ホモサピエンスで発見された哺乳類タンパク質
DLX1 識別子 エイリアス DLX1 、Dlx、Dlx-1、遠位レスホメオボックス1 外部ID OMIM : 600029; MGI : 94901; ホモロジーン : 22558; ジーンカード :DLX1; OMA :DLX1 - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) キリスト 染色体2(マウス) [2] バンド 2 C2|2 42.61 cM 始める 71,358,457 bp [2] 終わり 71,364,325 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) 上位の表現 中側頭回 睾丸 前帯状皮質 内皮細胞 神経節隆起 前頭前皮質 ブロードマン野23 背外側前頭前皮質 一次視覚野 ブロードマン領域9
上位の表現 内側神経節隆起 嗅球 鼻涙管 吻側回遊流 耳小胞 耳板 外側中隔核 窩 視床下部室傍核 上顎突出
より多くの参照表現データ
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能 DNA結合 配列特異的DNA結合 RNAポリメラーゼII転写調節領域配列特異的DNA結合 クロマチン結合 タンパク質結合 DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合 DNA結合転写因子活性 細胞成分 生物学的プロセス ニューロンのアポトーシス過程の負の調節 大脳皮質GABA作動性介在ニューロンの分化 近位/遠位パターン形成 細胞分化 転写の制御、DNAテンプレート RNAポリメラーゼIIによる転写の調節 胎児骨格系の発達 多細胞生物の発達 象牙質含有歯の歯牙形成 大脳皮質GABA作動性介在ニューロンの運命決定 オリゴデンドロサイト分化の負の制御 前脳ニューロンの分化 海馬の発達 下顎骨の発達 Notchシグナル伝達経路の負の制御 細胞分化の正の調節 光受容細胞分化の負の調節 アマクリン細胞分化の正の調節 RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御 BMPシグナル伝達経路の負の制御 RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 トランスフォーミング成長因子β刺激に対する細胞応答 BMP刺激に対する細胞応答 トランスフォーミング成長因子β刺激に対する細胞応答の負の調節 転写、DNAテンプレート 出典:Amigo / QuickGO
ウィキデータ
ホメオボックス タンパク質 DLX-1 は、 ヒトでは DLX1 遺伝子によってコードされる タンパク質 である。 [5] [6]
関数 この遺伝子は、ショウジョウバエの distal-less遺伝子に類似した ホメオボックス 転写因子 遺伝子ファミリーのメンバーをコードしている 。コードされているタンパク質は核に局在し、複数の TGF-βスーパーファミリーメンバーからのシグナルの転写調節因子として機能する可能性がある。コードされているタンパク質は、 頭蓋顔面の パターン形成や 前脳 の抑制性 ニューロンの 分化 と生存の 制御に関与している可能性がある。この遺伝子は、 2番染色 体長腕上に、このファミリーの他のメンバーと尾同士が連結した配置で位置している 。異なる アイソフォームをコードする 選択的スプライシング 転写バリアント が報告されている。 [6]
参考文献 ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000144355 – Ensembl 、2017年5月 ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000041911 – Ensembl 、2017年5月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ Simeone A, Acampora D, Pannese M, D'Esposito M, Stornaiuolo A, Gulisano M, Mallamaci A, Kastury K, Druck T, Huebner K, et al. (1994年4月). 「脊椎動物Dlx遺伝子ファミリーの2つのメンバーのクローニングと特性解析」 Proc Natl Acad Sci USA . 91 (6): 2250–4 . Bibcode :1994PNAS...91.2250S. doi : 10.1073/pnas.91.6.2250 . PMC 43348 . PMID 7907794. ^ ab "Entrez Gene: DLX1 遠位レスホメオボックス 1".
さらに読む Letinic K, Zoncu R, Rakic P (2002). 「ヒト大脳新皮質におけるGABA作動性ニューロンの起源」. Nature . 417 (6889): 645–9 . Bibcode :2002Natur.417..645L. doi :10.1038/nature00779. PMID 12050665. S2CID 4349070. Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 . 千葉 誠、竹下 健、今井 雄一、他 (2004). 「ホメオプロテインDLX-1はSmad4と相互作用し、造血細胞におけるアクチビンAからのシグナル伝達経路を阻害する」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 100 (26): 15577–82 . doi : 10.1073/pnas.2536757100 . PMC 307610. PMID 14671321 . 太田 剛志、鈴木 雄志、西川 剛志、他 (2004). 「21,243個の完全長ヒトcDNAの完全配列決定と特性解析」 Nat. Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039. Zhou QP, Le TN, Qiu X, et al. (2004). 「クロマチン免疫沈降法の最適化による、発達期マウス前脳および網膜におけるDlxホメオドメインの直接標的の同定」 Nucleic Acids Res . 32 (3): 884–92 . doi :10.1093/nar/gkh233. PMC 373381. PMID 14769946 . Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大:哺乳類遺伝子コレクション(MGC)」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 . Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップの構築に向けて」 Nature . 437 (7062): 1173–8 . Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026. Hamilton SP, Woo JM, Carlson EJ, et al. (2006). 「自閉症患者における4つのDLXホメオボックス遺伝子の解析」 BMC Genet . 6 : 52. doi : 10.1186/1471-2156-6-52 . PMC 1310613 . PMID 16266434.
(1)基本領域
(1.1)基本 ロイシンジッパー ( bZIP ) (1.2)基本ヘリックスループヘリックス ( bHLH )
グループA グループB グループC bHLH- PAS グループD グループE グループF bHLH-COE
(1.3) bHLH-ZIP (1.4)NF-1 (1.5)RF-X (1.6)基本ヘリックス・スパン・ヘリックス(bHSH)
(2.1) 核内受容体 ( Cys4 )
(2.2)その他の Cys4 (2.3)システイン 2 ヒスチジン 2 (2.4)システイン 6 (2.5)交互構成 (2.6)WRKY
(4) マイナーグルーブコンタクトを有するβ-スキャフォールド因子