Protein-coding gene in the species Homo sapiens
RFX3 識別子 エイリアス RFX3 、調節因子X3 外部ID オミム :601337; MGI : 106582; ホモロジーン : 7917; ジーンカード :RFX3; OMA :RFX3 - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) キリスト 19番染色体(マウス) [2] バンド 19|19 C1 始める 27,739,121 bp [2] 終わり 27,988,566 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) 上位の表現 気管支上皮細胞 副鼻腔粘膜 ブロードマン野23 中側頭回 小脳虫部 右卵管 精巣上体頭 心室帯 脳梁 嗅内皮質
上位の表現 嗅上皮 脈絡叢上皮 梨状皮質 内側神経節隆起 前扁桃体領域 歯状回 胚の尾 海馬固有部I領域 原始的な条線 嗅結節
より多くの参照表現データ
バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 DNA結合 配列特異的DNA結合 DNA結合転写因子活性 RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合 タンパク質結合 転写因子活性、RNAポリメラーゼII遠位エンハンサー配列特異的結合 DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 細胞成分 生物学的プロセス 細胞分化 転写の制御、DNAテンプレート B型膵臓細胞の発達の正の調節 インスリン分泌の調節 左右非対称性の決定に関与する上皮繊毛の運動 細胞の成熟 転写、DNAテンプレート 転写の正の制御、DNAテンプレート 多細胞生物の発達 B型膵臓細胞の成熟 左右対称性の判定 転写の負の制御、DNAテンプレート 繊毛依存性細胞運動 内分泌膵臓の発達 RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 B型膵臓細胞の分化 繊毛アセンブリ RNAポリメラーゼIIによる転写の調節 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001282116 NM_001282117 NM_002919 NM_134428 NM_001377999
NM_001166414 NM_011265 NM_001360357 NM_001360358
RefSeq(タンパク質) NP_001269045 NP_001269046 NP_002910 NP_602304 NP_001364928
NP_001159886 NP_035395 NP_001347286 NP_001347287
場所(UCSC) 9章: 3.22 – 3.53 MB 19章: 27.74 – 27.99 MB PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
転写因子RFX3 は、 ヒトでは RFX3 遺伝子によってコードされる タンパク質 である。 [5] [6]
この遺伝子は、高度に保存された翼状ヘリックスDNA結合ドメインを含む 転写因子 をコードする調節因子X遺伝子ファミリーのメンバーです。この遺伝子によってコードされるタンパク質は、調節因子X1、X2、X4、およびX5と構造的に関連しています。これは 転写活性化 因子であり、モノマーとして、または他のRFXファミリーメンバーとのヘテロダイマーとして DNA に結合できます。この遺伝子には、異なる アイソフォーム をコードする2つの転写バリアントが記載されており、少なくとも1つは代替的な ポリアデニル化 シグナルを利用しています。 [6]
参考文献 ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000080298 – Ensembl 、2017年5月 ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000040929 – Ensembl 、2017年5月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ Reith W, Ucla C, Barras E, Gaud A, Durand B, Herrero-Sanchez C, Kobr M, Mach B (1994年2月). 「B型肝炎ウイルスエンハンサーIのトランスアクチベーターであるRFX1は、ホモ二量体およびヘテロ二量体DNA結合タンパク質の新規ファミリーに属する」 Mol Cell Biol . 14 (2): 1230–44 . doi :10.1128/mcb.14.2.1230. PMC 358479. PMID 8289803 . ^ ab 「Entrez Gene: RFX3 調節因子 X、3 (HLA クラス II の発現に影響)」。
さらに読む Emery P, Durand B, Mach B, Reith W (1996). 「RFXタンパク質:真核生物界で保存されているDNA結合タンパク質の新規ファミリー」 Nucleic Acids Res . 24 (5): 803–7 . doi :10.1093/nar/24.5.803. PMC 145730. PMID 8600444 . Iwama A, Pan J, Zhang P, et al. (1999). 「二量体RFXタンパク質は活性化ドメインと抑制ドメインを介してインターロイキン-5受容体αプロモーターの活性と系統特異性に寄与する」 Mol. Cell. Biol . 19 (6): 3940–50 . doi :10.1128/mcb.19.6.3940. PMC 104353. PMID 10330134 . 諸富-矢野 健、矢野 健、斎藤 秀一、他 (2002). 「ヒト調節因子X4(RFX4)は精巣特異的な二量体DNA結合タンパク質であり、他のヒトRFXメンバーと協調的に機能する」 J. Biol. Chem . 277 (1): 836–42 . doi : 10.1074/jbc.M108638200 . PMID 11682486. Nakayama A, Murakami H, Maeyama N, et al. (2003). 「微小管関連タンパク質MAP1Aプロモーターの非神経細胞特異的不活性化におけるRFX転写因子の役割」 J. Biol. Chem . 278 (1): 233–40 . doi : 10.1074/jbc.M209574200 . PMID 12411430. Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 . Maijgren S, Sur I, Nilsson M, Toftgård R (2004). 「Ras応答性エンハンサーエレメントからの転写活性化におけるRFXタンパク質の関与」 Arch. Dermatol. Res . 295 (11): 482–9 . doi :10.1007/s00403-004-0456-5. PMID 15024578. S2CID 2408607. Humphray SJ, Oliver K, Hunt AR, et al. (2004). 「ヒト9番染色体のDNA配列と解析」. Nature . 429 (6990): 369–74 . Bibcode :2004Natur.429..369H. doi :10.1038/nature02465. PMC 2734081. PMID 15164053 . Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大:哺乳類遺伝子コレクション(MGC)」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 . Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップの構築に向けて」 Nature . 437 (7062): 1173–8 . Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026. この記事には、 パブリック ドメイン である 米国国立医学図書館 のテキストが組み込まれています。
(1)基本領域
(1.1)基本 ロイシンジッパー ( bZIP ) (1.2)基本ヘリックスループヘリックス ( bHLH )
グループA グループB グループC bHLH- PAS グループD グループE グループF bHLH-COE
(1.3) bHLH-ZIP (1.4)NF-1 (1.5)RF-X (1.6)基本ヘリックス・スパン・ヘリックス(bHSH)
(2.1) 核内受容体 ( Cys4 )
(2.2)その他の Cys4 (2.3)システイン 2 ヒスチジン 2 (2.4)システイン 6 (2.5)交互構成 (2.6)WRKY
(4) マイナーグルーブコンタクトを有するβ-スキャフォールド因子