GPR113
| ADGRF3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 識別子 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| エイリアス | ADGRF3、PGR23、hGPCR37、GPR113、接着Gタンパク質共役受容体F3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | MGI : 2685887; HomoloGene : 17826; GeneCards : ADGRF3; OMA :ADGRF3 - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| ウィキデータ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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GPR113は、おそらくGタンパク質共役受容体113タンパク質をコードする遺伝子である。[5] [6]
遺伝子
ヒトGPR113遺伝子は2番染色体（2p23.3）に位置し、マイナス鎖上の塩基26531041から26569685までの38.65kbの領域に広がっています。[7] GPR113遺伝子はマイナス鎖の両側に2つの隣接遺伝子、すなわちOTOF（オトフェリン）とHADHA（ヒドロキシアシルCoA）を先行して有します。プラス鎖上でGPR113の真向かいにはEPT1遺伝子が存在します。GPR113遺伝子は、PGR23およびHGPCR37という別名でも知られています。[8]
進化
GPR113には、ヒトにおいてGPR110、GPR115、GPR128、GPR111、GPR116の5つのパラログが存在する。[8] GPR113は、霊長類から半水生種、そして一部の両生類に至るまで、哺乳類においてよく保存されている。これらには、チンパンジー、アフリカゾウ、カモノハシ、ニシツメガエルなどが含まれる。[9]オーソログ全体でよく保存されている相同ドメインは、図中で紫色で強調されている7つの膜貫通型受容体（セクレチンファミリー）領域に集中している。[10]
タンパク質
GPR113遺伝子のタンパク質産物はGタンパク質共役受容体である。このタンパク質はヒトにおいて3つの転写バリアントを持つ。[11]この3つのうち、GPR113バリアント1は最も長いアミノ酸配列を持ち、相同遺伝子との同一性が最も高い。このことから、GPR113バリアント1は祖先GPR113遺伝子のホモサピエンスの子孫であるという結論が導かれる。GPR113バリアント1は1079個のアミノ酸を含み、細胞膜に不可欠である。[12] 7回膜貫通型受容体には、右の図で強調表示されている4つのドメイン、シグナルペプチド（赤）、ホルモン受容体ドメイン（青）、ラトロフィリン/CL-1様GPSドメイン（オレンジ）、および7回膜貫通型受容体（紫）が含まれる。ホルモン受容体ドメインとGPSの間には、強調表示されていない機能不明のドメインがある。
関数
GPR113は神経ペプチドシグナル伝達経路に関与するGタンパク質共役受容体である。 [12]
臨床的意義
GPR113は、疾患状態下で異なる発現を示すことがわかっている。2型糖尿病の状態では、他の転写産物に対するパーセンタイル順位は、正常細胞機能と比較して低下する。[13]多種多様な重要な身体プロセスを媒介するTP63の欠失も、GPR113発現の減少を引き起こす。 [14]マウスの脳では、小脳と嗅球の両方でGPR113遺伝子の転写が見られる。[15]さらに、国立聴覚・コミュニケーション障害研究所の研究では、GPR113の発現は味覚受容体細胞のサブセットに非常に限定されていることが明らかになった。[16]この論文の結論は、嗅球の発現レベルと相まって、将来の研究への道を開き、GPR113の機能についてより多くを明らかにする可能性がある。
相互作用するタンパク質
GPR113は、オーファンGタンパク質共役受容体GPR123と関連することが示されている。[17]
転写因子
| 最も可能性の高い転写因子トップ10 [18] |
|---|
| S8型ホメオドメインの結合部位 |
| S8型ホメオドメインの結合部位 |
| DLX-1、-2、および-5結合部位 |
| TCF/LEF-1（二次DNA結合優先性） |
| 生殖細胞特異的転写因子NOBOXを含むホメオボックス |
| Spalt様転写因子1 |
| 転写抑制因子CDP |
| FOXP1の選択的スプライシング変異体、ES細胞で活性化 |
| S8型ホメオドメインの結合部位 |
| 生殖細胞特異的転写因子NOBOXを含むホメオボックス |
臨床的意義
このタンパク質の臨床的意義はまだ確立されていません。しかしながら、その発現プロファイルは、特に味覚と嗅覚の研究分野において、GPR113遺伝子の今後の研究に刺激的な方向性を示しています。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000173567 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000067642 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ Fredriksson R, Lagerström MC, Höglund PJ, Schiöth HB (2002年11月). 「GPSドメインとSer/Thrに富む領域を含む長いN末端を持つ新規ヒトGタンパク質共役受容体」. FEBS Letters . 531 (3): 407– 414. doi : 10.1016/S0014-5793(02)03574-3 . PMID 12435584. S2CID 7449692.
- ^ 「Entrez Gene: GPR113 Gタンパク質共役受容体113」。
- ^ 「ホモ・サピエンス染色体2、GRCh37.p13 一次アセンブリ」。ヌクレオチド。米国国立医学図書館。2013年8月13日。
- ^ ab "ADGRF3 遺伝子 - GeneCards | AGRF3 タンパク質 | AGRF3 抗体".
- ^ 「BLAST: 基本的なローカルアライメント検索ツール」。
- ^ 「SDSC 生物学ワークベンチ」。
- ^ 「ホモサピエンス接着Gタンパク質共役受容体F3（ADGRF3）、転写バリアント2、mRNA」。ヌクレオチド。米国国立医学図書館。2018年6月24日。
- ^ ab "ADGRF3 - 接着Gタンパク質結合受容体F3前駆体 - ホモサピエンス（ヒト） - ADGRF3遺伝子とタンパク質".
- ^ 「ADGRF3 - 2型糖尿病とヘパトカインの役割」GEOプロファイル。米国国立生物工学情報センター（NCBI）。71224040。
- ^ 「ADGRF3 - p63枯渇効果」GEOプロファイル. 米国国立生物工学情報センター（NCBI）. 34655140.
- ^ 「Gタンパク質共役受容体113」。アレン脳アトラス：マウス脳。
- ^ LopezJimenez ND, Sainz E, Cavenagh MM, Cruz-Ithier MA, Blackwood CA, Battey JF, et al. (2005年4月). 「ファミリー2のGタンパク質共役受容体をコードする2つの新規遺伝子Gpr113とTrcg1は、味覚受容体細胞で選択的に発現する」Genomics . 85 (4): 472– 482. doi :10.1016/j.ygeno.2004.12.005. PMID 15780750.
- ^ “STRING: 機能性タンパク質関連ネットワーク”. 2013年5月15日時点のオリジナルよりアーカイブ。2013年5月12日閲覧。
- ^ “エルドラド入門”. 2021年5月22日時点のオリジナルよりアーカイブ。2013年5月12日閲覧。
さらに読む
- 武田 誠・門脇 誠・芳賀 剛・高江洲 秀・三宅 誠 (2002年6月). 「ヒトゲノム配列からのGタンパク質共役受容体遺伝子の同定」. FEBS Letters . 520 ( 1–3 ): 97–101 . doi : 10.1016/S0014-5793(02)02775-8 . PMID 12044878. S2CID 7116392.
- Vassilatis DK, Hohmann JG, Zeng H, Li F, Ranchalis JE, Mortrud MT, 他 (2003年4月). 「ヒトおよびマウスのGタンパク質共役受容体レパートリー」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 100 (8): 4903– 4908. Bibcode : 2003PNAS..100.4903V. doi : 10.1073/pnas.0230374100 . PMC 153653. PMID 12679517 .
- ビャルナドッティル TK、フレドリクソン R、ヘグルンド PJ、グロリアム DE、ラーゲルストローム MC、シオス HB (2004 年 7 月)。 「Gタンパク質共役受容体の接着ファミリーのヒトおよびマウスのレパートリー」。ゲノミクス。84 (1): 23–33 .土井:10.1016/j.ygeno.2003.12.004。PMID 15203201。
