ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
SMAD6 識別子 エイリアス SMAD6 、AOVD2、HsT17432、MADH6、MADH7、SMADファミリーメンバー6 外部ID オミム :602931; MGI : 1336883; ホモロジーン : 4079; ジーンカード :SMAD6; OMA :SMAD6 - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) キリスト 9番染色体(マウス) [2] バンド 9|9 C 始める 63,860,358 bp [2] 終わり 63,929,341 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) 上位の表現 右肺 糸球体 後腎糸球体 肺の下葉 右心耳 肺の上葉 左肺の上葉 臓側胸膜 脈絡叢上皮 甲状腺の右葉
上位の表現 右肺 右肺葉 大臼歯 アトリウム メソルキウム 胃上皮 第四脳室脈絡叢 外頸動脈 左肺 原腸胚
より多くの参照表現データ
バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 DNA結合 R-SMAD結合 I型トランスフォーミング成長因子β受容体結合 共SMAD結合 I-SMAD結合 DNA結合転写因子活性 クロマチン結合 I型アクチビン受容体結合 金属イオン結合 RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合 タンパク質結合 同一のタンパク質結合 ユビキチンタンパク質リガーゼ結合 DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 細胞成分 細胞質 転写調節因子複合体 細胞内解剖学的構造 核 ゴルジ体 細胞質 核体 タンパク質含有複合体 生物学的プロセス 尿管芽の発達 心臓弁の発達 転写の制御、DNAテンプレート 心室中隔の発達 背腹軸の接合子による指定 SMADタンパク質複合体の組み立ての負の制御 層流流体せん断応力に対する応答 アポトーシス過程の負の調節 トランスフォーミング成長因子β受容体シグナル伝達経路の負の制御 冠動脈の発達 BMPシグナル伝達経路 転写、DNAテンプレート 経路制限性SMADタンパク質リン酸化の負の制御 エストロゲンへの反応 BMPシグナル伝達経路の負の制御 大動脈の発達 細胞基質接着 免疫反応 トランスフォーミング成長因子β受容体シグナル伝達経路 脂肪細胞の分化 細胞集団増殖の負の調節 RNAポリメラーゼIIによるpri-miRNA転写の正の制御 流出路中隔の形態形成 僧帽弁の形態形成 肺弁の形態形成 骨化の負の調節 大動脈弁の形態形成 骨芽細胞分化の負の制御 リポ多糖類に対する反応 出典:Amigo / QuickGO
ウィキデータ
SMADファミリーメンバー6は SMAD6 としても知られ 、ヒトでは SMAD6 遺伝子 によってコードされる タンパク質 である。 [5]
SMAD6は、その名の通り、ショウジョウバエ 遺伝子「 mothers against decapentaplegic 」のホモログであるタンパク質です 。SMADファミリータンパク質は、TGFβスーパーファミリーの調節因子に属します 。 他 の多くのTGFβファミリーメンバーと同様に、SMAD6は 細胞シグナル伝達 に関与しています。SMAD6は、 SMAD4 と競合して SMAD4 遺伝子産物の転写を阻害することにより、TGFβファミリー( 骨形成タンパク質 など)の活性を調節する役割を果たします 。このタンパク質には2つのアイソフォームが知られています。
命名法 SMADタンパク質は、ショウジョウバエのタンパク質「Mothers Against Decapentaplegic(MAD)」と 線虫の タンパク質「SMA」の両方の相同遺伝子です。この名称は、これら2つを組み合わせたものです。 ショウジョウバエの 研究において、母親の MAD 遺伝子の変異が、胎児の decapentaplegic 遺伝子を抑制することが明らかになりました。「Mothers Against(反対する母親たち)」というフレーズは、様々な問題に反対する団体(例えば、飲酒運転反対母親の会 (MADD)など)をユーモラスに揶揄したもの で、遺伝子研究コミュニティにおけるこのような変わった命名の伝統に基づいています。 [6]
疾患の関連性 SMAD6のヘテロ接合性の損傷変異は、現在までに確認されている非症候性頭蓋縫合早期 癒合症 の最も一般的な遺伝的原因である。 [7]
相互作用 デカペンタプレジックホモログ6に対する母親は、以下と 相互作用する ことが示されています。
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さらに読む Massagué J (1998). 「TGF-βシグナル伝達」. Annu. Rev. Biochem . 67 : 753–91 . doi : 10.1146/annurev.biochem.67.1.753 . PMID 9759503. Verschueren K, Huylebroeck D (2000). 「形質転換成長因子β活性化細胞の核におけるSmadタンパク質の驚くべき多様性」. サイトカイン成長因子 Rev. 10 ( 3–4 ) : 187–99 . doi :10.1016/S1359-6101(99)00012-X. PMID 10647776. Wrana JL, Attisano L (2000). 「Smad経路」. サイトカイン成長因子 Rev. 11 ( 1–2 ) : 5–13 . doi :10.1016/S1359-6101(99)00024-6. PMID 10708948. 宮園 憲一 (2000). 「Smadタンパク質によるTGF-βシグナル伝達」. サイトカイン成長因子 Rev. 11 ( 1–2 ) : 15–22 . doi :10.1016/S1359-6101(99)00025-8. PMID 10708949. Riggins GJ, Thiagalingam S, Rozenblum E, Weinstein CL, Kern SE, Hamilton SR, Willson JK, Markowitz SD, Kinzler KW, Vogelstein B (1996). 「ヒトにおける狂気関連遺伝子」. Nat. Genet . 13 (3): 347–9 . doi :10.1038/ng0796-347. PMID 8673135. S2CID 10124489. Topper JN, Cai J, Qiu Y, Anderson KR, Xu YY, Deeds JD, Feeley R, Gimeno CJ, Woolf EA, Tayber O, Mays GG, Sampson BA, Schoen FJ, Gimbrone MA, Falb D (1997). 「血管MAD:ヒト血管内皮細胞において血流によって選択的に誘導される2つの新規MAD関連遺伝子」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 (17): 9314–9 . Bibcode :1997PNAS...94.9314T. doi : 10.1073/pnas.94.17.9314 . PMC 23174. PMID 9256479 . Hata A, Lagna G, Massagué J, Hemmati-Brivanlou A (1998). 「Smad6はSmad4腫瘍抑制因子と特異的に競合することでBMP/Smad1シグナル伝達を阻害する」 Genes Dev . 12 (2): 186–97 . doi :10.1101/gad.12.2.186. PMC 316444. PMID 9436979 . アフラクテ M、モレン A、ジョッサン S、伊藤 S、サンパス K、ウェスターマルク B、ヘルディン CH、ヘルディン NE、テン ダイケ P (1998)。 「TGF-βファミリーメンバーによる抑制性Smad6およびSmad7 mRNAの誘導」。 生化学。生物物理学。解像度共通 。 249 (2): 505–11 。 書誌コード :1998BBRC..249..505A。 土井 :10.1006/bbrc.1998.9170。 PMID 9712726。 Galvin KM, Donovan MJ, Lynch CA, Meyer RI, Paul RJ, Lorenz JN, Fairchild-Huntress V, Dixon KL, Dunmore JH, Gimbrone MA, Falb D, Huszar D (2000). 「心血管系の発達と恒常性維持におけるsmad6の役割」 Nat. Genet . 24 (2): 171–4 . doi :10.1038/72835. PMID 10655064. S2CID 24365746. Bai S, Shi X, Yang X, Cao X (2000). 「転写コリプレッサーとしてのSmad6」. J. Biol. Chem . 275 (12): 8267–70 . doi : 10.1074/jbc.275.12.8267 . PMID 10722652. 木村 暢、松尾 亮、渋谷 秀、中島 健、多賀 剛 (2000). 「BMP2誘導性アポトーシスは、Smad6によって負に制御されるTAK1-p38キナーゼ経路の活性化を介して誘導される」 J. Biol. Chem . 275 (23): 17647–52 . doi : 10.1074/jbc.M908622199 . PMID 10748100. Datta PK, Moses HL (2000). 「STRAPとSmad7はトランスフォーミング成長因子βシグナル伝達の阻害において相乗効果を発揮する」. Mol. Cell. Biol . 20 (9): 3157–67 . doi :10.1128/MCB.20.9.3157-3167.2000. PMC 85610. PMID 10757800 . 海老沢 剛志、福地 正治、村上 剛志、千葉 剛志、田中 健、今村 剛志、宮園 健志 (2001). 「Smurf1はSmad7を介してトランスフォーミング成長因子βI型受容体と相互作用し、受容体の分解を誘導する」 J. Biol. Chem . 276 (16): 12477–80 . doi : 10.1074/jbc.C100008200 . PMID 11278251. 伊藤 文雄、浅尾 浩、菅村 健、ヘルディン CH、テン・ダイケ P、伊藤 誠 (2001). 「抑制性Smadの負の制御による骨形成タンパク質シグナル伝達の促進」. EMBO J. 20 ( 15): 4132–42 . doi :10.1093/emboj/20.15.4132. PMC 149146. PMID 11483516 . 柳沢正人、中島和也、武田和久、落合和人、滝沢哲也、上野正人、滝沢正人、渋谷宏、多賀哲也 (2002) 「Smad6 および Smad7 による BMP2 誘導性、TAK1 キナーゼ媒介性の神経突起伸長の阻害」。 遺伝子細胞 。 6 (12): 1091–9 . 土井 : 10.1046/j.1365-2443.2001.00483.x 。 PMID 11737269。S2CID 25476125 。 Schiffer M, Schiffer LE, Gupta A, Shaw AS, Roberts IS, Mundel P, Böttinger EP (2003). 「糸球体細胞における抑制性SMADとTGF-βシグナル伝達」. J. Am. Soc. Nephrol . 13 (11): 2657–66 . doi : 10.1097/01.ASN.0000033276.06451.50 . PMID 12397035.
(1)基本領域
(1.1)基本 ロイシンジッパー ( bZIP ) (1.2)基本ヘリックスループヘリックス ( bHLH )
グループA グループB グループC bHLH- PAS グループD グループE グループF bHLH-COE
(1.3) bHLH-ZIP (1.4)NF-1 (1.5)RF-X (1.6)基本ヘリックス・スパン・ヘリックス(bHSH)
(2.1) 核内受容体 ( Cys4 )
(2.2)その他の Cys4 (2.3)システイン 2 ヒスチジン 2 (2.4)システイン 6 (2.5)交互構成 (2.6)WRKY
(4) マイナーグルーブコンタクトを有するβ-スキャフォールド因子