RUNX3

RUNX3
識別子
別名	RUNX3、AML2、CBFA3、PEBP2aC、ラント関連転写因子3、RUNXファミリー転写因子3
外部ID	OMIM : 600210 ; MGI : 102672 ; HomoloGene : 37914 ; GeneCards : RUNX3 ; OMA : RUNX3 - オーソログ
遺伝子の位置（ヒト）
染色体	1番染色体（ヒト）
終了	24,965,121 bp
遺伝子の位置（マウス）
染色体	4番染色体（マウス）
終了	134,905,301 bp
RNA発現パターン
	最もよく発現している
	顆粒球; 頬粘膜細胞; リンパ節; 血液; 虫垂; 単核細胞; 脛骨; 脾臓; 単球; 骨髄細胞;
	最もよく発現している
	膜状骨; 皮膚頭蓋; 下顎骨; 脾臓; 腸間膜リンパ節; 鎖骨; 血液; 舌; 尿道; 上顎;
	より多くの参照発現データ
	より多くの参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能	DNA結合; RNAポリメラーゼII転写調節領域配列特異的DNA結合; DNA結合転写因子活性; タンパク質結合; ATP結合; DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的;
細胞構成要素	細胞質; 核; 核小体; 細胞内膜小器官; 核質; 細胞質; コア結合因子複合体;
生物学的プロセス	末梢神経系ニューロンの発達; DNAテンプレート転写の調節; 軟骨細胞の分化; 骨化; RNAポリメラーゼIIによる転写の調節; 細胞周期の負の調節; RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御; RNAポリメラーゼIIによる転写; DNAテンプレート転写; DNAテンプレート転写の正の制御; タンパク質リン酸化; 上皮細胞増殖の負の調節; 細胞分化の調節; トランスフォーミング成長因子ベータへの反応; 造血; CD4陽性αβT細胞分化の負の制御; CD8陽性αβT細胞分化の正の調節; ニューロンの分化;
	出典：Amigo / QuickGO
相同遺伝子
	864
	12399
	ENSG00000020633
	ENSMUSG00000070691
	Q13761
	Q3U1Q3
	NM_001031680 NM_004350 NM_001320672
	NM_019732 NM_001369050
	NP_001026850 NP_001307601 NP_004341
	NP_062706 NP_001355979
	ウィキデータ
ヒトの表示/編集	マウスの表示/編集

ラント関連転写因子3は、ヒトではRUNX3遺伝子によってコードされるタンパク質です。^[⁵^]

機能

この遺伝子は、ラントドメインを含む転写因子ファミリーのメンバーをコードしています。このタンパク質とβサブユニットのヘテロ二量体は、多くのエンハンサーやプロモーターに存在するコアDNA配列5'-YGYGGT-3'に結合する複合体を形成し、^{[ 6 ]}転写を活性化または抑制することができます。また、他の転写因子と相互作用します。腫瘍抑制因子として機能し、癌ではこの遺伝子は頻繁に欠失または転写サイレンシングされます。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする複数の転写バリアントが見つかっています。^{[ 7 ]}

メラノサイト細胞ではRUNX3遺伝子の発現はMITFによって制御されている可能性がある。^{[ 8 ]}

RUNX3は、早期腫瘍形成に対する防御において基本的な役割を果たします。成長因子への応答として、RUNX3はp300によってアセチル化され、ブロモドメイン含有タンパク質2（BRD2；転写共調節因子BETファミリーの一員）と複合体を形成します^{[ 9 ]}。そして、CDKN1AとARFが一過性に誘導されます^{[ 10 ]}。CDKN1A（CIP1またはp21としても知られる）は細胞周期を阻害し、ARFはMDM2を阻害することで、癌抑制遺伝子p53の安定性を高めます^{[ 10 ] 。}

野生型細胞周期におけるCDKN1AおよびARFの発現は一時的であり、これはRUNX3 -BRD2複合体がRUNX3 -cyclinD1複合体を置換することによって生じる。しかし、 KRAS ^G12Dなどの発癌性ミトゲンシグナルはRUNX3 -BRD2複合体を持続的に維持させ、結果としてp21、ARF、p53の持続的な発現につながる。したがって、RUNX3は制御されていないミトゲンシグナルのセンサーとして機能し、その不活性化はセンサー機能の喪失により最終的に癌化につながる可能性がある。^{[ 10 ]}

ノックアウトマウス

Runx3ヌルマウスの胃粘膜は、上皮細胞の増殖刺激とアポトーシス抑制により過形成を示し、細胞はTGF-β刺激に対して抵抗性を示します。^{[ 11 ]}

RUNX3の論争と解決

2011年に、Liと同僚らによる以前の論文をきっかけに、Runx3の腫瘍抑制機能に疑問が投げかけられた。^{[ 12 ]} Liと同僚らによる最初の研究（2002年）に基づき、Liと同僚ら（2002年）を引用しているその後の文献の大部分は、RUNX3は正常な腸管上皮で発現しており、そのため調査対象の特定の上皮癌において腫瘍抑制因子として機能する可能性が高いと仮定していた。この文献の大部分は、様々な癌におけるRUNX3プロモーターのメチル化状態を、その発現の代理として用いていた。しかし、腫瘍細胞ゲノムではメチル化されている遺伝子がかなり多く知られており、これらの遺伝子の大部分はこれらの癌の発生源である正常組織では発現していない。他の研究者は、 RUNX3タンパク質を検出するために、特性が十分に解明されていない（あるいは完全に無効とされている）抗体を用いたり、RT-PCRや検証済みの抗体を用いても腸管上皮におけるRUNX3の検出に失敗したが、それでもLiら（2002年）による当初の発見に疑問を呈することはなかった。これらの事実は、最近、Ülo Maiväliの著書で議論されている。^{[ 13 ]}

2009 年後半、伊藤耕生氏と彼の同僚らが執筆した報告書は、RUNX3 が実際にヒトおよびマウスの消化管 (GIT) 上皮で発現しており、胃および結腸直腸組織で腫瘍抑制因子として機能することを確認して論争に終止符を打った。^{[ 14 ]}論文の著者らは、以前の矛盾した報告は、G-poly として知られる特定の抗体の使用に起因する可能性があると示唆した。伊藤氏と彼のチームは、RUNX3 のN 末端領域 (残基 1-234) を認識する複数の抗RUNX3モノクローナル抗体を生成した。研究者らは、これらの抗体が胃上皮細胞のRUNX3と反応するが、C 末端領域を認識する抗体は反応しないことを発見した。G-poly は主に 234 を超える領域を認識するため、この組織でRunx3 を検出できない。