのタンパク質コード遺伝子
SCN3A 識別子 エイリアス SCN3A 、NAC3、Nav1.3、ナトリウム電位依存性チャネルαサブユニット3、FFEVF4、EIEE62、DEE62 外部ID オミム : 182391; MGI : 98249; ホモロジーン :56005; ジーンカード :SCN3A; OMA :SCN3A - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) キリスト 染色体2(マウス) [2] バンド 2 C1.3|2 38.55 cM 始める 65,287,462 bp [2] 終わり 65,397,971 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) 上位の表現 内皮細胞 中側頭回 嗅内皮質 ブロードマン野23 眼窩前頭皮質 海馬固有部I領域 中心後回 ブロードマン領域46 小脳虫部 上前頭回
上位の表現 上頸部神経節 ハベヌラ 背側線条体 リンパ管の内皮細胞 視床下部背内側核 腹内側核 梨状皮質 視床下部室傍核 三叉神経節 腹側被蓋野
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遺伝子オントロジー 分子機能 ナトリウムチャネル活性 電位依存性イオンチャネル活性 イオンチャネル活性 電位依存性ナトリウムチャネルの活性 細胞成分 電位依存性ナトリウムチャネル複合体 細胞質 膜の不可欠な構成要素 膜 細胞膜 軸索 生物学的プロセス 活動電位中の膜の脱分極 ナトリウムイオン膜輸送 ナトリウムイオン輸送 イオン膜輸送の調節 イオン輸送 膜輸送 イオン膜輸送 神経活動電位 出典:Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001081676 NM_001081677 NM_006922
NM_018732 NM_001355166 NM_001355167 NM_001355168 NM_001355169 NM_001355170 NM_001355171
RefSeq(タンパク質) NP_001075145 NP_001075146 NP_008853
NP_001342095 NP_001342096 NP_001342097 NP_001342098 NP_001342099 NP_001342100 NP_061202
場所(UCSC) 2番目の文字: 165.09 – 165.2 Mb 2章: 65.29 – 65.4 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
電位依存性ナトリウムチャネルIII型αサブユニット ( SCN3A )は 、ヒトでは SCN3A 遺伝子 によってコードされる タンパク質 である。 [5] [6]
関数 電位依存性 ナトリウムチャネル は、24の膜貫通ドメインを持つ大きなαサブユニットと1つ以上の調節性βサブユニットからなる 膜貫通 糖タンパク質 複合体です。ニューロンおよび筋肉における 活動電位 の発生と伝播を担っています。この遺伝子は、ナトリウムチャネルαサブユニット遺伝子ファミリーの一員をコードし、2番染色体上の5つのαサブユニット遺伝子からなるクラスターに存在します。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする複数の転写バリアントが見つかっています。 [6]
SCN3Aは、 ヒトの 大脳皮質の折り畳みである脳 回形成 に関与しており、言語生成に関わる脳領域に影響を与えます。 [7]
参考文献 ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000153253 – Ensembl 、2017年5月 ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000057182 – Ensembl 、2017年5月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ “UniProt”. www.uniprot.org . 2022年 7月24日 閲覧 。 ^ ab "Entrez Gene: SCN3A ナトリウムチャネル、電位依存性、タイプ III、アルファサブユニット". ^ Smith RS, Kenny CJ, Ganesh V, Jang A, Borges-Monroy R, Partlow JN, et al. (2018年9月). 「ナトリウムチャネルSCN3A(NaV1.3)によるヒト大脳皮質のフォールディングと口腔運動発達の調節」. Neuron . 99 (5): 905–913.e7. doi :10.1016/j.neuron.2018.07.052. PMC 6226006. PMID 30146301 .
さらに読む Catterall WA, Goldin AL, Waxman SG (2005年12月). 「国際薬理学連合. XLVII. 電位依存性ナトリウムチャネルの命名法と構造機能相関」. 薬理学レビュー . 57 (4): 397– 409. doi :10.1124/pr.57.4.4. PMID 16382098. S2CID 7332624. Malo MS, Srivastava K, Andresen JM, Chen XN, Korenberg JR, Ingram VM (1994年4月). 「低ストリンジェンシーポリメラーゼ連鎖反応による標的遺伝子ウォーキング:ヒト脳ナトリウムチャネル遺伝子(SCN3A)の染色体2q24-31への割り当て」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 91 (8): 2975–9 . Bibcode :1994PNAS...91.2975M. doi : 10.1073/pnas.91.8.2975 . PMC 43497. PMID 8159690 . Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1996年9月). 「正規化と減算:遺伝子発見を促進する2つのアプローチ」. Genome Research . 6 (9): 791–806 . doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548. Lu CM, Brown GB (1998年2月). 「ヒト脳ナトリウムチャネル遺伝子の単離:サブタイプIIIαサブユニットの2つのアイソフォームをコードする」. Journal of Molecular Neuroscience . 10 (1): 67– 70. doi :10.1007/BF02737087. PMID 9589372. S2CID 2533542. 永瀬 剛志、菊野 亮、石川 紀雄、広澤 正之、小原 修 (2000年2月). 「未同定ヒト遺伝子のコード配列の予測 XVI. 脳由来の新規cDNAクローン150個の完全配列はin vitroで巨大タンパク質をコードする」 DNA Research . 7 (1): 65– 73. doi : 10.1093/dnares/7.1.65 . PMID 10718198. Gotthardt M, Trommsdorff M, Nevitt MF, Shelton J, Richardson JA, Stockinger W, Nimpf J, Herz J (2000年8月). 「低密度リポタンパク質受容体遺伝子ファミリーと細胞質アダプターおよび足場タンパク質との相互作用は、細胞内コミュニケーションおよびシグナル伝達における多様な生物学的機能を示唆している」 The Journal of Biological Chemistry . 275 (33): 25616–24 . doi : 10.1074/jbc.M000955200 . PMID 10827173. Chen YH, Dale TJ, Romanos MA, Whitaker WR, Xie XM, Clare JJ (2000年12月). 「ヒト脳由来のIII型ナトリウムチャネルのクローニング、分布および機能解析」. ヨーロッパ神経科学誌 . 12 (12): 4281–9 . doi :10.1046/j.1460-9568.2000.01336.x. PMID 11122339. 葛西 N、福島 K、植木 Y、プラサド S、ノサコウスキー J、菅田 K、菅田 A、西崎 K、マイヤー NC、スミス RJ (2001 年 2 月)。 「SCN2A および SCN3A のゲノム構造 - DFNA16 遺伝子座における難聴の候補遺伝子」。 遺伝子 。 264 (1): 113–22 . 土井 :10.1016/S0378-1119(00)00594-1。 PMID 11245985。 Whitaker WR, Faull RL, Dragunow M, Mee EW, Emson PC, Clare JJ (2001). 「ヒトてんかん性海馬における電位依存性ナトリウムチャネルII型およびIII型をコードするmRNAの変化」. Neuroscience . 106 (2): 275–85 . doi :10.1016/S0306-4522(01)00212-3. PMID 11566500. S2CID 26385238. Weiss LA, Escayg A, Kearney JA, Trudeau M, MacDonald BT, Mori M, Reichert J, Buxbaum JD, Meisler MH (2003年2月). 「家族性自閉症におけるナトリウムチャネルSCN1A、SCN2A、およびSCN3A」. Molecular Psychiatry . 8 (2): 186–94 . doi :10.1038/sj.mp.4001241. PMID 12610651. S2CID 16606651. Shah BS, Rush AM, Liu S, Tyrrell L, Black JA, Dib-Hajj SD, Waxman SG (2004年8月). 「コンタクチンは天然組織においてナトリウムチャネルNav1.3と会合し、細胞表面におけるチャネル密度を増加させる」. The Journal of Neuroscience . 24 (33): 7387–99 . doi : 10.1523/JNEUROSCI.0322-04.2004 . PMC 6729770. PMID 15317864 . Thimmapaya R, Neelands T, Niforatos W, Davis-Taber RA, Choi W, Putman CB, Kroeger PE, Packer J, Gopalakrishnan M, Faltynek CR, Surowy CS, Scott VE (2005年7月). 「ヒトNav1.3スプライスバリアントの分布と機能的特徴」. ヨーロッパ神経科学誌 . 22 (1): 1– 9. doi :10.1111/j.1460-9568.2005.04155.x. PMID 16029190. S2CID 30185095. Platoshyn O, Remillard CV, Fantozzi I, Sison T, Yuan JX (2005年11月). 「培養ヒト肺動脈平滑筋細胞における機能的電位依存性Na(+)チャネルの同定」. Pflügers Archiv . 451 (2): 380– 387. doi :10.1007/s00424-005-1478-3. PMC 1351366. PMID 16052353 . 木村和也、若松A、鈴木裕、太田隆、西川隆、山下R、山本J、関根M、釣谷和、若栗H、石井S、杉山隆、斉藤和、磯野Y、入江R、櫛田N、米山隆、大塚R、神田K、横井隆、近藤H、我妻M、村川隆、石田S、石橋隆、高橋・藤井A、棚瀬隆、永井和、菊池英、中井和、磯貝 哲、菅野 S(2006年1月)。 「転写調節の多様化: ヒト遺伝子の推定上の代替プロモーターの大規模な同定と特性評価」。 ゲノム研究 。 16 (1): 55–65 。 土井 :10.1101/gr.4039406。 PMC 1356129 。 PMID 16344560。 Martin MS, Tang B, Ta N, Escayg A (2007年8月). 「電位依存性ナトリウムチャネルSCN1A、SCN2A、およびSCN3Aの5'非翻訳領域の特性解析とシス保存非コード配列の同定」. Genomics . 90 (2): 225–35 . doi :10.1016/j.ygeno.2007.04.006. PMC 2637551. PMID 17544618 .
外部リンク SCN3A+タンパク質、+ヒト、米国国立医学図書館 医学件名表題集 (MeSH)
リガンド依存性 電圧制御型 L型 / Ca v α N型 / Ca v α2.2 P型 / Ca v α Q型 / Ca v α2.1 R型 / Ca v α2.3 T型 / Ca v α α 2 δサブユニット βサブユニット γサブユニット
この記事には、 パブリック ドメイン である 米国国立医学図書館 のテキストが組み込まれています。