PHF8

PHF8
利用可能な構造
PDBオーソログ検索: PDBe RCSB
識別子
エイリアスPHF8、JHDM1F、MRXSSD、ZNF422、PHDフィンガータンパク質8、KDM7B
外部IDオミム：300560; MGI : 2444341;ホモロジーン: 49405;ジーンカード：PHF8; OMA :PHF8 - オルソログ
オーソログ
種人間ねずみ
エントレズ

23133

320595

アンサンブル

ENSG00000172943

ENSMUSG00000041229

ユニプロット

Q9UPP1

Q80TJ7

RefSeq (mRNA)

NM_001184896
NM_001184897
NM_001184898
NM_015107

NM_001113354
NM_177201

RefSeq（タンパク質）

NP_001171825
NP_001171826
NP_001171827
NP_055922

NP_001106825
NP_796175

場所（UCSC）染色体X: 53.94 – 54.05 Mb染色体X: 150.3 – 150.42 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
人間の表示/編集マウスの表示/編集

PHDフィンガータンパク質8は、ヒトではPHF8遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5]

関数

PHF8は、第一鉄およびα-ケトグルタル酸依存性ヒドロキシラーゼス​​ーパーファミリーに属し、[6]ジメチル状態およびモノメチル状態を選択的に有するヒストンリジン脱メチル化酵素として活性を示す。 [7] PHF8は、重要なEMT転写因子SNAI1およびZEB1をアップレギュレーションすることにより、EMT（上皮間葉転換）様プロセスを誘導する。

分化中の制御

PHF8の発現はマウス胚性幹細胞の内皮分化中に増加し、心臓分化中に著しく減少することが判明した。[8]

臨床的意義

PHF8の変異は、シデリウス型X連鎖知的障害（XLMR）（OMIM：300263）を引き起こす。[9] [10] [11]中程度の知的障害 に加えて、シデリウス・ハメル症候群の特徴には、顔面異形症、口唇裂および/または口蓋裂、場合によっては小頭症が含まれる。[12] [13] [14] PHF8およびFAM120C遺伝子のすべてとWNK3遺伝子の一部を含むXp11.22の染色体微小欠失が、シデリウス型XLMRおよび口唇裂および口蓋裂に加えて、自閉スペクトラム症の兄弟2名で報告された。[15] [16]

この触媒活性は、 PHF8の臨床的に既知の変異によって阻害され、これらの変異は触媒活性を持つJmjCドメインに集中していることが明らかになっています。軽度の知的障害、顔面異形症、口唇裂・口蓋裂を有するフィンランド人兄弟2名に認められたPHF8のF279S変異[14]は、ヒト細胞で過剰発現したPHF8の核局在をさらに阻害することが明らかになりました[7] 。

PHF8の触媒活性は分子状酸素に依存しており[7]、これは妊娠中に低酸素状態に曝露されたマウスで口唇裂/口蓋裂の発生率が上昇したという報告に関連して重要な事実であると考えられている[17]。ヒトでは、胎児の口唇裂やその他の先天性異常も、例えば母親の喫煙、[18]、母親の多量のアルコール摂取、母親の高血圧治療などによって引き起こされる母親の低酸素状態に関連していることが知られている[19] 。

参考文献

  1. ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000172943 – Ensembl、2017年5月
  2. ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000041229 – Ensembl、2017年5月
  3. ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  4. ^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  5. ^ 「Entrez Gene: PHF8 PHDフィンガータンパク質8」。
  6. ^ Loenarz C, Schofield CJ (2008年3月). 「2-オキソグルタル酸オキシゲナーゼの化学生物学の展開」Nature Chemical Biology 4 ( 3): 152–6 . doi :10.1038/nchembio0308-152. PMID  18277970.
  7. ^ abc Loenarz C, Ge W, Coleman ML, Rose NR, Cooper CD, Klose RJ, et al. (2010年1月). 「口唇裂・口蓋裂および知的障害に関連する遺伝子PHF8は、ネプシロン-ジメチルリジン脱メチル化酵素をコードする」. Human Molecular Genetics . 19 (2): 217–22 . doi :10.1093/hmg/ddp480. PMC 4673897. PMID 19843542  . 
  8. ^ Boeckel JN, Derlet A, Glaser SF, Luczak A, Lucas T, Heumüller AW, et al. (2016年7月). 「JMJD8は内皮細胞においてピルビン酸キナーゼM2と相互作用することで血管新生の芽生えと細胞代謝を制御する」. 動脈硬化・血栓症・血管生物学. 36 (7): 1425– 1433. doi : 10.1161/ATVBAHA.116.307695 . PMID  27199445.
  9. ^ Siderius LE, Hamel BC, van Bokhoven H, de Jager F, van den Helm B, Kremer H, et al. (1999年7月). 「口唇裂・口蓋裂に関連するX連鎖性精神遅滞はXp11.3-q21.3にマップされる」. American Journal of Medical Genetics . 85 (3): 216–20 . doi : 10.1002/(SICI)1096-8628(19990730)85:3<216::AID-AJMG6>3.0.CO;2-X . PMID  10398231.
  10. ^ 「OMIM: シデリウスX連鎖性精神遅滞症候群」 。 2009年10月21日閲覧。[リンク切れ]
  11. ^ 「OMIM: PHDフィンガータンパク質8; PHF8」 。 2009年10月21日閲覧。[リンク切れ]
  12. ^ Abidi F, Miano M, Murray J, Schwartz C (2007年7月). 「PHF8遺伝子の新規変異は、口唇裂・口蓋裂を伴うX連鎖性精神遅滞と関連する」. Clinical Genetics . 72 (1): 19– 22. doi :10.1111/j.1399-0004.2007.00817.x. PMC 2570350. PMID  17594395 . 
  13. ^ Laumonnier F, Holbert S, Ronce N, Faravelli F, Lenzner S, Schwartz CE, et al. (2005年10月). 「PHF8遺伝子の変異はX連鎖性精神遅滞および口唇裂・口蓋裂と関連する」. Journal of Medical Genetics . 42 (10): 780–6 . doi :10.1136/jmg.2004.029439. PMC 1735927. PMID  16199551 . 
  14. ^ ab Koivisto AM, Ala-Mello S, Lemmelä S, Komu HA, Rautio J, Järvelä I (2007年8月). 「XLMRおよび口唇裂・口蓋裂を有するフィンランド人家族におけるPHF8遺伝子の変異スクリーニングと新規変異の同定」. Clinical Genetics . 72 (2): 145–9 . doi :10.1111/j.1399-0004.2007.00836.x. PMID  17661819. S2CID  23326755.
  15. ^ Qiao Y, Liu X, Harvard C, Hildebrand MJ, Rajcan-Separovic E, Holden JJ, et al. (2008年8月). 「自閉症関連家族性Xp11.22微小欠失」.臨床遺伝学. 74 (2): 134–44 . doi :10.1111/j.1399-0004.2008.01028.x. PMID  18498374. S2CID  22008997.
  16. ^ Sobering AK, Bryant LM, Li D, McGaughran J, Maystadt I, Moortgat S, et al. (2022年3月). 「PHF8遺伝子の変異は、X連鎖性神経発達障害および顔面形態異常の広範な原因となる」HGG Advances . 3 (3). doi :10.1016/j.xhgg.2022.100102. PMC 9034099. PMID 35469323  . {{cite journal}}: CS1 メンテナンス: 上書き設定 (リンク)
  17. ^ Millicovsky G, Johnston MC (1981年9月). 「妊娠中の高酸素症と低酸素症：CL/Frマウスにおける口唇裂・口蓋裂の発生率を単純な実験操作で変化させる」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 78 (9): 5722–3 . Bibcode :1981PNAS...78.5722M. doi : 10.1073/pnas.78.9.5722 . PMC 348841. PMID  6946511 . 
  18. ^ Shi M, Wehby GL, Murray JC (2008年3月). 「口唇裂およびその他の先天性欠損症の病因における遺伝的変異と母親の喫煙に関するレビュー」.出生異常研究. パートC, Embryo Today . 84 (1): 16– 29. doi :10.1002/bdrc.20117. PMC 2570345. PMID 18383123  . 
  19. ^ Hurst JA, Houlston RS, Roberts A, Gould SJ, Tingey WG (1995年10月). 「横断性四肢欠損、顔面裂、および低酸素性腎障害：母体高血圧症の治療との関連性？」Clinical Dysmorphology . 4 (4): 359–63 . doi :10.1097/00019605-199510000-00013. PMID  8574428. S2CID  6330050.

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