ソックス6

ソックス6
識別子
エイリアスSOX6、HSSOXD、SRYボックス6、SRYボックス転写因子6、TOLCAS
外部IDオミム：607257; MGI : 98368;ホモロジーン: 22631;ジーンカード：SOX6; OMA :SOX6 - オルソログ
オーソログ
種人間ねずみ
エントレズ

55553

20679

アンサンブル

ENSG00000110693

ENSMUSG00000051910

ユニプロット

P35712

P40645

RefSeq (mRNA)
RefSeq（タンパク質）
場所（UCSC）11章: 15.97 – 16.74 Mb7章: 115.47 – 116.04 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
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転写因子SOX-6は、ヒトではSOX6遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]

関数

SOX遺伝子ファミリーは、保存された高移動度グループ（HMG）DNA結合ドメインによって定義される転写因子群をコードしています。ほとんどの転写因子とは異なり、SOX転写因子はDNAの副溝に結合し、70～85度の屈曲を引き起こし、局所的な構造変化をもたらします。[OMIM提供] [6]

相互作用

SOX6はCTBP2 [7]およびCENPK [8]と相互作用することが示されている。

また、SOX6タンパク質は分化中のヒト赤血球に蓄積し、 SOX6転写開始部位の近くにある進化的に保存されたコンセンサス配列に直接結合することで、自身の転写をダウンレギュレーションできることも実証されています。[9]

Sox6は、グロビン遺伝子の転写制御と赤血球の終末分化の制御において重要な役割を果たしていると考えられています。[10]さらに、SOX6はユーイング肉腫の腫瘍増殖にも関与している可能性があります。[11] Sox6がレニンおよびプロレニンの調節において新たな役割を果たすことが、レニン発現細胞においてのみSox6がノックアウトされたSox KOマウスモデルを用いて研究されました。この研究では、レニンプロモーターがSox6の結合部位を有することが示されました。この研究のハイライトは、Sox6が、マウスにおける低塩分および脱水時のレニンおよびプロレニンの調節とJG細胞の増殖における重要な制御因子の一つであるということです。PMID 31760770; DOI: 10.1152/ajprenal.00095.2019

参照

参考文献

  1. ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000110693 – Ensembl、2017年5月
  2. ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000051910 – Ensembl、2017年5月
  3. ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  4. ^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  5. ^ Cohen-Barak O, Hagiwara N, Arlt MF, Horton JP, Brilliant MH (2001年3月). 「ヒトSOX6遺伝子のクローニング、特性評価、および染色体マッピング」. Gene . 265 ( 1–2 ): 157–164 . doi :10.1016/S0378-1119(01)00346-8. PMID  11255018.
  6. ^ ab "Entrez Gene: SOX6 SRY (性別決定領域Y)-ボックス6".
  7. ^ Murakami A, Ishida S, Thurlow J, Revest JM, Dickson C (2001年8月). 「SOX6はCtBP2に結合し、Fgf-3プロモーターからの転写を抑制する」. Nucleic Acids Research . 29 (16): 3347– 3355. doi :10.1093/nar/29.16.3347. PMC 55854. PMID 11504872  . 
  8. ^ 山下 明、伊藤 正之、高松 暢、柴 毅 (2000年9月). 「成体マウス精巣で発現する新規SoxLZ/Sox6結合タンパク質Soltの特性解析」. FEBS Letters . 481 (2): 147– 151. Bibcode :2000FEBSL.481..147Y. doi : 10.1016/S0014-5793(00)01987-6 . PMID  10996314. S2CID  20831354.
  9. ^ Cantu' C, Grande V, Alborelli I, Cassinelli L, Cantu' I, Colzani MT, et al. (2011年1月). 「高度に保存されたSOX6二重結合部位が赤血球系細胞におけるSOX6遺伝子のダウンレギュレーションを媒介する」. Nucleic Acids Research . 39 (2): 486– 501. doi :10.1093/nar/gkq819. PMC 3025548. PMID  20852263 . 
  10. ^ Cantù C, Ierardi R, Alborelli I, Fugazza C, Cassinelli L, Piconese S, et al. (2011年3月). 「Sox6はヒト赤血球系前駆細胞における赤血球分化を促進する」. Blood . 117 (13): 3669– 3679. doi : 10.1182/blood-2010-04-282350 . PMID  21263153.
  11. ^ Marchetto A, Ohmura S, Orth MF, Knott MM, Colombo MV, Arrigoni C, et al. (2020年5月). 「発達性転写因子の発癌性ハイジャックはユーイング肉腫において酸化ストレスに対する脆弱性を喚起する」. Nature Communications . 11 (1) 2423. Bibcode :2020NatCo..11.2423M. doi : 10.1038/s41467-020-16244-2 . PMC 7228971. PMID  32415069 . 

さらに読む

  • Denny P, Swift S, Brand N, Dabhade N, Barton P, Ashworth A (1992年6月). 「精巣決定遺伝子SRYに関連する保存された遺伝子ファミリー」. Nucleic Acids Research . 20 (11): 2887. doi :10.1093/nar/20.11.2887. PMC  336939. PMID  1614875 .
  • Lefebvre V, Li P, de Crombrugghe B (1998年10月). 「Sox5の新規長鎖型（L-Sox5）、Sox6、およびSox9は軟骨形成において共発現し、II型コラーゲン遺伝子を協調的に活性化する」. The EMBO Journal . 17 (19): 5718– 5733. doi :10.1093/emboj/17.19.5718. PMC  1170900. PMID  9755172 .
  • Hagiwara N, Klewer SE, Samson RA, Erickson DT, Lyon MF, Brilliant MH (2000年4月). 「Sox6はp100Hミオパチー、心ブロック、および新生児突然死の候補遺伝子である」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 97 (8): 4180– 4185. Bibcode :2000PNAS...97.4180H. doi : 10.1073/pnas.97.8.4180 . PMC  18189. PMID 10760285  .
  • 山下 明、伊藤 正之、高松 暢、柴 毅 (2000年9月). 「成体マウス精巣で発現する新規SoxLZ/Sox6結合タンパク質Soltの特性解析」. FEBS Letters . 481 (2): 147– 151. Bibcode :2000FEBSL.481..147Y. doi : 10.1016/S0014-5793(00)01987-6 . PMID  10996314. S2CID  20831354.
  • Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2000年11月). 「in vitro部位特異的組換えを用いたDNAクローニング」. Genome Research . 10 (11): 1788– 1795. doi :10.1101/gr.143000. PMC  310948. PMID  11076863 .
  • Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, et al. (2001年3月). 「ヒト遺伝子およびタンパク質のカタログ化に向けて：500種類の新規完全タンパク質コードヒトcDNAの配列決定と解析」. Genome Research . 11 (3): 422– 435. doi :10.1101/gr.GR1547R. PMC 311072.  PMID 11230166  .
  • 村上 明、石田 聡、サーロウ J、レベスト JM、ディクソン C (2001年8月). 「SOX6はCtBP2に結合し、Fgf-3プロモーターからの転写を抑制する」. Nucleic Acids Research . 29 (16): 3347– 3355. doi :10.1093/nar/29.16.3347. PMC  55854. PMID  11504872 .
  • Cohen-Barak O、Yi Z、Hagiwara N、Monzen K、Komuro I、Brilliant MH (2003 年 10 月)。 「心筋細胞発達のSox6制御」。核酸研究。31 (20): 5941–5948。土井:10.1093/nar/gkg807。PMC  219484。PMID  14530442。
  • Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, 他 (2004年10月). 「ORFeomeから生物学へ：機能ゲノミクスパイプライン」. Genome Research . 14 (10B): 2136– 2144. doi :10.1101/gr.2576704. PMC 528930.  PMID 15489336  .
  • 上田 亮, 吉田 健, 川上 雄一, 川瀬 剛, 戸田 正之 (2005). 「ヒト神経膠腫における転写因子SOX6の発現」.脳腫瘍病理学. 21 (1): 35– 38. doi :10.1007/BF02482175. PMID  15696967. S2CID  23632021.
  • 上田 亮, 吉田 健, 川上 雄一, 川瀬 剛, 戸田 正之 (2005). 「ヒト脳腫瘍におけるSOX6発現の免疫組織化学的解析」. 脳腫瘍病理学. 21 (3): 117– 120. doi :10.1007/BF02482186. PMID  15696972. S2CID  27841927.
  • Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F, et al. (2006年1月). 「LIFEdbデータベース 2006」. Nucleic Acids Research . 34 (データベース号): D415 – D418 . doi :10.1093/nar/gkj139. PMC 1347501.  PMID 16381901  .
  • Fernández-Lloris R, Osses N, Jaffray E, Shen LN, Vaughan OA, Girwood D, et al. (2006年2月). 「SUMO修飾によるSOX6転写活性の抑制」. FEBS Letters . 580 (5): 1215– 1221. Bibcode :2006FEBSL.580.1215F. doi : 10.1016/j.febslet.2006.01.031 . PMID:  16442531. S2CID  : 38625057.
  • 池田 哲也、斉藤 哲也、牛田 正人、矢野 文人、Kan A、井高 和也、他(2007 年 6 月)。 「ヒトSOX6プロモーターの同定と特性評価」。生化学および生物物理学研究コミュニケーション。357 (2): 383–390。書誌コード:2007BBRC..357..383I。土井：10.1016/j.bbrc.2007.03.133。PMID  17433257。

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