ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| TOX4 |
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| 識別子 |
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| 別名 | TOX4、C14orf92、KIAA0737、LCP1、MIG7、TOX高移動度グループボックスファミリーメンバー4 |
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| 外部ID | OMIM : 614032; MGI : 1915389; HomoloGene : 8889; GeneCards : TOX4; OMA : TOX4 - オーソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | 染色体 | 14番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 14|14 C2 | 開始 | 52,516,603 bp [2] |
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| 終了 | 52,533,858 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| Bgee | | ヒト | マウス(相同遺伝子) |
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| 最もよく発現している | - 結腸上皮
- ランゲルハンス島
- 子宮内膜間質細胞
- 腓腹筋
- 骨髄細胞
- β細胞
- 平滑筋組織
- 大腿筋
- 単球
- 扁桃腺
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| | 最もよく発現している | - 精母細胞
- 吻側遊走路
- パネート細胞
- 顔面運動核
- 精細胞
- 上腕三頭筋
- 精嚢
- バレル皮質
- 胸鎖乳突筋
- 顎下腺
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| | より多くの参照発現データ |
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| BioGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | - DNA結合
- タンパク質結合
- DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
| | 細胞構成要素 | | | 生物学的プロセス | | | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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TOX4(TOX高移動度グループボックスファミリーメンバー4)はKIAA0737としても知られ、ヒト遺伝子である。[5]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000092203 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000016831 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ “エントレジーン: KIAA0737 KIAA0737”.
さらに詳しい情報
- Lim J, Hao T, Shaw C, et al. (2006). 「ヒト遺伝性運動失調症およびプルキンエ細胞変性疾患におけるタンパク質間相互作用ネットワーク」. Cell . 125 (4): 801–14 . doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569. S2CID 13709685
- 木村 功、若松 明、鈴木 雄一、他 (2006). 「転写調節の多様化:ヒト遺伝子の推定代替プロモーターの大規模同定と特性解析」Genome Res . 16 (1): 55– 65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560 .
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大:哺乳類遺伝子コレクション(MGC)」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
- Colland F, Jacq X, Trouplin V, et al. (2004). 「ヒトシグナル伝達経路の機能的プロテオミクスマッピング」Genome Res . 14 (7): 1324–32 . doi :10.1101/gr.2334104. PMC 442148. PMID 15231748 .
- Lehner B, Sanderson CM (2004). 「ヒトmRNA分解におけるタンパク質相互作用フレームワーク」Genome Res . 14 (7): 1315–23 . doi :10.1101/gr.2122004. PMC 442147. PMID 15231747 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- 永瀬 剛志、石川 功、須山 正之、他 (1999). 「未同定ヒト遺伝子のコード配列の予測 XI. 脳由来の新規cDNAクローン100個の完全配列(in vitroで巨大タンパク質をコードする). DNA Res . 5 (5): 277–86 . doi : 10.1093/dnares/5.5.277 . PMID 9872452.
- Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). 「正規化と減算:遺伝子発見を促進する2つのアプローチ」Genome Res . 6 (9): 791– 806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548.
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(1) 基本ドメイン |
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| (1.1) 基本 ロイシンジッパー( bZIP ) | |
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| (1.2)基本ヘリックス・ループ・ヘリックス(bHLH) | | グループA | |
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| グループB | |
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グループC bHLH- PAS | |
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| グループD | |
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| グループE | |
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グループF bHLH-COE | |
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| (1.3) bHLH-ZIP | |
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| (1.4) NF-1 | |
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| (1.5) RF-X | |
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| (1.6)基本ヘリックス・スパン・ヘリックス(bHSH) | |
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| (2.1) 核内受容体 (Cys4) | | サブファミリー1 | |
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| 亜科2 | |
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| サブファミリー3 | |
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| サブファミリー4 | |
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| サブファミリー5 | |
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| サブファミリー6 | |
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| サブファミリー0 | |
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| (2.2)その他のCys4 | |
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| (2.3) システイン2ヒスチジン2 | |
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| (2.4) システイン6 | |
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| (2.5)交互構成 | |
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| (2.6) WRKY | |
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(4)マイナーグルーブコンタクトを有するβ-スキャフォールド因子 |
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| (4.1) Rel相同領域 | |
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| STAT | |
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| p53 p63 p73ファミリー | |
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| Mef2 | |
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| TBP | |
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| BBX | |
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| TFCP2 | |
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| CSDA | |
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| CBF | |
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