NFYA

NFYA
利用可能な構造
PDBオーソログ検索: PDBe RCSB
識別子
エイリアスNFYA、CBF-A、CBF-B、HAP2、NF-YA、核転写因子Yサブユニットα
外部IDオミム：189903; MGI : 97316;ホモロジーン: 32114;ジーンカード：NFYA; OMA :NFYA - オルソログ
オーソログ
種人間ねずみ
エントレズ

4800

18044

アンサンブル

ENSG00000001167

ENSMUSG00000023994

ユニプロット

P23511

P23708

RefSeq (mRNA)

NM_021705
NM_002505

NM_001110832
NM_010913
NM_001347401
NM_001347402
NM_001374803

RefSeq（タンパク質）

NP_002496
NP_068351

NP_001104302
NP_001334330
NP_001334331
NP_035043
NP_001361732

場所（UCSC）6章: 41.07 – 41.1 Mb17章: 48.69 – 48.72 MB
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
人間の表示/編集マウスの表示/編集

核転写因子Yサブユニットαは、ヒトではNFYA遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]

関数

この遺伝子によってコードされるタンパク質は、三量体複合体NF-Yの1つのサブユニットであり、様々な遺伝子のプロモーター領域にあるCCAATモチーフに結合する高度に保存された転写因子を形成します。[7] NFYAサブユニットは、NFYBサブユニットとNFYCサブユニットからなる緊密な二量体と会合し、高い特異性および親和性でDNAに結合する三量体を形成します。複合体の配列特異的な相互作用はNFYAサブユニットによって行われるため、調節サブユニットとしての役割が示唆されています。さらに、この遺伝子産物には、タンパク質分解または翻訳制御による転写後制御の証拠があります。さらなる制御は、グルタミンに富む活性化ドメインにおける選択的スプライシングによって表され、2つのアイソフォームには明確な組織特異的な選好が見られます。[8]

NF-Y複合体は、クロマチンアクセシビリティを促進し、他の共局在する細胞型特異的転写因子を促進するパイオニア因子として機能します。 [9]

NF-Yは動物における転写開始部位（TSS）選択において中心的な役割を果たすことも示唆されている。[10] NF-Yはヌクレオソーム欠損領域の完全性とタンパク質コード遺伝子プロモーターにおけるPICの局在を保護する。

相互作用

NFYAは血清応答因子[11]およびZHX1 [11 ]と相互作用することが示されている。[ 12] NFYA、NFYB、NFYCはNFY複合体を形成し、NFY複合体はクロマチンアクセシビリティを促進して他の共局在する細胞型特異的転写因子を促進するパイオニア因子として機能することが示されている。[7]

構造

NFYヘテロ三量体とdsDNAの複合体の原子構造は、X線結晶構造解析によって解明された（PDB ID 4awl）。[13] NFYAのαヘリックスの一つを鋳型として、構造に着想を得たホチキス止めペプチドが設計され、NFYAがNFYB/Cヘテロ二量体に結合するのを阻害することでNFYヘテロ三量体の形成を阻害する。[14]

参考文献

  1. ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000001167 – Ensembl、2017年5月
  2. ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000023994 – Ensembl、2017年5月
  3. ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  4. ^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  5. ^ Li XY, Mattei MG, Zaleska-Rutczynska Z, et al. (1991年11月). 「転写因子NF-Yのサブユニットの一つは、マウスおよびヒト染色体において主要組織適合遺伝子複合体の近くに位置している」. Genomics . 11 (3): 630– 634. doi :10.1016/0888-7543(91)90070-U. PMID  1774067.
  6. ^ Maity SN, de Crombrugghe B (1998年5月). 「転写におけるCCAAT結合タンパク質CBF/NF-Yの役割」. Trends in Biochemical Sciences . 23 (5): 174– 178. doi :10.1016/S0968-0004(98)01201-8. PMID  9612081.
  7. ^ ab Oldfield AJ, Yang P, Conway AE, et al. (2014年9月). 「ヒストンフォールドドメインタンパク質NF-Yは細胞型特異的なマスター転写因子のクロマチンアクセシビリティを促進する」. Molecular Cell . 55 (5): 708– 722. doi :10.1016/j.molcel.2014.07.005. PMC 4157648. PMID 25132174  . 
  8. ^ 「Entrez Gene: NFYA 核転写因子Y、アルファ」。
  9. ^ Oldfield AJ, Yang P, Conway AE, et al. (2014年9月). 「ヒストンフォールドドメインタンパク質NF-Yは細胞型特異的マスター転写因子のクロマチンアクセシビリティを促進する」. Molecular Cell . 55 (5): 708– 722. doi :10.1016/j.molcel.2014.07.005. PMC 4157648. PMID  25132174 .  [確認が必要です]
  10. ^ Oldfield AJ, Henriques T, Kumar D, et al. (2019年7月). 「NF-Yはヌクレオソーム枯渇領域の維持を通じて遺伝子プロモーターにおける転写開始の忠実度を制御する」. Nature Communications . 10 (1) 3072. Bibcode :2019NatCo..10.3072O. doi : 10.1038/s41467-019-10905-7 . PMC 6624317. PMID  31296853 . 
  11. ^ ab Yamada K, Osawa H, Granner DK (1999年10月). 「NF-YAと相互作用するタンパク質の同定」. FEBS Letters . 460 (1): 41– 45. Bibcode :1999FEBSL.460...41Y. doi : 10.1016/S0014-5793(99)01311-3 . PMID  10571058. S2CID  28576187.
  12. ^ Yamada K, Printz RL, Osawa H, et al. (1999年8月). 「ヒトZHX1：クローニング、染色体上の位置、および転写因子NF-Yとの相互作用」.生化学および生物理学的研究通信. 261 (3): 614– 621. Bibcode :1999BBRC..261..614Y. doi :10.1006/bbrc.1999.1087. PMID  10441475.
  13. ^ ナルディーニ M、グネスッタ N、ドナーティ G、他。 （2013年1月）。 「配列特異的転写因子 NF-Y はヒストン様 DNA 結合と H2B 様ユビキチン化を示します。」セル。152 ( 1–2 ): 132–143 .土井:10.1016/j.cell.2012.11.047。hdl : 2318/1590740。PMID  23332751。
  14. ^ Jeganathan S, Wendt M, Kiehstaller S, et al. (2019年11月). 「微調整された柔軟性を持つ制約ペプチドはNF-Y転写因子の集合を阻害する」. Angewandte Chemie . 58 (48): 17351– 17358. doi :10.1002/anie.201907901. PMC 6900064. PMID 31539186  . 

さらに読む

  • Mantovani R (1999年10月). 「CCAAT結合因子NF-Yの分子生物学」. Gene . 239 (1): 15– 27. doi :10.1016/S0378-1119(99)00368-6. PMID  10571030.
  • Li XY, Mantovani R, Hooft van Huijsduijnen R, et al. (1992年3月). 「CCAAT結合転写因子NF-Yの進化的変異」. Nucleic Acids Research . 20 (5): 1087–1091 . doi :10.1093/nar/20.5.1087. PMC 312095.  PMID 1549471  .
  • Li XY, Hooft van Huijsduijnen R, Mantovani R, et al. (1992年5月). 「NF-Y遺伝子のイントロン-エクソン構造．組織特異的スプライシングによる活性化ドメインの修飾」. The Journal of Biological Chemistry . 267 (13): 8984– 8990. doi : 10.1016/S0021-9258(19)50377-5 . PMID  1577736.
  • Becker DM, Fikes JD, Guarente L (1991年3月). 「酵母における機能的相補性によりクローニングされたヒトCCAAT結合タンパク質をコードするcDNA」.米国科学アカデミー紀要. 88 (5): 1968–1972 . Bibcode :1991PNAS...88.1968B. doi : 10.1073/pnas.88.5.1968 . PMC  51147. PMID 2000400  .
  • Vuorio T, Maity SN, de Crombrugghe B (1990年12月). 「ラットヘテロ多量体CCAAT結合タンパク質のA鎖の精製と分子クローニング。酵母HAP3転写因子との配列同一性」. The Journal of Biological Chemistry . 265 (36): 22480– 22486. doi : 10.1016/S0021-9258(18)45730-4 . PMID  2266139.
  • Mantovani R, Li XY, Pessara U, et al. (1994年8月). 「NF-YAの優性負性アナログ」. The Journal of Biological Chemistry . 269 (32): 20340– 20346. doi : 10.1016/S0021-9258(17)31997-X . PMID  8051128.
  • Currie RA (1997年12月). 「NF-YのDNA結合サブユニット三量体化ドメインと高移動度群タンパク質HMG-I(Y)との機能的相互作用」. The Journal of Biological Chemistry . 272 (49): 30880– 30888. doi : 10.1074/jbc.272.49.30880 . PMID  9388234.
  • Currie RA (1998年7月). 「Bリンパ球発達におけるNF-Y転写因子複合体の生化学的特徴」. The Journal of Biological Chemistry . 273 (29): 18220–18229 . doi : 10.1074/jbc.273.29.18220 . PMID  9660784.
  • Roder K, Wolf SS, Larkin KJ, et al. (1999年6月). 「普遍的に発現する2つの転写因子NF-YとSp1の相互作用」. Gene . 234 (1): 61–69 . doi :10.1016/S0378-1119(99)00180-8. PMID  10393239.
  • Yamada K, Printz RL, Osawa H, et al. (1999年8月). 「ヒトZHX1：クローニング、染色体上の局在、および転写因子NF-Yとの相互作用」.生化学および生物理学的研究通信. 261 (3): 614– 621. Bibcode :1999BBRC..261..614Y. doi :10.1006/bbrc.1999.1087. PMID  10441475.
  • 山田 憲治, 大澤 秀, Granner DK (1999年10月). 「NF-YAと相互作用するタンパク質の同定」. FEBS Letters . 460 (1): 41– 45. Bibcode :1999FEBSL.460...41Y. doi : 10.1016/S0014-5793(99)01311-3 . PMID  10571058. S2CID  28576187.
  • Fan W, Jin S, Tong T, et al. (2002年3月). 「BRCA1はOCT-1およびCAATモチーフとの相互作用を介してGADD45を制御する」. The Journal of Biological Chemistry . 277 (10): 8061– 8067. doi : 10.1074/jbc.M110225200 . PMID  11777930.
  • Faniello MC, Chirico G, Quaresima B, et al. (2002年4月). 「c-JunによるHフェリチンプロモーター転写活性化の代替モデル」. The Biochemical Journal . 363 (Pt 1): 53– 58. doi :10.1042/0264-6021:3630053. PMC 1222450.  PMID 11903046  .
  • Bevilacqua MA, Faniello MC, Iovine B, et al. (2002年11月). 「転写因子NF-YはCaCo-2細胞の分化を制御する」.生化学・生物理学アーカイブ. 407 (1): 39– 44. doi :10.1016/S0003-9861(02)00436-8. PMID  12392713.
  • Ge Y、Jensen TL、Matherly LH 他(2002 年 12 月)。 「転写因子NF-YAアイソフォームおよびSp1によるヒトシスタチオニン-ベータ-シンターゼ-1bプロモーターの相乗的制御」。Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - 遺伝子の構造と発現。1579 ( 2–3 ): 73–80 .土井:10.1016/s0167-4781(02)00509-2。PMID  12427542。
  • Salsi V, Caretti G, Wasner M, et al. (2003年2月). 「p300と複数のNF-Y三量体との相互作用がサイクリンB2プロモーター機能を制御する」. The Journal of Biological Chemistry . 278 (9): 6642– 6650. doi : 10.1074/jbc.M210065200 . hdl : 11380/1202119 . PMID  12482752.
  • Peng Y, Jahroudi N (2003年3月). 「NFY転写因子はヒストン脱アセチル化酵素のリクルートメントを介して非内皮細胞におけるフォン・ヴィレブランド因子プロモーターの活性化を阻害する」. The Journal of Biological Chemistry . 278 (10): 8385– 8394. doi : 10.1074/jbc.M213156200 . PMID  12511565.

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