ゼブ2

ゼブ2
利用可能な構造
PDB	オーソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	2DA7
識別子
エイリアス	ZEB2、HSPC082、SIP-1、SIP1、SMADIP1、ZFHX1B、ジンクフィンガーEボックス結合ホメオボックス2
外部ID	オミム：605802; MGI : 1344407;ホモロジーン: 8868;ジーンカード：ZEB2; OMA :ZEB2 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
キリスト	染色体2（ヒト）
終わり	144,521,057 bp
遺伝子の位置（マウス）
キリスト	染色体2（マウス）
終わり	45,007,407 bp
RNA発現パターン
	上位の表現
	腓骨神経; ; 単球; ; C1セグメント; ; アキレス腱; ; 脳梁; ; 内淡蒼球; ; 迷走神経下神経節; ; 結腸上皮; ; 顆粒球; ; 扁桃体;
	上位の表現
	吻側回遊流; ; 骨髄間質; ; 臍帯; ; 人間の胎児; ; 歯状回; ; 虹彩; ; 海馬歯状回顆粒細胞; ; 海馬の区分; ; 海馬固有部I領域; ; 大腿骨体;
	より多くの参照表現データ
	より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー
分子機能	DNA結合; ホスファターゼ調節活性; 金属イオン結合; タンパク質結合; 核酸結合; DNA結合転写抑制活性、RNAポリメラーゼII特異的; DNA結合転写活性化因子活性、RNAポリメラーゼII特異的; R-SMAD結合; 配列特異的DNA結合; DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的;
細胞成分	核; 核小体; 細胞質;
生物学的プロセス	転写の制御、DNAテンプレート; 神経系の発達; 転写、DNAテンプレート; メラニン生合成プロセスの正の調節; RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御; 神経堤細胞の移動; 体節形成; 神経管閉鎖; RNAポリメラーゼIIによる転写; 中枢神経系の発達; 脳梁の形態形成; 海馬の発達; 前脳における細胞増殖; 皮質脊髄路の形態形成; Wntシグナル伝達経路の正の制御; JUNキナーゼ活性の正の制御; メラノサイト分化の正の調節; RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御; 発達性色素沈着; 胚の形態形成; 副次的な芽生え; 軸索形成の正の調節; 乳頭軸索複合体の発達; メラノサイトの移動; 水晶体線維細胞分化の正の調節; メラノソーム組織の調節;
	出典：Amigo / QuickGO
オルソログ
	9839
	24136
	ENSG00000169554
	ENSMUSG00000026872
	O60315
	Q9R0G7
	NM_001171653 ; NM_014795
NM_015753 ; NM_001289521 ; NM_001355288 ; NM_001355289 ; NM_001355290;
	NM_001355291
	NP_001165124 ; NP_055610
NP_001276450 ; NP_056568 ; NP_001342217 ; NP_001342218 ; NP_001342219;
	NP_001342220
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

ジンクフィンガーEボックス結合ホメオボックス2は、ヒトではZEB2遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5] ZEB2タンパク質は、胎児発育初期に不可欠な形質転換成長因子β （TGFβ）シグナル伝達経路において役割を果たす転写因子である。^[6]

関数

ZEB2（以前はSMADIP1、SIP1としても知られていた）とその哺乳類パラログZEB1は、ホメオドメイン転写因子のZF（ジンクフィンガー）クラスに属するZebファミリーに属します。ZEB2タンパク質は8つのジンクフィンガーと1つのホメオドメインを有します。^[7]右にホメオドメインの構造を示します。

ZEB2は受容体を介した活性化全長SMADと相互作用する。^{[5] TGFβ受容体の活性化は、細胞内エフェクター分子であるR-SMADのリン酸化を引き起こす。ZEB2はR-SMAD結合タンパク質であり、転写抑制因子として作用する。ZEB2は、初期発生における}神経上皮細胞から放射状グリア細胞への転換のタイミングに関与しており、このメカニズムがヒトと他の哺乳類の脳の大きさの大きな違いを生じさせていると考えられている。^[8]

ZEB2転写産物は、脳神経節、脊髄神経節、交感神経節鎖、腸管神経系、メラノサイトなど、神経堤から分化した組織に存在します。また、消化管壁、腎臓、骨格筋など、神経堤に由来しない組織にも存在します。

臨床的意義

ZEB2遺伝子の変異は、モワット・ウィルソン症候群と関連しています。この疾患では、ZEB2遺伝子の変異、さらには完全な欠失が見られます。遺伝子の変異により、機能しないZEB2タンパク質が産生されたり、遺伝子全体の機能が不活性化されたりすることがあります。ZEB2タンパク質のこのような欠損は、多くの臓器の発達を阻害します。症状の多くは、神経堤構造の発達異常によって説明できます。^[9]

ヒルシュスプルング病にも、消化管神経の発達期におけるZEB2の欠損によって説明できる多くの症状があります。この病気は、重度の便秘と結腸肥大を引き起こします。^[10]

慢性B型肝炎における肝細胞癌および肝硬変のリスクは、劣性遺伝モデルにおいて、ZEB2のプロモーター領域におけるrs3806475と呼ばれる一塩基多型と関連していることが報告されている。 ^[11]

参考文献

^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000169554 – Ensembl、2017年5月
^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000026872 – Ensembl、2017年5月
^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
^ ab 「Entrez Gene: ZEB2 ジンクフィンガー E ボックス結合ホメオボックス 2」。
^ Bassez G, Camand OJ, Cacheux V, Kobetz A, Dastot-Le Moal F, Marchant D, et al. (2004年3月). 「マウスおよびヒトの発達過程におけるZFHX1B遺伝子転写産物の多面的かつ多様な発現は、「モワット・ウィルソン」症候群の多様な臨床症状を裏付ける」Neurobiology of Disease . 15 (2): 240–50 . doi :10.1016/j.nbd.2003.10.004. PMID 15006694. S2CID 25770329.
^ Bürglin TR , Affolter M (2016年6月). 「ホメオドメインタンパク質：最新情報」. Chromosoma . 125 (3): 497– 521. doi :10.1007/s00412-015-0543-8. PMC 4901127. PMID 26464018.
^ ベニート=クウィチンスキー S、ジャンドメニコ SL、サトクリフ M、リース ES、フレイレ=プリチェット P、ケラヴァ I、他。（2021年4月）。「初期の細胞形状の変化がヒトの前脳の進化的拡大を促す」。セル。184 (8): 2084–2102.e19。土井：10.1016/j.cell.2021.02.050。PMC 8054913。PMID 33765444。
^ Dastot-Le Moal F, Wilson M, Mowat D, Collot N, Niel F, Goossens M (2007年4月). 「モワット・ウィルソン症候群患者におけるZFHX1B遺伝子変異」. Human Mutation . 28 (4): 313–21 . doi :10.1002/humu.20452. PMID 17203459. S2CID 37981110.
^ Saunders CJ, Zhao W, Ardinger HH (2009年11月). 「北米コホートにおけるモワット・ウィルソン症候群の包括的ZEB2遺伝子解析：分子診断への示唆されるアプローチ」. American Journal of Medical Genetics Part A. 149A ( 11): 2527–31 . doi :10.1002/ajmg.a.33067. PMID 19842203. S2CID 22472646.
^ Liu WX, Yang L, Yan HM, Yan LN, Zhang XL, Ma N, et al. (2021). Argentiero A, Mehta R, Wang S (編). 「生殖細胞系列変異および複数のEMT制御遺伝子の遺伝的相互作用はHBV関連肝細胞癌のリスクを増大させる」. Frontiers in Oncology . 11 564477. doi : 10.3389/fonc.2021.564477 . PMC 8226114. PMID 34178612 . この記事には、CC BY 4.0 ライセンスの下で利用可能なこのソースからのテキストが組み込まれています。

さらに読む

Mowat DR, Wilson MJ, Goossens M (2003年5月). 「Mowat-Wilson症候群」. Journal of Medical Genetics . 40 (5): 305–10 . doi :10.1136/jmg.40.5.305. PMC 1735450. PMID 12746390 .
長瀬剛志、石川健、宮島暢、田中明、小谷秀、野村暢、他 (1998年2月). 「未同定ヒト遺伝子のコード配列の予測 IX. in vitroで巨大タンパク質をコードできる脳由来の新規cDNAクローン100個の完全配列」. DNA Research . 5 (1): 31–9 . CiteSeerX 10.1.1.610.1181 . doi : 10.1093/dnares/5.1.31 . PMID 9628581.
植木暢、小田剛、近藤正之、矢野健、野口剛、村松正之 (1998年12月). 「核標的タンパク質をコードする遺伝子の選択システム」. Nature Biotechnology . 16 (13): 1338–42 . doi :10.1038/4315. PMID 9853615. S2CID 20001769.
Verschueren K, Remacle JE, Collart C, Kraft H, Baker BS , Tylzanowski P, et al. (1999年7月). 「新規ジンクフィンガー／ホメオドメインリプレッサーSIP1はSmadタンパク質と相互作用し、候補標的遺伝子の5'-CACCT配列に結合する」The Journal of Biological Chemistry . 274 (29): 20489–98 . doi : 10.1074/jbc.274.29.20489 . PMID 10400677.
若松暢、山田雄一、山田健、小野剛、野村暢、谷口秀、他 (2001年4月). 「Smad相互作用タンパク質-1をコードするSIP1遺伝子の変異は、ヒルシュスプルング病の一種を引き起こす」. Nature Genetics . 27 (4): 369–70 . doi :10.1038/86860. PMID 11279515. S2CID 39070888.
Comijn J、Berx G、Vermassen P、Verschueren K、van Grunsven L、Bruyneel E、他。 (2001 年 6 月)。「両手型 E ボックス結合ジンクフィンガータンパク質 SIP1 は E-カドヘリンを下方制御し、浸潤を誘導します。」分子細胞。7 (6): 1267 – 78。土井: 10.1016/S1097-2765(01)00260-X。PMID 11430829。
Cacheux V、Dasot-Le Moal F、Kääriäinen H、Bondurand N、Rintala R、Boissier B、他。 (2001 年 7 月)。「SIP1 Smad相互作用タンパク質1の機能喪失変異は、症候群性ヒルシュスプルング病を引き起こす」。ヒト分子遺伝学。10 (14): 1503 – 10.土井: 10.1093/hmg/10.14.1503。PMID 11448942。
Tylzanowski P, Verschueren K, Huylebroeck D, Luyten FP (2001年10月). 「Smad相互作用タンパク質1は、C2C12細胞の骨形成タンパク質誘導性骨分化において、肝／骨／腎アルカリホスファターゼ転写の抑制因子である」. The Journal of Biological Chemistry . 276 (43): 40001–7 . doi : 10.1074/jbc.M104112200 . PMID 11477103.
山田憲治、山田勇、野村暢、三浦憲治、若子亮、早川千恵子、他 (2001年12月). 「Smad相互作用タンパク質1をコードするZFHX1B遺伝子のナンセンス変異およびフレームシフト変異は、多様な臨床症状を示す複雑な発達障害を引き起こす」. American Journal of Human Genetics . 69 (6): 1178–85 . doi :10.1086/324343. PMC 1235530. PMID 11592033 .
Amiel J, Espinosa-Parrilla Y, Steffann J, Gosset P, Pelet A, Prieur M, 他 (2001年12月). 「正中線構造の病変を伴う症候群性ヒルシュスプルング病における大規模欠失およびSMADIP1切断変異」. American Journal of Human Genetics . 69 (6): 1370–7 . doi :10.1086/324342. PMC 1235547. PMID 11595972 .
Zweier C, Albrecht B, Mitulla B, Behrens R, Beese M, Gillessen-Kaesbach G, et al. (2002年3月). 「ヒルシュスプルング病の有無にかかわらず、モワット・ウィルソン症候群は、ジンクフィンガーホメオボックス1B遺伝子の変異によって引き起こされる、明確に区別できる多発性先天異常・精神遅滞症候群である」. American Journal of Medical Genetics . 108 (3): 177–81 . doi : 10.1002/ajmg.10226 . PMID 11891681.
長谷正治、加藤潤、新見暢、田中聡、若松暢（2002年8月）. 「新たな遺伝子異常によって引き起こされるヒルシュスプルング病の一型の臨床的特徴」.小児外科ジャーナル. 37 (8): 1117–22 . doi :10.1053/jpsu.2002.34455. PMID 12149685.
Guaita S, Puig I, Franci C, Garrido M, Dominguez D, Batlle E, et al. (2002年10月). 「腫瘍細胞における上皮細胞から間葉系への移行を誘導するSnailは、MUC1の抑制とZEB1の発現を伴う」. The Journal of Biological Chemistry . 277 (42): 39209–16 . doi : 10.1074/jbc.M206400200 . PMID 12161443.
エスピノーサ＝パリラ Y、アミエル J、オージェ J、エンチャ＝ラザヴィ F、ミュンヘン A、リヨネ S他(2002 年 6 月)。「ヒト発生初期におけるSMADIP1遺伝子の発現」。発達のメカニズム。114 ( 1–2 ): 187– 91.土井:10.1016/S0925-4773(02)00062-X。PMID 12175509。S2CID 18645909 。
米田正人、藤田哲也、山田裕貴、山田和人、藤井亜人、稲垣拓也、他(2002 年 11 月)。「後期乳児期ヒルシュスプルング病 - ZFHX1B の 3 bp 欠失を伴う精神遅滞症候群」。神経内科。59 (10): 1637–40 .土井:10.1212/01.wnl.0000034842.78350.4e。PMID 12451214。S2CID 34389990 。
Postigo AA (2003年5月). 「TGFβ/BMPシグナル伝達経路の制御におけるZEBタンパク質の相反する機能」. EMBOジャーナル. 22 (10): 2443–52 . doi :10.1093/emboj/cdg225. PMC 155983. PMID 12743038 .
Postigo AA, Depp JL, Taylor JJ, Kroll KL (2003年5月). 「ZEBタンパク質によるコアクチベーターとコリプレッサーの異なるリクルートメントを介したSmadシグナル伝達の制御」. The EMBO Journal . 22 (10): 2453–62 . doi :10.1093/emboj/cdg226. PMC 155984. PMID 12743039 .
Zweier C、Temple IK、Beemer F、Zackai E、Lerman-Sagie T、Weschke B、他。 (2003 年 8 月)。「モワット・ウィルソン症候群におけるZFHX1B領域の欠失の特徴付けと遺伝子型表現型分析」。医学遺伝学ジャーナル。40 (8): 601–5 .土井:10.1136/jmg.40.8.601。PMC 1735564。PMID 12920073。

外部リンク

GeneReviews/NIH/NCBI/UW のモワット・ウィルソン症候群に関するエントリー
ZEB2+タンパク質、+ヒト米国国立医学図書館医学件名表題集（MeSH）

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000169554 – Ensembl、2017年5月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000026872 – Ensembl、2017年5月

[3] 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[4] 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[entrez-5] 「Entrez Gene: ZEB2 ジンクフィンガー E ボックス結合ホメオボックス 2」。

[6] Bassez G, Camand OJ, Cacheux V, Kobetz A, Dastot-Le Moal F, Marchant D, et al. (2004年3月). 「マウスおよびヒトの発達過程におけるZFHX1B遺伝子転写産物の多面的かつ多様な発現は、「モワット・ウィルソン」症候群の多様な臨床症状を裏付ける」Neurobiology of Disease . 15 (2): 240–50 . doi :10.1016/j.nbd.2003.10.004. PMID 15006694. S2CID 25770329.

[pmid26464018-7] ^ Bürglin TR , Affolter M (2016年6月). 「ホメオドメインタンパク質：最新情報」. Chromosoma . 125 (3): 497– 521. doi :10.1007/s00412-015-0543-8. PMC 4901127. PMID 26464018.

[8] ベニート=クウィチンスキー S、ジャンドメニコ SL、サトクリフ M、リース ES、フレイレ=プリチェット P、ケラヴァ I、他。（2021年4月）。「初期の細胞形状の変化がヒトの前脳の進化的拡大を促す」。セル。184 (8): 2084–2102.e19。土井：10.1016/j.cell.2021.02.050。PMC 8054913。PMID 33765444。

[9] Dastot-Le Moal F, Wilson M, Mowat D, Collot N, Niel F, Goossens M (2007年4月). 「モワット・ウィルソン症候群患者におけるZFHX1B遺伝子変異」. Human Mutation . 28 (4): 313–21 . doi :10.1002/humu.20452. PMID 17203459. S2CID 37981110.

[10] Saunders CJ, Zhao W, Ardinger HH (2009年11月). 「北米コホートにおけるモワット・ウィルソン症候群の包括的ZEB2遺伝子解析：分子診断への示唆されるアプローチ」. American Journal of Medical Genetics Part A. 149A ( 11): 2527–31 . doi :10.1002/ajmg.a.33067. PMID 19842203. S2CID 22472646.

[11] Liu WX, Yang L, Yan HM, Yan LN, Zhang XL, Ma N, et al. (2021). Argentiero A, Mehta R, Wang S (編). 「生殖細胞系列変異および複数のEMT制御遺伝子の遺伝的相互作用はHBV関連肝細胞癌のリスクを増大させる」. Frontiers in Oncology . 11 564477. doi : 10.3389/fonc.2021.564477 . PMC 8226114. PMID 34178612 . この記事には、CC BY 4.0 ライセンスの下で利用可能なこのソースからのテキストが組み込まれています。