HSF4

ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子

HSF4
識別子
エイリアス	HSF4、CTM、CTRCT5、熱ショック転写因子4
外部ID	オミム：602438; MGI : 1347058;ホモロジーン: 100128;ジーンカード：HSF4; OMA :HSF4 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 16番染色体（ヒト）[1] バンド 16q22.1 始める 67,164,681 bp [1] 終わり 67,169,945 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 8番染色体（マウス）[2] バンド 8|8 D3 始める 105,996,433 bp [2] 終わり 106,002,477 bp [2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 小脳の右半球 下垂体前葉 胃粘膜 右卵管 膵臓の体 心臓の頂点 子宮頸管 右卵巣 左卵管 右前頭葉 上位の表現 レンズ 太ももの筋肉 女性の尿道 上前頭回 一次視覚野 小脳皮質 中脳の中心灰白質 海馬歯状回顆粒細胞 水晶体上皮 腰椎神経節 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 配列特異的DNA結合 DNA結合 転写コリプレッサー活性 DNA結合転写因子活性 タンパク質ホスファターゼ結合 DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合 細胞成分 核 核の粒子 生物学的プロセス 目の発達 転写の制御、DNAテンプレート 細胞の発達 ヒストンH3-K9の脱メチル化 RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御 転写、DNAテンプレート タンパク質ホモ三量体化 細胞分化の正の調節 細胞集団増殖の正の調節 カメラ型眼の発達 転写の負の制御、DNAテンプレート タンパク質ホモオリゴマー化 RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 視覚知覚 熱に対する細胞反応 熱ストレスに対するRNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写の正の制御 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 3299 26386 アンサンブル ENSG00000102878 ENSMUSG00000033249 ユニプロット Q9ULV5 Q9R0L1 RefSeq (mRNA) NM_001538 NM_001040667 NM_001374674 NM_001374675 NM_001256042 NM_001256044 NM_011939 RefSeq（タンパク質） NP_001035757 NP_001529 NP_001361603 NP_001361604 NP_001242971 NP_001242973 NP_036069 場所（UCSC） 16章: 67.16 – 67.17 Mb 8章: 106 – 106 MB PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
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熱ショック因子タンパク質4は、ヒトではHSF4遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[5] [6] [7] [8]}

熱ショック転写因子（HSF）は、熱やその他のストレス条件下で熱ショック応答遺伝子を活性化する。HSF4は、全ての脊椎動物HSFに共通するカルボキシル末端疎水性リピートを欠いており、DNA結合活性の負の調節に関与することが示唆されている。異なるアイソフォームをコードし、異なる転写活性を有する2つの選択的スプライシング転写産物が報告されている。^[8]

参照

• 熱ショック因子

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000102878 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000033249 – Ensembl、2017年5月
3. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Nakai A, Tanabe M, Kawazoe Y, Inazawa J, Morimoto RI, Nagata K (1997年1月). 「HSF4は転写活性化因子としての性質を欠くヒト熱ショック因子ファミリーの新規メンバー」Mol Cell Biol . 17 (1): 469–81 . doi :10.1128/mcb.17.1.469. PMC 231772. PMID 8972228  . 
6. Tanabe M, Sasai N, Nagata K, Liu XD, Liu PC, Thiele DJ, Nakai A (1999年11月). 「哺乳類HSF4遺伝子は選択的スプライシングによって熱ショック遺伝子の活性化因子と抑制因子の両方を生成する」. J Biol Chem . 274 (39): 27845–56 . doi : 10.1074/jbc.274.39.27845 . PMID  10488131.
7. Bu L, Jin Y, Shi Y, Chu R, Ban A, Eiberg H, Andres L, Jiang H, Zheng G, Qian M, Cui B, Xia Y, Liu J, Hu L, Zhao G, Hayden MR, Kong X (2002年6月). 「HSF4の変異DNA結合ドメインは常染色体優性ラメラ白内障およびマーナー白内障に関連する」Nat Genet . 31 (3): 276–8 . doi :10.1038/ng921. PMID  12089525. S2CID  27368940.
8. 「Entrez Gene: HSF4 熱ショック転写因子4」。

さらに読む

• 丸山 憲治, 菅野 誠 (1994). 「オリゴキャッピング：真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡便法」.遺伝子. 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• 鈴木雄三、中川吉智、丸山健、他 (1997). 「全長エンリッチドcDNAライブラリーおよび5'末端エンリッチドcDNAライブラリーの構築と特性解析」. Gene . 200 ( 1–2 ): 149–56 . doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID  9373149.
• Dias Neto E, Correa RG, Verjovski-Almeida S, et al. (2000). 「ORF発現配列タグを用いたヒトトランスクリプトームのショットガンシーケンシング」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 97 (7): 3491–6 . Bibcode :2000PNAS...97.3491D. doi : 10.1073/pnas.97.7.3491 . PMC  16267. PMID 10737800  .
• Smaoui N, Beltaief O, BenHamed S, et al. (2004). 「HSF4遺伝子のホモ接合性スプライス変異は常染色体劣性先天性白内障と関連する」. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci . 45 (8): 2716–21 . doi : 10.1167/iovs.03-1370 . PMID  15277496.
• Somasundaram T, Bhat SP (2004). 「発達段階に応じた熱ショック因子の発現：出生後水晶体におけるHSF4の特異的発現とαB-クリスタリン熱ショックプロモーターとの特異的相互作用」J. Biol. Chem . 279 (43): 44497– 503. doi : 10.1074/jbc.M405813200 . PMID  15308659.
• Forshew T, Johnson CA, Khaliq S, et al. (2005). 「常染色体劣性先天性白内障における遺伝子座異質性：9qおよび生殖細胞系列HSF4変異への連鎖」Hum. Genet . 117 (5): 452–9 . doi :10.1007/s00439-005-1309-9. PMID  15959809. S2CID  21135251.
• Oh JH, Yang JO, Hahn Y, et al. (2006). 「ヒト胃癌のトランスクリプトーム解析」. Mamm. Genome . 16 (12): 942–54 . doi :10.1007/s00335-005-0075-2. PMID  16341674. S2CID  69278.
• 木村 功、若松 明、鈴木 雄一、他 (2006). 「転写調節の多様化：ヒト遺伝子の推定代替プロモーターの大規模同定と特性解析」Genome Res . 16 (1): 55– 65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC 1356129.  PMID 16344560  .
• Tu N, Hu Y, Mivechi NF (2006). 「熱ショック転写因子（Hsf）-4bは細胞周期のG1期にBrg1をリクルートし、熱ショックタンパク質の発現を制御する」J. Cell. Biochem . 98 (6): 1528–42 . doi :10.1002/jcb.20865. PMID  16552721. S2CID  36553127.
• Ke T, Wang QK, Ji B, et al. (2006). 「HSF4の新規変異が中国人一家における先天性全白白内障の原因となる」Am. J. Ophthalmol . 142 (2): 298– 303. doi :10.1016/j.ajo.2006.03.056. PMID  16876512.

外部リンク

• HSF4+タンパク質、+ヒト（米国国立医学図書館医学件名表題集（MeSH））

この記事には、パブリック ドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。

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