BATF（遺伝子）

Protein-coding gene in the species Homo sapiens

BATF
識別子
エイリアス	BATF、B-ATF、BATF1、SFA-2、SFA2、塩基性ロイシンジッパーATF様転写因子
外部ID	オミム：612476; MGI : 1859147;ホモロジーン: 4666;ジーンカード：BATF; OMA :BATF - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 14番染色体（ヒト）[1] バンド 14q24.3 始める 75,522,455 bp [1] 終わり 75,546,993 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 12番染色体（マウス）[2] バンド 12|12 D2 始める 85,733,443 bp [2] 終わり 85,755,861 bp [2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 顆粒球 血 単球 脾臓 リンパ節 付録 眼瞼結膜 睾丸 骨髄 鼻粘膜の嗅覚領域 上位の表現 顆粒球 胚 脾臓 胚 リンパ節 血 腸間膜リンパ節 胸腺 耳下腺 皮下脂肪組織 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 タンパク質結合 DNA結合転写活性化因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 DNA結合 配列特異的DNA結合 DNA結合転写因子活性 RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合 DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 細胞成分 細胞質 核質 核 生物学的プロセス RNAポリメラーゼIIによる転写の調節 細胞分化 転写の制御、DNAテンプレート 転写、DNAテンプレート RNAポリメラーゼIIによる転写 RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 Tヘルパー2細胞の分化 サイトカイン産生 DNA損傷応答、p53クラスメディエーターによるシグナル伝達 骨髄樹状細胞の分化 リンパ系前駆細胞の分化 Tヘルパー17細胞系譜へのコミットメント DNA損傷刺激に対する細胞応答 造血幹細胞の分化 アイソタイプスイッチング Tヘルパー17細胞の分化 原生動物に対する防御反応 サイトカインを介したシグナル伝達経路 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 10538 53314 アンサンブル ENSG00000156127 ENSMUSG00000034266 ユニプロット Q16520 O35284 RefSeq (mRNA) NM_006399 NM_016767 RefSeq（タンパク質） NP_006390 NP_058047 場所（UCSC） 14章: 75.52 – 75.55 Mb 12章: 85.73 – 85.76 Mb PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
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塩基性ロイシンジッパー転写因子（ATF様）はBATFとしても知られ、ヒトではBATF遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[5] [6] [7]}

関数

この遺伝子によってコードされるタンパク質は、核塩基性ロイシンジッパー（bZIP）タンパク質であり、転写因子AP-1 / ATFスーパーファミリーに属する。このタンパク質のロイシンジッパーは、Junファミリーのタンパク質と二量体形成を媒介する。このタンパク質は、AP-1/ATF転写イベントの負の調節因子であると考えられている。^[7]

BATF遺伝子を持たないマウス（BATFノックアウトマウス）は、炎症性免疫細胞（ Th17 ）の一種を欠いており、通常は多発性硬化症に似た自己免疫疾患を引き起こす症状に対して抵抗性を示した。^[8]

相互作用

BATF（遺伝子）はIFI35と相互作用することが示されている。^[9]

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000156127 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000034266 – Ensembl、2017年5月
3. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Dorsey MJ, Tae HJ, Sollenberger KG, Mascarenhas NT, Johansen LM, Taparowsky EJ (1995年12月). 「B-ATF：AP-1転写因子ファミリーのメンバーと会合する新規ヒトbZIPタンパク質」. Oncogene . 11 (11): 2255–65 . PMID  8570175.
6. 長谷川 浩, 宇都宮 雄一, 岸本 健, 丹下 雄一, 安川 正之, 藤田 聡 (1996年5月). 「ヒトT細胞白血病ウイルスI型によって誘導される新規bZIP転写因子SFA-2は成熟リンパ球で高発現する」. Biochem. Biophys. Res. Commun . 222 (1): 164– 70. Bibcode :1996BBRC..222..164H. doi :10.1006/bbrc.1996.0700. PMID  8630063.
7. 「Entrez Gene: BATF 塩基性ロイシンジッパー転写因子、ATF 様」。
8. Schraml BU, Hildner K, Ise W, Lee WL, Smith WA, Solomon B, Sahota G, Sim J, Mukasa R, Cemerski S, Hatton RD, Stormo GD, Weaver CT, Russell JH, Murphy TL, Murphy KM (2009年7月). 「AP-1転写因子BatfはTH17分化を制御する」. Nature 460 (7253): 405–9 . Bibcode :2009Natur.460..405S. doi : 10.1038/nature08114. PMC 2716014. PMID  19578362 . 
   • 「遺伝子が免疫細胞の身体への傷害能力を制御する」EurekAlert! (プレスリリース). 2009年7月16日.
9. Wang X, Johansen LM, Tae HJ, Taparowsky EJ (1996). 「IFP 35は転写因子AP1ファミリーの一員であるB-ATFと複合体を形成する」. Biochem. Biophys. Res. Commun . 229 (1): 316–22 . Bibcode :1996BBRC..229..316W. doi :10.1006/bbrc.1996.1799. PMID  8954125.

さらに読む

• ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實・岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ＝グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグ DS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、 Fraughton C、Llamosas E、Cevik S、Bex C、Lamesch P、Sikorski RS、Vandenhaute J、Zoghbi HY、Smolyar A、Bosak S、Sequerra R、Doucette-Stamm L、Cusick ME、Hill DE、Roth FP、Vidal M (2005)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。自然。437 (7062): 1173–8 . Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Deppmann CD, Thornton TM, Utama FE, Taparowsky EJ (2003). 「BATFのリン酸化はDNA結合を制御する：AP-1（アクチベータータンパク質-1）制御の新たなメカニズム」Biochem. J. 374 ( Pt 2): 423–31 . doi :10.1042/BJ20030455. PMC 1223616.  PMID 12809553  .
• Johansen LM, Deppmann CD, Erickson KD, Coffin WF, Thornton TM, Humphrey SE, Martin JM, Taparowsky EJ (2003). 「EBNA2と活性化NotchはBATFの発現を誘導する」. J. Virol . 77 (10): 6029–40 . doi :10.1128/JVI.77.10.6029-6040.2003. PMC  154003. PMID 12719594  .
• Williams KL, Zullo AJ, Kaplan MH, Brutkiewicz RR, Deppmann CD, Vinson C, Taparowsky EJ (2003). 「BATFトランスジェニックマウスはNKT細胞分化におけるアクチベータータンパク質1の役割を明らかにする」J. Immunol . 170 (5): 2417–26 . doi : 10.4049/jimmunol.170.5.2417 . PMID  12594265.
• Echlin DR, Tae HJ, Mitin N, Taparowsky EJ (2000). 「B-ATFはAP-1を介した転写の負の調節因子として機能し、RasおよびFosによる細胞形質転換を阻害する」Oncogene . 19 (14): 1752–63 . doi :10.1038/sj.onc.1203491. PMID  10777209. S2CID  21006485.
• Meyer NP, Johansen LM, Tae HJ, Budde PP, Williams KL, Taparowsky EJ (1998). 「EBVおよびHTLV-1による制御標的としてのヒトB-ATFのゲノム構成」Mamm. Genome . 9 (10): 849–52 . doi :10.1007/s003359900881. PMID  9745044. S2CID  36362547.
• Wang X, Johansen LM, Tae HJ, Taparowsky EJ (1997). 「IFP 35は転写因子AP1ファミリーの一員であるB-ATFと複合体を形成する」. Biochem. Biophys. Res. Commun . 229 (1): 316–22 . Bibcode :1996BBRC..229..316W. doi :10.1006/bbrc.1996.1799. PMID  8954125.
• 長谷川 浩, 宇都宮 雄一, 岸本 健, 丹下 雄一, 安川 正之, 藤田 誠 (1996). 「ヒトT細胞白血病ウイルスI型によって誘導される新規bZIP転写因子SFA-2は成熟リンパ球で高発現する」. Biochem. Biophys. Res. Commun . 222 (1): 164– 70. Bibcode :1996BBRC..222..164H. doi :10.1006/bbrc.1996.0700. PMID  8630063.
• Dorsey MJ, Tae HJ, Sollenberger KG, Mascarenhas NT, Johansen LM, Taparowsky EJ (1996). 「B-ATF：AP-1転写因子ファミリーのメンバーと会合する新規ヒトbZIPタンパク質」Oncogene . 11 (11): 2255–65 . PMID  8570175.

外部リンク

• 米国国立医学図書館の医学主題標目表（MeSH）におけるBATF+タンパク質、+ヒト
• ファクターブックBATF
• UCSC ゲノム ブラウザのヒト BATF ゲノムの位置と BATF 遺伝子の詳細ページ。

この記事には、パブリック ドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。

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