ヒトのタンパク質コード遺伝子
| ZNF451 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オーソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | ZNF451、COASTER、dJ417I1.1、ジンクフィンガータンパク質451、ZATT |
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| 外部ID | オミム:615708; MGI : 2137896;ホモロジーン: 9188;ジーンカード:ZNF451; OMA :ZNF451 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 染色体1(マウス)[2] |
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| | バンド | 1 B|1 12.81 cM | 始める | 33,800,626 bp [2] |
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| 終わり | 33,853,676 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - 脳梁
- アキレス腱
- 海綿骨
- 脛骨
- 右精巣
- 骨髄
- 乳首
- 左精巣
- 肺の下葉
- 腓骨神経
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| | 上位の表現 | - 精子細胞
- 吻側回遊流
- 内側神経節隆起
- 接合子
- 二次卵母細胞
- 胚の尾
- 性器結節
- 生殖腺隆起
- 一次卵母細胞
- 三叉神経節
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS |  | | より多くの参照表現データ |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | - SUMOリガーゼ活性
- 転写コリプレッサー活性
- タンパク質結合
- 金属イオン結合
- 核酸結合
- トランスフェラーゼ活性
- DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
- RNAポリメラーゼIIコアプロモーター配列特異的DNA結合
| | 細胞成分 | - PML本体
- 核
- 核質
- ヒストンメチルトランスフェラーゼ複合体
| | 生物学的プロセス | - RNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写開始の負の制御
- ヒストンH3-K9のアセチル化の負の制御
- 転写の制御、DNAテンプレート
- トランスフォーミング成長因子β受容体シグナル伝達経路の負の制御
- タンパク質のSUMO化
- 転写、DNAテンプレート
- 遺伝子発現の調節
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オーソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001031623 NM_001257273 NM_015555 |
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NM_001290699 NM_001290700 NM_133817 NM_001359274 NM_001359275 |
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| RefSeq(タンパク質) | |
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NP_001026794 NP_001244202 NP_056370 |
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NP_001277628 NP_001277629 NP_598578 NP_001346203 NP_001346204 |
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| 場所(UCSC) | 6章: 57.09 – 57.17 Mb | 1章: 33.8 – 33.85 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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ジンクフィンガータンパク質451は、ヒトではZNF451遺伝子によってコードされる新規核タンパク質である。[5] [6]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000112200 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000042197 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 長瀬 剛志、石川 健、宮島 暢、田中 明、小谷 秀、野村 暢、小原 修 (1998年2月). 「未同定ヒト遺伝子のコード配列の予測. IX. in vitroで巨大タンパク質をコードできる脳由来の新規cDNAクローン100個の完全配列」. DNA Research . 5 (1): 31–9 . doi : 10.1093/dnares/5.1.31 . PMID 9628581.
- ^ 「Entrez Gene: ZNF451 ジンクフィンガータンパク質 451」。
さらに読む
- Adams MD, Kerlavage AR, Fleischmann RD, Fuldner RA, Bult CJ, Lee NH, Kirkness EF, Weinstock KG, Gocayne JD, White O (1995年9月). 「8300万ヌクレオチドのcDNA配列に基づくヒト遺伝子多様性と発現パターンの初期評価」(PDF) . Nature . 377 (6547 Suppl): 3–174 . PMID 7566098.
- 丸山 憲治、菅野 誠(1994年1月). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡便法」.遺伝子. 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- 鈴木雄三、中川吉智、丸山健、須山明生、菅野誠一(1997年10月)「全長エンリッチドcDNAライブラリーおよび5'末端エンリッチドcDNAライブラリーの構築と特性解析」Gene . 200 ( 1–2 ): 149–56 . doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Brandenberger R, Wei H, Zhang S, Lei S, Murage J, Fisk GJ, Li Y, Xu C, Fang R, Guegler K, Rao MS, Mandalam R, Lebkowski J, Stanton LW (2004年6月). 「トランスクリプトーム解析によりヒトES細胞の増殖と分化を制御するシグナル伝達ネットワークが解明」Nature Biotechnology 22 ( 6): 707–16 . doi :10.1038/nbt971. PMID 15146197. S2CID 27764390.
- Colland F、Jacq X、Trouplin V、Mougin C、Groizeleau C、Hamburger A、Meil A、Wojcik J、Legrain P、Gauthier JM (2004 年 7 月)。 「ヒトシグナル伝達経路の機能的プロテオミクスマッピング」。ゲノム研究。14 (7): 1324–32 .土井:10.1101/gr.2334104。PMC 442148。PMID 15231748。
- ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實・岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ=グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグ DS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサック S、セケーラ R、ドゥセット スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M (2005 年 10 月)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。自然。437 (7062): 1173–8 . Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
外部リンク
- 米国国立医学図書館の医学主題標目表(MeSH)におけるZNF451+タンパク質、+ヒト
この記事には、パブリック ドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。
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(1)基本領域 |
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| (1.1)基本 ロイシンジッパー(bZIP) | |
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| (1.2)基本ヘリックスループヘリックス(bHLH) | | グループA | |
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| グループB | |
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グループC bHLH- PAS | |
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| グループD | |
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| グループE | |
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グループF bHLH-COE | |
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| (1.3) bHLH-ZIP | |
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| (1.4)NF-1 | |
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| (1.5)RF-X | |
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| (1.6)基本ヘリックス・スパン・ヘリックス(bHSH) | |
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| (2.1) 核内受容体 (Cys4) | |
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| (2.2)その他のCys4 | |
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| (2.3)システイン2ヒスチジン2 | |
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| (2.4)システイン6 | |
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| (2.5)交互構成 | |
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| (2.6)WRKY | |
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(4)マイナーグルーブコンタクトを有するβ-スキャフォールド因子 |
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