ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
NFIX 識別子 エイリアス NFIX 、MRSHSS、NF1A、SOTOS2、核因子IX、NF1-X、NF-I/X、CTF、MALNS 外部ID オミム :164005; MGI : 97311; ホモロジーン : 1872; ジーンカード :NFIX; OMA :NFIX - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) キリスト 8番染色体(マウス) [2] バンド 8 C2|8 41.02 cM 始める 84,699,876 bp [2] 終わり 84,800,344 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) 上位の表現 乳首 神経節隆起 迷走神経下神経節 中心後回 内淡蒼球 腹側被蓋野 上腕二頭筋腱 口腔粘膜細胞 噴門 尿道
上位の表現 吻側回遊流 内頸動脈 外頸動脈 足首 卵形嚢 大動脈領域の中膜 鉤状部 上行大動脈 涙腺 蝸牛管の前庭膜
より多くの参照表現データ
バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 DNA結合転写因子活性 転写因子活性、RNAポリメラーゼII遠位エンハンサー配列特異的結合 DNA結合 タンパク質結合 DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 細胞成分 生物学的プロセス DNA複製 転写の制御、DNAテンプレート RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御 RNAポリメラーゼIIによる転写 転写、DNAテンプレート RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 出典:Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001271043 NM_001271044 NM_002501 NM_001365902 NM_001365982 NM_001365983 NM_001365984 NM_001365985 NM_001378404 NM_001378405
NM_001081981 NM_001081982 NM_001297601 NM_010906
RefSeq(タンパク質) NP_001257972 NP_001257973 NP_002492 NP_001352831 NP_001352911 NP_001352912 NP_001352913 NP_001352914 NP_001365333 NP_001365334
NP_001075450 NP_001075451 NP_001284530 NP_035036 NP_001357981 NP_001357982 NP_001357983 NP_001357984 NP_001357985 NP_001357986 NP_001357987 NP_001357988 NP_001357989 NP_001357990 NP_001357991 NP_001357992
場所(UCSC) 19章13節~13.1節 8章: 84.7 – 84.8 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
核因子1X型 は、ヒトでは NFIX 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6] [7] NFIXの スプライスバリアント であるNFI-X3は、 アストロサイト の グリア線維性酸性タンパク質 と YKL-40 を制御する。 [8]
相互作用 NfixはSKIタンパク質 と 相互作用する ことが示されており [9] 、 AP-1 と相互作用することも知られている [8 ] 。NFI -X3は STAT3 と相互作用することが示されている [8] 。
胚細胞において、Nfixは タンパク質インスキュタブル(INSC)の転写を促進することで 中間前駆細胞(IPC)の生成を制御することが示されています。INSCは紡錘体の配向を制御し、 放射状グリア細胞 からIPCへの分裂を促進します。Nfixは、グリア細胞子孫細胞を中間前駆細胞へと分化させるのに必須であると考えられています。変異は、放射状グリア細胞の過剰産生、IPCの発達障害や不適切な時期、そしてニューロンの産生不足を引き起こす可能性があります。 [10]
成人の発達において、神経分化のタイミングはNfixによって制御され、 海馬 の継続的な成長と適切な記憶機能を促進します。Nfixは オリゴデンドロサイトの発現を抑制することで、細胞が 歯状回 内でニューロンの発達に専念できるようにします 。中間前駆細胞は分裂して 神経芽細胞を 生成します。NfixヌルIPCによって生成されたニューロンは成熟せず、通常は死滅し、認知障害の一因となる可能性があります。 [11]
Nfixはミオスタチン と相互作用し 、ミオスタチン発現の調節を通じて筋再生の時間的進行を制御する。また、Nfixは遅筋表現型を阻害する。 [12] [13]
参考文献 ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000008441 – Ensembl 、2017年5月 ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000001911 – Ensembl 、2017年5月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ Seisenberger C, Winnacker EL, Scherthan H (1993年7月). 「ヒト核因子I/X(NFI/X)遺伝子の染色体19p13への局在と、FISH法による1p21-22、1q42-43、5q15、11p13、20q13の5つの関連遺伝子座の検出」. Human Genetics . 91 (6): 535– 537. doi :10.1007/bf00205076. PMID 8340106. S2CID 22365562. ^ Qian F, Kruse U, Lichter P, Sippel AE (1995年7月). 「FISH法によるヒト転写因子核因子Iの4つの遺伝子(NFIA、B、C、X)の染色体局在」. Genomics . 28 (1): 66– 73. doi :10.1006/geno.1995.1107. PMID 7590749. ^ 「Entrez Gene: NFIX 核因子 I/X (CCAAT 結合転写因子)」。 ^ abc Singh SK, Bhardwaj R, Wilczynska KM, Dumur CI, Kordula T (2011年11月). 「核因子I-X3とSTAT3の複合体は分泌糖タンパク質YKL-40を介してアストロサイトおよび神経膠腫の移動を制御する」. The Journal of Biological Chemistry . 286 (46): 39893– 39903. doi : 10.1074 / jbc.M111.257451 . PMC 3220556. PMID 21953450. ^ Tarapore P, Richmond C, Zheng G, Cohen SB, Kelder B, Kopchick J, et al. (1997年10月). 「NFIとの相互作用を介したSkiオンコプロテインによるDNA結合および転写活性化」. Nucleic Acids Research . 25 (19): 3895– 3903. doi :10.1093/nar/25.19.3895. PMC 146989. PMID 9380514 . ^ Harris L, Zalucki O, Gobius I, McDonald H, Osinki J, Harvey TJ, et al. (2016年12月). 「海馬発達における中間前駆細胞生成の転写制御」. Development . 143 (24): 4620– 4630. doi : 10.1242/dev.140681 . PMC 5201028. PMID 27965439 . ^ Harris L, Zalucki O, Clément O, Fraser J, Matuzelski E, Oishi S, et al. (2018年2月). 「海馬神経幹細胞および前駆細胞による神経分化はNFIX発現によって左右される」. Development . 145 (3) dev155689: 1– 12. doi : 10.1242/dev.155689 . PMID 29437824. ^ Omairi S, Matsakas A, Degens H, Kretz O, Hansson KA, Solbrå AV, et al. (2016年8月). Cossu G (編). 「酸化筋線維のサイズ制約に違反するマウスモデルにおける運動と再生能力の向上」. eLife . 5 e16940. doi : 10.7554/eLife.16940 . PMC 4975572. PMID 27494364 . ^ Rossi G, Antonini S, Bonfanti C, Monteverde S, Vezzali C, Tajbakhsh S, et al. (2016年3月). 「Nfixはミオスタチン発現の調節を介して筋再生の一時的な進行を制御する」. Cell Reports . 14 (9): 2238– 2249. doi :10.1016/j.celrep.2016.02.014. PMC 4793149. PMID 26923583 .
さらに読む Apt D, Liu Y, Bernard HU (1994年9月). 「ヒト核因子IXのスプライスアイソフォームのクローニングと機能解析:細胞型特異的なNFI/CTFによる転写活性化の阻害」. Nucleic Acids Research . 22 (19): 3825– 3833. doi :10.1093/nar/22.19.3825. PMC 308376. PMID 7937100 . Sumner C, Shinohara T, Durham L, Traub R, Major EO, Amemiya K (1996年4月). 「発達中のヒト脳における核因子1ファミリーの複数クラスの発現:2クラスのNF-1遺伝子の差次的発現」 Journal of Neurovirology . 2 (2): 87– 100. doi :10.3109/13550289609146542. PMID 8799200. Wendler WM, Kremmer E, Förster R, Winnacker EL (1997年3月). 「高度に保存された新規核タンパク質、ピリンの同定」. The Journal of Biological Chemistry . 272 (13): 8482– 8489. doi : 10.1074/jbc.272.13.8482 . PMID 9079676. Liu Y, Bernard HU, Apt D (1997年4月). 「核因子Iファミリーの新規転写抑制因子NFI-B3は、代替RNAプロセシングによって生成される」. The Journal of Biological Chemistry . 272 (16): 10739– 10745. doi : 10.1074/jbc.272.16.10739 . PMID 9099724. Tarapore P, Richmond C, Zheng G, Cohen SB, Kelder B, Kopchick J, 他 (1997年10月). 「SkiオンコプロテインによるDNA結合と転写活性化はNFIとの相互作用を介して起こる」. Nucleic Acids Research . 25 (19): 3895– 3903. doi :10.1093/nar/25.19.3895. PMC 146989. PMID 9380514 . Müller K, Mermod N (2000年1月). 「核因子Iのヒストン相互作用ドメインは、生体内でシミアンウイルス40のDNA複製を活性化する」. The Journal of Biological Chemistry . 275 (3): 1645– 1650. doi : 10.1074/jbc.275.3.1645 . PMID 10636857. Nakazato M, Chung HK, Ulianich L, Grassadonia A, Suzuki K, Kohn LD (2000年11月). 「甲状腺転写因子1(TTF-1)遺伝子発現のチログロブリン抑制は、恒常的なTTF-1発現を制御する核因子Iタンパク質のDNA結合の減少によって媒介される」. Molecular and Cellular Biology . 20 (22): 8499– 8512. doi :10.1128/MCB.20.22.8499-8512.2000. PMC 102156. PMID 11046146 . 今川 正之、坂上 亮、田辺 明、長田 聡、西原 剛志 (2000年11月). 「核因子1-Aの核移行には2つの核局在シグナルが必要である」. FEBS Letters . 484 (2): 118– 124. Bibcode :2000FEBSL.484..118I. doi : 10.1016/S0014-5793(00)02119-0 . PMID 11068044. S2CID 46556394. Norquay LD, Yang X, Sheppard P, Gregoire S, Dodd JG, Reith W, et al. (2003年6月). 「RFX1とNF-1は下垂体クロマチンにおけるヒト成長ホルモン遺伝子座のP配列と関連する」. Molecular Endocrinology . 17 (6): 1027– 1038. doi : 10.1210/me.2003-0025 . PMID 12624117. Gopalan SM, Wilczynska KM, Konik BS, Bryan L, Kordula T (2006年5月). 「核因子1-Xはアストロサイト特異的なα1-アンチキモトリプシンおよびグリア線維性酸性タンパク質遺伝子の発現を制御する」. The Journal of Biological Chemistry . 281 (19): 13126– 13133. doi : 10.1074/jbc.M601194200 . PMID 16565071. Ravichandran V, Sabath BF, Jensen PN, Houff SA, Major EO (2006年11月). 「c-Jun、核因子1、およびJCウイルスプロモーター配列間の相互作用:ウイルスの向性への影響」. Journal of Virology . 80 (21): 10506– 10513. doi :10.1128/JVI.01355-06. PMC 1641797. PMID 16928756 .
外部リンク 米国国立医学図書館 医学件名表題集 (MeSH)のNFIX+タンパク質、+ヒト この記事には、 パブリック ドメイン である 米国国立医学図書館 のテキストが組み込まれています。
(1)基本領域
(1.1)基本 ロイシンジッパー ( bZIP ) (1.2)基本ヘリックスループヘリックス ( bHLH )
グループA グループB グループC bHLH- PAS グループD グループE グループF bHLH-COE
(1.3) bHLH-ZIP (1.4)NF-1 (1.5)RF-X (1.6)基本ヘリックス・スパン・ヘリックス(bHSH)
(2.1) 核内受容体 ( Cys4 )
(2.2)その他の Cys4 (2.3)システイン 2 ヒスチジン 2 (2.4)システイン 6 (2.5)交互構成 (2.6)WRKY
(4) マイナーグルーブコンタクトを有するβ-スキャフォールド因子