ILF3

ILF3
利用可能な構造
PDBオーソログ検索: PDBe RCSB
識別子
エイリアスILF3、CBTF、DRBF、DRBP76、MMP4、MPHOSPH4、MPP4、NF-AT-90、NF110、NF110b、NF90、NF90a、NF90b、NFAR、NFAR-1、NFAR2、TCP110、TCP80、インターロイキンエンハンサー結合因子3、NFAR110、MPP4110、NFAR-2、NF90c、NFAR90、NF90ctv
外部IDオミム: 603182 ; MGI : 1339973 ;ホモロジーン: 7785 ;ジーンカード: ILF3 ; OMA : ILF3 - オルソログ
オーソログ
種人間ねずみ
エントレズ

3609

16201

アンサンブル

ENSG00000129351

ENSMUSG00000032178

ユニプロット

Q12906

Q9Z1X4

RefSeq (mRNA)

NM_001137673 NM_004516 NM_012218 NM_017620 NM_153464

RefSeq（タンパク質）

NP_001131145 NP_004507 NP_036350 NP_060090 NP_703194

場所（UCSC）19章: 10.65 – 10.69 MB9章: 21.28 – 21.32 Mb
PubMed検索[ 3 ][ 4 ]
ウィキデータ
人間の表示/編集マウスの表示/編集

インターロイキンエンハンサー結合因子3は、ヒトではILF3遺伝子によってコードされるタンパク質である。[ 5 ] [ 6 ]

関数

活性化T細胞核因子（NFAT）は、T細胞におけるインターロイキン2の発現に必要な転写因子である。NFATは、IL2エンハンサー内の抗原受容体応答配列2として知られる配列に結合する。さらに、NFATはRNAに結合し、 B型肝炎ウイルスポリメラーゼのキャプシド形成およびタンパク質プライミングに不可欠な構成要素である。NFATは45 kDaと90 kDaのタンパク質からなるヘテロ二量体であり、そのうち大きい方のタンパク質がこの遺伝子の産物である。コードされているタンパク質は主にリボソームに局在し、mRNA伸長レベルで転写を制御していると考えられる。この遺伝子には、3つの異なるアイソフォームをコードする少なくとも3つの転写バリアントが見つかっている。[ 7 ]

相互作用

ILF3 は以下と相互作用することが示されています。

NF90/ILF3関連RNA（snaR）は、約120ヌクレオチド長の小型RNAで、ILF3二本鎖RNA結合モチーフと相互作用することが知られています。[ 17 ] snaR-Aはヒトの精巣に豊富に存在し、HeLa細胞のリボソームと結合することが示されている。snaR-Aはヒトとゴリラに存在するが、チンパンジーには存在しない。他のsnaR RNAは、アフリカの大型類人猿（チンパンジーとボノボを含む）に見られる。[ 18 ]

ILF2とILF3は、誘発性ループスマウスの自己抗原として同定されており[ 19 ] [ 20 ]、犬の全身性リウマチ性自己免疫疾患の自己抗原として同定されており[ 21 ]、また自己免疫疾患を持つヒトのまれな所見として同定されている[ 22 ] 。

参考文献

  1. ^ a b c GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000129351 – Ensembl、2017年5月
  2. ^ a b c GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000032178 – Ensembl、2017年5月
  3. ^ 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  4. ^ 「マウスPubMedリファレンス：」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  5. ^ Kao PN, Chen L, Brock G, Ng J, Kenny J, Smith AJ, Corthésy B (1994年8月). 「活性化T細胞のシクロスポリンAおよびFK506感受性核因子：NF45およびNF90のクローニングと発現」 . The Journal of Biological Chemistry . 269 (32): 20691–9 . doi : 10.1016/S0021-9258(17)32048-3 . PMID 7519613 . 
  6. ^ Matsumoto-Taniura N, Pirollet F, Monroe R, Gerace L, Westendorf JM (1996年9月). 「発現クローニングによる新規M期リン酸化タンパク質の同定」 . Molecular Biology of the Cell . 7 (9): 1455–69 . doi : 10.1091/mbc.7.9.1455 . PMC 275994. PMID 8885239 .  
  7. ^ 「Entrez Gene：ILF3インターロイキンエンハンサー結合因子3、90kDa」。
  8. ^ Ting NS, Kao PN, Chan DW, Lintott LG, Lees-Miller SP (1998年1月). 「DNA依存性プロテインキナーゼは抗原受容体応答配列結合タンパク質NF90およびNF45と相互作用する」 . The Journal of Biological Chemistry . 273 (4): 2136–45 . CiteSeerX 10.1.1.615.1747 . doi : 10.1074/jbc.273.4.2136 . PMID 9442054. S2CID 8781571 .   
  9. ^ a b Saunders LR, Perkins DJ, Balachandran S, Michaels R, Ford R, Mayeda A, Barber GN (2001年8月). 「mRNAプロセシングにおいて機能し、二本鎖RNA依存性プロテインキナーゼPKRと相互作用する、進化的に保存された2つの選択的スプライシング核リン酸化タンパク質NFAR-1およびNFAR-2の特性評価」 . The Journal of Biological Chemistry . 276 (34): 32300–12 . doi : 10.1074/jbc.M104207200 . PMID 11438536 . 
  10. ^ Tang J, Kao PN, Herschman HR (2000年6月). 「細胞内で主要なタンパク質アルギニンメチルトランスフェラーゼであるタンパク質アルギニンメチルトランスフェラーゼIは、インターロイキンエンハンサー結合因子3と相互作用し、その調節を受ける」 . The Journal of Biological Chemistry . 275 (26): 19866–76 . doi : 10.1074/jbc.M000023200 . PMID 10749851 . 
  11. ^ Lee J, Bedford MT (2002年3月). 「高密度タンパク質アレイを用いたアルギニンメチルトランスフェラーゼ基質としてのPABP1の同定」 . EMBO Reports . 3 (3): 268–73 . doi : 10.1093/embo-reports/ kvf052 . PMC 1084016. PMID 11850402 .  
  12. ^ Langland JO, Kao PN, Jacobs BL (1999年5月). 「活性化T細胞の核因子90：二本鎖RNA結合タンパク質であり、二本鎖RNA依存性タンパク質キナーゼPKRの基質である」.生化学. 38 (19): 6361–8 . doi : 10.1021/bi982410u . PMID 10320367 . 
  13. ^ Parker LM, Fierro-Monti I, Mathews MB (2001年8月). 「核因子90は真核生物の活性化開始因子2キナーゼである二本鎖RNA活性化プロテインキナーゼの基質および調節因子である」 . The Journal of Biological Chemistry . 276 (35): 32522–30 . doi : 10.1074/jbc.M104408200 . PMID 11438540 . 
  14. ^ Patel RC, Vestal DJ, Xu Z, Bandyopadhyay S, Guo W, Erme SM, Williams BR, Sen GC (1999年7月). 「二本鎖RNA結合核タンパク質DRBP76は、インターフェロン誘導性タンパク質キナーゼPKRによってリン酸化される」 . The Journal of Biological Chemistry . 274 (29): 20432–7 . doi : 10.1074/jbc.274.29.20432 . PMID 10400669 . 
  15. ^ Brownawell AM, Macara IG (2002年1月). 「新規カリオフェリンExportin-5は二本鎖RNA結合タンパク質の核外輸送を媒介する」 . The Journal of Cell Biology . 156 (1): 53– 64. doi : 10.1083/jcb.200110082 . PMC 2173575. PMID 11777942 .  
  16. ^ Chu L, Su MY, Maggi LB, Lu L, Mullins C, Crosby S, Huang G, Chng WJ, Vij R, Tomasson MH (2012年8月). 「多発性骨髄腫関連染色体転座は、オーファンsnoRNA ACA11を活性化し、酸化ストレスを抑制する」 . The Journal of Clinical Investigation . 122 (8): 2793– 806. doi : 10.1172/jci63051 . PMC 3408744. PMID 22751105 .  
  17. ^ Parrott AM, Mathews MB (2007). 「急速に進化する新規ヒト科RNAは核因子90に結合し、組織特異的に分布する」 . Nucleic Acids Research . 35 (18): 6249–58 . doi : 10.1093 / nar/gkm668 . PMC 2094060. PMID 17855395 .  
  18. ^ Parrott AM, Tsai M, Batchu P, Ryan K, Ozer HL, Tian B, Mathews MB (2011年3月). 「snaRファミリーの低分子非コードRNAの進化と発現」 . Nucleic Acids Research . 39 (4): 1485–500 . doi : 10.1093/nar/ gkq856 . PMC 3045588. PMID 20935053 .  
  19. ^ Satoh M, Shaheen VM, Kao PN, Okano T, Shaw M, Yoshida H, Richards HB, Reeves WH (1999年12月). 「自己抗体は、保存された二本鎖RNA結合ドメインとDNA結合活性を持つタンパク質ファミリーを定義する」 . The Journal of Biological Chemistry . 274 (49): 34598–604 . doi : 10.1074/jbc.274.49.34598 . PMID 10574923 . 
  20. ^黒田雄一、小野尚志、赤尾木淳、ナシオナルズDC、山崎雄二、バーカーTT、リーブスWH、佐藤正治（2006年2月）「BALB/cマウスにおけるn-ヘキサデカンの腹腔内投与による非特異的炎症によるループス関連特異的自己抗体の誘導」毒性学誌218 ( 2–3 ) : 186–96 . Bibcode : 2006Toxgy.218..186K . doi : 10.1016/j.tox.2005.10.011 . PMID 16309812 . 
  21. ^ Bremer HD、Landegren N、Sjöberg R、Hallgren Å、Renneker S、Lattwein E、Leonard D、Eloranta ML、Rönnblom L、Nordmark G、Nilsson P、Andersson G、Lilliehöök I、Lindblad-Toh K、Kämpe O、Hansson-Hamlin H (2018 年 3 月)。「ILF2 と ILF3 はイヌの全身性自己免疫疾患における自己抗原です。 」科学的報告書。8 (1) 4852。ビブコード: 2018NatSR...8.4852B。土井：10.1038/s41598-018-23034-w。PMC 5859008。PMID 29556082。  
  22. ^ Satoh M, Shaheen VM, Kao PN, Okano T, Shaw M, Yoshida H, Richards HB, Reeves WH (1999年12月). 「自己抗体は、保存された二本鎖RNA結合ドメインとDNA結合活性を持つタンパク質ファミリーを定義する」 . The Journal of Biological Chemistry . 274 (49): 34598–604 . doi : 10.1074/jbc.274.49.34598 . PMID 10574923 . 

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