CBX3

CBX3
利用可能な構造
PDB	オーソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	3TZD、2L11、3DM1、3KUP
識別子
エイリアス	CBX3、HECH、HP1-GAMMA、HP1Hs-ガンマ、クロモボックス 3
外部ID	オミム: 604477; MGI : 108515;ホモロジーン: 40583;ジーンカード：CBX3; OMA :CBX3 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
キリスト	7番染色体（ヒト）
終わり	26,213,607 bp
遺伝子の位置（マウス）
キリスト	6番染色体（マウス）
終わり	51,460,684 bp
RNA発現パターン
	上位の表現
	内皮細胞; ; 神経節隆起; ; 臓側胸膜; ; 心室帯; ; 壁側胸膜; ; 胚上皮; ; 脛骨; ; 鼻咽頭上皮; ; 海綿骨; ; 子宮内膜;
	上位の表現
	心室帯; ; 性器結節; ; 胚; ; 胚; ; 胚の尾; ; 桑実胚; ; 海馬歯状回顆粒細胞; ; 胚盤胞; ; 卵黄嚢; ; 網膜の神経層;
	より多くの参照表現データ
	より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー
分子機能	タンパク質ドメイン特異的結合; ヒストンメチルトランスフェラーゼ結合; タンパク質結合; 同一のタンパク質結合; 酵素結合;
細胞成分	核膜; スピンドル; 核内膜; クロマチン; 染色体、セントロメア領域; 核; 凝縮染色体、セントロメア領域; 核質; DNA損傷部位; 老化関連ヘテロクロマチンフォーカス;
生物学的プロセス	クロマチンリモデリング; 転写の制御、DNAテンプレート; リズミカルなプロセス; 転写、DNAテンプレート; 転写の負の制御、DNAテンプレート; G0からG1への遷移の負の制御; クロマチン組織; DNA損傷刺激に対する細胞応答; デキサメタゾン刺激に対する細胞反応;
	出典：Amigo / QuickGO
オーソログ
	11335
	12417
	ENSG00000122565
	ENSMUSG00000029836
	Q13185
	P23198
	NM_007276 ; NM_016587
	NM_001037798 ; NM_007624 ; NM_001355002
	NP_009207 ; NP_057671
	該当なし
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

クロモボックスタンパク質ホモログ3は、ヒトのCBX3遺伝子によってコードされるタンパク質である。 ^[5]^[6]

核膜では、核ラミナとヘテロクロマチンが内核膜に隣接している。この遺伝子によってコードされるタンパク質はDNAに結合し、ヘテロクロマチンの構成要素である。このタンパク質は、内核膜に存在する膜貫通タンパク質であるラミンB受容体にも結合することができる。コードされるタンパク質の二重の結合機能は、ヘテロクロマチンと内核膜の結合を説明できる可能性がある。この遺伝子には、同じタンパク質をコードするが5' UTRが異なる2つの転写バリアントが見つかっている。^[6]

相互作用

CBX3はPIM1、^[7]、Ki-67、^{[8] 、}ラミンB受容体、^{[9] 、}CBX5 ^[10]、CBX1と相互作用することが示されている。^[10]

参照

ヘテロクロマチンタンパク質1

参考文献

^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000122565 – Ensembl、2017年5月
^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000029836 – Ensembl、2017年5月
^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
^ Ye Q, Worman HJ (1996年8月). 「核膜内膜のインテグラルタンパク質とショウジョウバエHP1に相同なヒトクロモドメインタンパク質との相互作用」. J Biol Chem . 271 (25): 14653–6 . doi : 10.1074/jbc.271.25.14653 . PMID 8663349.
^ ab "Entrez Gene: CBX3 クロモボックスホモログ 3 (HP1 ガンマホモログ、ショウジョウバエ)".
^ 小池暢、舞田秀、平剛、有賀秀、井口-有賀 SM (2000年2月). 「Pim-1キナーゼによるリン酸化標的としてのヘテロクロマチンタンパク質1（HP1）の同定と、リン酸化がHP1(1)の転写抑制機能に及ぼす影響」. FEBS Lett . 467 (1): 17– 21. doi : 10.1016/S0014-5793(00)01105-4 . ISSN 0014-5793. PMID 10664448. S2CID 29392124.
^ 亀高A、高木正敏、早川知宏、原口徳子、平岡康、米田佳弘 (2002年12月)。「Ki-67 抗原のクロマチン圧縮誘導ドメイン (LR ドメイン) と HP1 タンパク質の相互作用」。遺伝子細胞。7 (12): 1231–42 .土井: 10.1046/j.1365-2443.2002.00596.x。ISSN 1356-9597。PMID 12485163。S2CID 6802841 。
^ Ye Q, Worman HJ (1996年6月). 「核膜内膜のインテグラルタンパク質とショウジョウバエHP1に相同なヒトクロモドメインタンパク質との相互作用」. J. Biol. Chem . 271 (25): 14653–6 . doi : 10.1074/jbc.271.25.14653 . ISSN 0021-9258. PMID 8663349.
^ ab Nielsen AL、Oulad-Abdelghani M、Ortiz JA、Remboutsika E、Chambon P、Losson R (2001 年 4 月)。「哺乳類細胞におけるヘテロクロマチン形成: ヒストンと HP1 タンパク質間の相互作用」。モル。セル。7 (4): 729–39 .土井: 10.1016/S1097-2765(01)00218-0。hdl : 10261/308369。ISSN 1097-2765。PMID 11336697。

さらに読む

Ye Q, Callebaut I, Pezhman A, et al. (1997). 「ヒトHP1型クロモドメインタンパク質と内核膜タンパク質LBRのドメイン特異的相互作用」. J. Biol. Chem . 272 (23): 14983–9 . doi : 10.1074/jbc.272.23.14983 . PMID 9169472.
Lessard J, Baban S, Sauvageau G (1998). 「ヒト骨髄細胞におけるポリコームグループ遺伝子の段階特異的発現」Blood . 91 (4): 1216–24 . doi : 10.1182/blood.V91.4.1216 . PMID 9454751.
Seeler JS, Marchio A, Sitterlin D, et al. (1998). 「SP100とHP1タンパク質の相互作用：前骨髄球性白血病関連核小体とクロマチンコンパートメントとの関連」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 95 (13): 7316–21 . Bibcode :1998PNAS...95.7316S. doi : 10.1073/pnas.95.13.7316 . PMC 22602. PMID 9636146 .
Lehming N, Le Saux A, Schüller J, Ptashne M (1998). 「クロマチン構成要素は推定転写抑制複合体の一部である」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 95 (13): 7322–6 . Bibcode :1998PNAS...95.7322L. doi : 10.1073/pnas.95.13.7322 . PMC 22604. PMID 9636147 .
Ainsztein AM, Kandels-Lewis SE, Mackay AM, Earnshaw WC (1999). 「INCENPセントロメアおよびスピンドル標的化：必須保存モチーフの同定とヘテロクロマチンタンパク質HP1の関与」. J. Cell Biol . 143 (7): 1763–74 . doi :10.1083/jcb.143.7.1763. PMC 2175214. PMID 9864353 .
Ryan RF, Schultz DC, Ayyanathan K, et al. (1999). 「KAP-1コリプレッサータンパク質はヘテロクロマチンおよびユークロマチンHP1タンパク質と相互作用し共局在する：ヘテロクロマチンを介した遺伝子サイレンシングにおけるKrüppel関連ボックス-ジンクフィンガータンパク質の潜在的役割」Mol. Cell. Biol . 19 (6): 4366– 78. doi :10.1128/mcb.19.6.4366. PMC 104396. PMID 10330177 .
Minc E, Allory Y, Worman HJ, et al. (1999). 「哺乳類細胞における細胞周期中のHP1タンパク質の局在とリン酸化」Chromosoma . 108 (4): 220–34 . doi :10.1007/s004120050372. PMID 10460410. S2CID 12381860.
Nielsen AL, Ortiz JA, You J, et al. (2000). 「ヘテロクロマチンタンパク質1（HP1）ファミリーのメンバーとの相互作用およびヒストンの脱アセチル化は、TIF1ファミリーのメンバーによる転写サイレンシングに異なる形で関与している」EMBO J. 18 ( 22): 6385–95 . doi :10.1093/emboj/18.22.6385. PMC 1171701. PMID 10562550 .
小池暢、舞田秀、平剛志、他 (2000). 「Pim-1キナーゼによるリン酸化標的としてのヘテロクロマチンタンパク質1（HP1）の同定と、リン酸化がHP1(1)の転写抑制機能に及ぼす影響」. FEBS Lett . 467 (1): 17– 21. doi : 10.1016/S0014-5793(00)01105-4 . PMID 10664448. S2CID 29392124.
Minc E, Courvalin JC, Buendia B (2001). 「HP1gammaは哺乳類の核と染色体においてユークロマチンおよびヘテロクロマチンと会合する」Cytogenet. Cell Genet . 90 ( 3–4 ): 279–84 . doi :10.1159/000056789. PMID 11124534. S2CID 24349769.
Lachner M, O'Carroll D, Rea S, et al. (2001). 「ヒストンH3リジン9のメチル化はHP1タンパク質の結合部位を形成する」Nature 410 ( 6824): 116–20 . Bibcode :2001Natur.410..116L. doi :10.1038/35065132. PMID 11242053. S2CID 4331863.
Nielsen AL, Oulad-Abdelghani M, Ortiz JA, et al. (2001). 「哺乳類細胞におけるヘテロクロマチン形成：ヒストンとHP1タンパク質の相互作用」Mol. Cell . 7 (4): 729–39 . doi : 10.1016/S1097-2765(01)00218-0 . hdl : 10261/308369 . PMID 11336697.
Scholzen T, Endl E, Wohlenberg C, et al. (2002). 「Ki-67タンパク質はヘテロクロマチンタンパク質1（HP1）ファミリーのメンバーと相互作用する：高次クロマチン構造の制御における潜在的な役割」J. Pathol . 196 (2): 135–44 . doi :10.1002/path.1016. PMID 11793364. S2CID 36130549.
Vassallo MF, Tanese N (2002). 「HP1とヒトTAFII130のアイソフォーム特異的相互作用」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (9): 5919–24 . Bibcode :2002PNAS...99.5919V. doi : 10.1073/pnas.092025499 . PMC 122877. PMID 11959914 .
Ogawa H, Ishiguro K, Gaubatz S, et al. (2002). 「G0細胞においてE2FおよびMyc応答性遺伝子を占有するクロマチン修飾因子複合体」. Science . 296 (5570): 1132–6 . Bibcode :2002Sci...296.1132O. doi :10.1126/science.1069861. PMID: 12004135. S2CID : 34863978.
Hwang KK, Worman HJ (2002). 「ショウジョウバエヘテロクロマチンタンパク質1のヒトオーソログによる遺伝子制御」. Biochem. Biophys. Res. Commun . 293 (4): 1217–22 . Bibcode :2002BBRC..293.1217H. doi :10.1016/S0006-291X(02)00377-7. PMID 12054505.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
亀高明生、高木正治、早川剛志、他 (2003). 「Ki-67抗原のクロマチンコンパクション誘導ドメイン（LRドメイン）とHP1タンパク質の相互作用」. Genes Cells . 7 (12): 1231–42 . doi : 10.1046 /j.1365-2443.2002.00596.x . PMID 12485163. S2CID 6802841.
Cheutin T, McNairn AJ, Jenuwein T, et al. (2003). 「動的なHP1結合による安定ヘテロクロマチンドメインの維持」. Science . 299 (5607): 721–5 . Bibcode :2003Sci...299..721C. doi :10.1126/science.1078572. PMID: 12560555. S2CID : 32776616.

外部リンク

CBX3+タンパク質、+ヒト、米国国立医学図書館医学件名表（MeSH）
UCSC ゲノムブラウザのヒト CBX3 ゲノムの位置と CBX3 遺伝子の詳細ページ。

この記事には、パブリックドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000122565 – Ensembl、2017年5月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000029836 – Ensembl、2017年5月

[3] 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[4] 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[pmid8663349-5] Ye Q, Worman HJ (1996年8月). 「核膜内膜のインテグラルタンパク質とショウジョウバエHP1に相同なヒトクロモドメインタンパク質との相互作用」. J Biol Chem . 271 (25): 14653–6 . doi : 10.1074/jbc.271.25.14653 . PMID 8663349.

[entrez-6] "Entrez Gene: CBX3 クロモボックスホモログ 3 (HP1 ガンマホモログ、ショウジョウバエ)".

[pmid10664448-7] 小池暢、舞田秀、平剛、有賀秀、井口-有賀 SM (2000年2月). 「Pim-1キナーゼによるリン酸化標的としてのヘテロクロマチンタンパク質1（HP1）の同定と、リン酸化がHP1(1)の転写抑制機能に及ぼす影響」. FEBS Lett . 467 (1): 17– 21. doi : 10.1016/S0014-5793(00)01105-4 . ISSN 0014-5793. PMID 10664448. S2CID 29392124.

[pmid12485163-8] 亀高A、高木正敏、早川知宏、原口徳子、平岡康、米田佳弘 (2002年12月)。「Ki-67 抗原のクロマチン圧縮誘導ドメイン (LR ドメイン) と HP1 タンパク質の相互作用」。遺伝子細胞。7 (12): 1231–42 .土井: 10.1046/j.1365-2443.2002.00596.x。ISSN 1356-9597。PMID 12485163。S2CID 6802841 。

[autogenerated1-9] Ye Q, Worman HJ (1996年6月). 「核膜内膜のインテグラルタンパク質とショウジョウバエHP1に相同なヒトクロモドメインタンパク質との相互作用」. J. Biol. Chem . 271 (25): 14653–6 . doi : 10.1074/jbc.271.25.14653 . ISSN 0021-9258. PMID 8663349.

[pmid11336697-10] Nielsen AL、Oulad-Abdelghani M、Ortiz JA、Remboutsika E、Chambon P、Losson R (2001 年 4 月)。「哺乳類細胞におけるヘテロクロマチン形成: ヒストンと HP1 タンパク質間の相互作用」。モル。セル。7 (4): 729–39 .土井: 10.1016/S1097-2765(01)00218-0。hdl : 10261/308369。ISSN 1097-2765。PMID 11336697。