Protein-coding gene in the species Homo sapiens
E2F4 利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス E2F4 、E2F-4、E2F転写因子4 外部ID オミム :600659; MGI : 103012; ホモロジーン : 1471; ジーンカード :E2F4; OMA :E2F4 - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) キリスト 8番染色体(マウス) [2] バンド 8|8 D3 始める 106,024,295 bp [2] 終わり 106,032,002 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) 上位の表現 膵管細胞 顆粒球 左卵管 下垂体前葉 横行結腸 横行結腸粘膜 心臓の頂点 胃の体 甲状腺の右葉 左肺の上葉
上位の表現 胚の尾 接合子 卵黄嚢 性器結節 心室帯 胚 網膜の神経層 リップ 太ももの筋肉 顆粒球
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遺伝子オントロジー 分子機能 DNA結合 タンパク質ドメイン特異的結合 DNA結合転写因子活性 DNA結合転写活性化因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 転写因子結合 RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合 タンパク質結合 プロモーター特異的クロマチン結合 タンパク質二量体化活性 DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 DNA結合転写抑制活性、RNAポリメラーゼII特異的 配列特異的DNA結合 細胞成分 転写調節因子複合体 核質 核 RNAポリメラーゼII転写調節因子複合体 生物学的プロセス 細胞サイズの調節 上皮細胞の発達 細胞容積恒常性 転写の制御、DNAテンプレート 多繊毛上皮細胞の分化 RNAポリメラーゼIIによる転写 有糸分裂細胞周期のG1/S移行に関与する転写の制御 血液循環 細胞投影組織 細胞集団の増殖の調節 動物の器官の形態形成 細胞周期 運動繊毛の集合 中心小体アセンブリ 転写、DNAテンプレート 有糸分裂細胞周期 DNA損傷応答、p53クラスメディエーターによるシグナル伝達により細胞周期停止に至る RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 繊毛アセンブリ RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御 細胞周期の調節 出典:Amigo / QuickGO
ウィキデータ
転写因子E2F4 は、 ヒトでは E2F4 遺伝子によってコードされる タンパク質 である。 [5] [6]
関数 この遺伝子によってコードされるタンパク質は、 転写因子 E2F ファミリーのメンバーである 。E2Fファミリーは、 細胞周期 の制御と腫瘍抑制タンパク質の作用に重要な役割を果たしており、また、低分子DNA腫瘍ウイルスの形質転換タンパク質の標的でもある。このタンパク質は、pRB、p107、p130の3つの腫瘍抑制タンパク質すべてに結合するが、特に最後の2つとの親和性が高い。増殖関連遺伝子の抑制に重要な役割を果たしており、その遺伝子変異と発現増加はヒト癌と関連している可能性がある。 [7]
構造 E2Fタンパク質は、ファミリーのほとんどのメンバーに見られる進化的に保存された複数のドメインを含んでいます。これらのドメインには、 DNA結合ドメイン 、 分化制御転写因子タンパク質(DP)との相互作用を決定する二量体形成ドメイン、 酸性 アミノ酸( Asp + Glu )に富む トランス活性化 ドメイン、そしてトランス活性化ドメイン内に埋め込まれた腫瘍抑制タンパク質関連ドメインが含まれます。
相互作用 E2F4はSmad3 と 相互作用する ことが示されている 。 [8]
参照
参考文献 ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000205250 – Ensembl 、2017年5月 ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000014859 – Ensembl 、2017年5月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ Ginsberg D, Vairo G, Chittenden T, Xiao ZX, Xu G, Wydner KL, DeCaprio JA, Lawrence JB, Livingston DM (1994年12月). 「E2F転写因子ファミリーの新規メンバーであるE2F-4はp107と相互作用する」. Genes Dev . 8 (22): 2665–79 . doi : 10.1101/gad.8.22.2665 . PMID 7958924. ^ Sardet C, Vidal M, Cobrinik D, Geng Y, Onufryk C, Chen A, Weinberg RA (1995年4月). 「E2Fファミリーの2つのメンバーであるE2F-4とE2F-5は、細胞周期の初期段階で発現する」 Proc Natl Acad Sci USA . 92 (6): 2403–7 . Bibcode :1995PNAS...92.2403S. doi : 10.1073/pnas.92.6.2403 . PMC 42492. PMID 7892279 . ^ 「Entrez Gene: E2F4 E2F転写因子4、p107/p130結合」。 ^ Chen CR, Kang Y, Siegel PM, Massagué J (2002年7月). 「E2F4/5とp107はTGFβ受容体とc-myc抑制を結びつけるSmad補因子である」. Cell . 110 (1): 19– 32. doi : 10.1016/S0092-8674(02)00801-2 . PMID 12150994. S2CID 8945574.
さらに読む Bandyopadhyay D, Timchenko N, Suwa T, et al. (2001). 「ヒトメラノサイト:非線維芽細胞における細胞老化と形質転換の複雑性を研究するためのモデルシステム」 Exp. Gerontol . 36 (8): 1265–75 . doi :10.1016/S0531-5565(01)00098-5. PMID 11602203. S2CID 26041753. Beijersbergen RL, Kerkhoven RM, Zhu L, et al. (1994). 「E2F遺伝子ファミリーの新規メンバーであるE2F-4は発癌活性を有し、in vivoでp107と関連する」. Genes Dev . 8 (22): 2680–90 . doi : 10.1101/gad.8.22.2680 . PMID 7958925. Xiao ZX, Ginsberg D, Ewen M, Livingston DM (1996). 「G1サイクリン関連キナーゼによる網膜芽細胞腫タンパク質関連タンパク質p107の調節」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 93 (10): 4633–7 . Bibcode :1996PNAS...93.4633X. doi : 10.1073/pnas.93.10.4633 . PMC 39330. PMID 8643455 . Moberg K, Starz MA, Lees JA (1996). 「E2F-4は細胞周期再突入に応答してp130からp107およびpRBへとスイッチする」 Mol. Cell. Biol . 16 (4): 1436–49 . doi :10.1128/mcb.16.4.1436. PMC 231128. PMID 8657117 . Vidal M, Brachmann RK, Fattaey A, et al. (1996). 「タンパク質-タンパク質間およびDNA-タンパク質間相互作用の解離を検出するためのリバースツーハイブリッド法およびワンハイブリッド法」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 93 (19): 10315–20 . Bibcode :1996PNAS...9310315V. doi : 10.1073/pnas.93.19.10315 . PMC 38381. PMID 8816797 . Williams CD, Linch DC, Sørensen TS, et al. (1997). 「ヒト初代造血細胞およびAML芽球における優位なE2F複合体は、E2F-4、DP-1、およびp130を含む」 Br. J. Haematol . 96 (4): 688–96 . doi :10.1046/j.1365-2141.1997.d01-2086.x. PMID 9074408. S2CID 23265759. Lindeman GJ, Gaubatz S, Livingston DM, Ginsberg D (1997). 「E2F-4の細胞内局在は細胞周期に依存する」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 (10): 5095–100 . Bibcode :1997PNAS...94.5095L. doi : 10.1073/pnas.94.10.5095 . PMC 24637. PMID 9144196 . Wang H, Shao N, Ding QM, et al. (1997). 「BRCA1タンパク質は血清が存在しない状態で核へ移行し、スプライスバリアントBRCA1aおよびBRCA1bはE2F、サイクリン、およびサイクリン依存性キナーゼと会合するチロシンリン酸化タンパク質である」。Oncogene . 15 ( 2): 143– 57. doi :10.1038/sj.onc.1201252. PMID 9244350. S2CID 11930784. Müller H, Moroni MC, Vigo E, et al. (1997). 「E2F転写因子によるS期移行の誘導は核局在に依存する」 Mol. Cell. Biol . 17 (9): 5508–20 . doi :10.1128/mcb.17.9.5508. PMC 232399. PMID 9271426 . Pierce AM, Schneider-Broussard R, Philhower JL, Johnson DG (1998). 「E2Fファミリーメンバーの異なる活性:転写制御における独自の機能」. Mol. Carcinog . 22 (3): 190–8 . doi :10.1002/(SICI)1098-2744(199807)22:3<190::AID-MC7>3.0.CO;2-P. PMID 9688145. S2CID 42749241. Ferreira R, Magnaghi-Jaulin L, Robin P, et al. (1998). 「ポケットタンパク質ファミリーの3つのメンバーは、ヒストン脱アセチル化酵素のリクルートメントを介してE2F活性を抑制する能力を共有している」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 95 (18): 10493–8 . Bibcode :1998PNAS...9510493F. doi : 10.1073/pnas.95.18.10493 . PMC 27922. PMID 9724731 . Timchenko NA, Wilde M, Darlington GJ (1999). 「C/EBPalphaは新生マウスの肝臓におけるS期特異的E2F-p107複合体の形成を制御する」 Mol. Cell. Biol . 19 (4): 2936–45 . doi :10.1128/mcb.19.4.2936. PMC 84088. PMID 10082561 . Zheng N、Fraenkel E、Pabo CO、Pavletich NP (1999)。 「ヘテロ二量体細胞周期転写因子 E2F-DP による DNA 認識の構造基盤」。 遺伝子開発 。 13 (6): 666–74 . 土井 :10.1101/gad.13.6.666。 PMC 316551 。 PMID 10090723。 古川雄三、岩瀬誠、菊池淳、他 (1999). 「インターフェロンαによるE2F-1遺伝子の転写抑制は、E2F-4/pRBおよびE2F-4/p130複合体の誘導を介して起こる」. Oncogene . 18 (11): 2003–14 . doi :10.1038/sj.onc.1202500. PMID 10208422. S2CID 9069532. Lam EW, Glassford J, van der Sman J, et al. (1999). 「表面IgMおよびCD40受容体を介した刺激によるマウス初代培養B細胞におけるE2F活性の調節」. Eur. J. Immunol . 29 (10): 3380–9 . doi : 10.1002/(SICI)1521-4141(199910)29:10<3380::AID-IMMU3380>3.0.CO;2-C . PMID 10540350. Zhong X, Hemmi H, Koike J, et al. (2000). 「ヒト転写因子遺伝子E2F-4のコーディング領域における様々なAGCリピート数」 Hum. Mutat . 15 (3): 296–7 . doi : 10.1002/(SICI)1098-1004(200003)15:3<296::AID-HUMU18>3.0.CO;2-X . PMID 10679953. S2CID 84967986. 高橋 勇, レイマン JB, ダインラハト BD (2000). 「E2FファミリーとpRBファミリーによるin vivoでのプロモーター結合の解析:異なるE2Fタンパク質が活性化と抑制を媒介する」. Genes Dev . 14 (7): 804–16 . doi :10.1101/gad.14.7.804. PMC 316494. PMID 10766737 . Schwemmle S, Pfeifer GP (2000). 「ヒト腫瘍におけるE2F4遺伝子のゲノム構造と変異スクリーニング」. Int. J. Cancer . 86 (5): 672–7 . doi : 10.1002/(SICI)1097-0215(20000601)86:5<672::AID-IJC11>3.0.CO;2-X . PMID 10797289.
外部リンク 米国国立医学図書館の 医学主題標目表 (MeSH)におけるE2F4+タンパク質、+ヒト ファクターブック E2F4 PDBe-KBは、ヒト転写因子E2F4のPDBに登録されているすべての構造情報の概要を提供します。 この記事には、 パブリック ドメイン である 米国国立医学図書館 のテキストが組み込まれています。
(1)基本領域
(1.1)基本 ロイシンジッパー ( bZIP ) (1.2)基本ヘリックスループヘリックス ( bHLH )
グループA グループB グループC bHLH- PAS グループD グループE グループF bHLH-COE
(1.3) bHLH-ZIP (1.4)NF-1 (1.5)RF-X (1.6)基本ヘリックス・スパン・ヘリックス(bHSH)
(2.1) 核内受容体 ( Cys4 )
(2.2)その他の Cys4 (2.3)システイン 2 ヒスチジン 2 (2.4)システイン 6 (2.5)交互構成 (2.6)WRKY
(4) マイナーグルーブコンタクトを有するβ-スキャフォールド因子