IRF5

IRF5
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 3DSH
識別子
エイリアス	IRF5、SLEB10、インターフェロン調節因子5
外部ID	オミム: 607218 ; MGI : 1350924 ;ホモロジーン: 8088 ;ジーンカード: IRF5 ; OMA : IRF5 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 7番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 7q32.1 始める 1億2893万7457塩基対[ 1 ] 終わり 1億2895万3800塩基対[ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 6番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 6 A3.3|6 12.36 cM 始める 29,526,624 bp [ 2 ] 終わり 29,541,870 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 単球 顆粒球 脾臓 血 骨髄細胞 リンパ節 左肺の上葉 睾丸 右卵管 右冠動脈 上位の表現 腸間膜リンパ節 骨髄間質 顆粒球 脾臓 リップ 右腎臓 女性の尿道 近位尿細管 食道 胚盤胞 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 DNA結合 DNA結合転写因子活性 タンパク質結合 DNA結合転写活性化因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 配列特異的DNA結合 同一のタンパク質結合 DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 細胞成分 細胞質 細胞質 核 生物学的プロセス 転写の制御、DNAテンプレート インターロイキン-12産生の正の調節 インターフェロンγを介したシグナル伝達経路 免疫システムのプロセス RNAポリメラーゼIIによる転写の調節 インターフェロンα産生の正の調節 ムラミルジペプチドに対する反応 転写、DNAテンプレート ウイルスに対する防御反応 I型インターフェロンシグナル伝達経路 ペプチドグリカンへの反応 アポトーシス過程の正の調節 自然免疫反応 RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 インターフェロンβ産生の正の調節 サイトカインを介したシグナル伝達経路 RNAポリメラーゼIIによる転写 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 3663 27056 アンサンブル ENSG00000128604 ENSMUSG00000029771 ユニプロット Q13568 P56477 RefSeq (mRNA) NM_001098627 NM_001098629 NM_001098630 NM_001242452 NM_032643 NM_001347928 NM_001364314 NM_001252382 NM_012057 NM_001311083 RefSeq（タンパク質） NP_001092097 NP_001092099 NP_001092100 NP_001229381 NP_116032 NP_001334857 NP_001351243 NP_001092099.1 NP_001239311 NP_001298012 NP_036187 場所（UCSC） 7章: 128.94 – 128.95 Mb 6章: 29.53 – 29.54 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
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インターフェロン調節因子5は、ヒトではIRF5遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[ 5 ]} IRFファミリーは、哺乳類におけるウイルス反応のシグナル伝達や特定の細胞機能の調節に関与する転写因子のグループである。^{[ 6 ]}

関数

IRF5は、インターフェロン調節因子（IRF）ファミリーのメンバーです。IRFファミリーは、ウイルス媒介によるインターフェロンの活性化、細胞増殖、分化、アポトーシス、免疫系活性の調節など、多様な役割を持つ転写因子群です。IRFファミリーのメンバーは、トリプトファン（W）リピートを含むN末端DNA結合ドメインが保存されていることを特徴としています。異なるアイソフォームをコードする選択的スプライスバリアントが存在します。^{[ 5 ]} IRFファミリーの調節領域と抑制領域は、主にIRFのC末端に位置しています。 ^{[ 7 ]}

2020年の研究では、TASLと呼ばれるアダプタータンパク質がpLxISモチーフでリン酸化されることによってIRF5の活性化において重要な調節的役割を果たしていることが示され、^{[ 8 ]}アダプタータンパク質MAVS、STING、TRIFを介したIRF3活性化経路と同様の類似点が示されています。^{[ 9 ]}

臨床的意義

IRF5は、マクロファージが炎症を促進するか抑制するかを制御する分子スイッチとして機能します。マクロファージにおけるIRF5の産生を阻害することは、幅広い自己免疫疾患の治療に役立つ可能性があり、また、IRF5レベルを高めることは、免疫系が弱体化、低下、または損傷している人々の治療に役立つ可能性があります。IRF5は、「DNAと直接相互作用するか、またはどの遺伝子のスイッチをオンにするかを制御する他のタンパク質と相互作用することによって」作用するようです。^{[ 10 ]}

シグナリング

IRFファミリーは、ウイルス感染に対するインターフェロン（IFN）応答の遺伝子発現を制御します。 ^{[ 6 ]} IRF5はインターフェロンシグナル伝達への直接的なトランスデューサーであり、リン酸化によって活性化されます。^{[ 11 ]} IRFファミリーは、 JAKを活性化する膜貫通受容体に結合して、JAK/STATシグナル伝達経路を開始することもできます。^{[ 12 ]} IRF、IFN、およびJAK/STATシグナル伝達経路は、特定のシグナルを介して哺乳類のウイルス感染と戦うために連携して機能します。^{[ 13 ]}

参照

• インターフェロン調節因子

参考文献

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2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000029771 – Ensembl、2017年5月
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4. 「マウスPubMedリファレンス：」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
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8. Heinz LX, Lee J, Kapoor U, Kartnig F, Sedlyarov V, Papakostas K, et al. (2020年5月). 「TASLはTLR7-9によるIRF5活性化のためのSLC15A4関連アダプターである」 . Nature . 581 (7808): 316– 322. Bibcode : 2020Natur.581..316H . doi : 10.1038 / s41586-020-2282-0 . PMC 7610944. PMID 32433612. S2CID 218625265 .   
9. Liu S, Cai X, Wu J, Cong Q, Chen X, Li T, et al. (2015年3月). 「自然免疫アダプタータンパク質MAVS、STING、TRIFのリン酸化はIRF3の活性化を誘導する」 . Science . 347 (6227) aaa2630. doi : 10.1126/science.aaa2630 . PMID 25636800 . 
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さらに読む

• Pitha PM, Au WC, Lowther W, Juang YT, Schafer SL, Burysek L, et al. (1999). 「ウイルスを介したシグナル伝達と細胞増殖制御におけるインターフェロン制御因子（IRF）の役割」 . Biochimie . 80 ( 8–9 ): 651–658 . doi : 10.1016/S0300-9084(99)80018-2 . PMID  9865487 .
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外部リンク

• IRF5+タンパク質、+ヒト米国国立医学図書館医学件名表題集（MeSH）
• PDBe-KBのUniProt : Q13568 (インターフェロン調節因子 5)のPDBで利用可能なすべての構造情報の概要。

この記事には、パブリック ドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。

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