HOXA5

HOXA5
識別子
エイリアス	HOXA5、HOX1、HOX1.3、HOX1C、ホメオボックスA5
外部ID	オミム: 142952; MGI : 96177;ホモロジーン: 40726;ジーンカード：HOXA5; OMA :HOXA5 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
キリスト	7番染色体（ヒト）
終わり	27,143,681 bp
遺伝子の位置（マウス）
キリスト	6番染色体（マウス）
終わり	52,181,567 bp
RNA発現パターン
	上位の表現
	精巣上体頭; ; 精巣上体; ; 腎髄質; ; 左卵管; ; 副腎皮質; ; 右副腎皮質; ; 左副腎皮質; ; 横行結腸粘膜; ; 回腸粘膜; ; 右卵管;
	上位の表現
	軸骨格; ; 人間の脊柱; ; 頸椎; ; 胸椎; ; 輸出管; ; 左肺葉; ; 移動性腸管神経堤細胞; ; リブ; ; 右肺葉; ; 胚の尾;
	より多くの参照表現データ
	より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー
分子機能	DNA結合; 配列特異的DNA結合; DNA結合転写因子活性; DNA結合転写活性化因子活性、RNAポリメラーゼII特異的; RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合; タンパク質結合; DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的; 転写因子活性、RNAポリメラーゼII遠位エンハンサー配列特異的結合;
細胞成分	核;
生物学的プロセス	胚骨格系の形態形成; パターン仕様プロセス; 骨格系の発達; 呼吸器系のプロセス; 転写の制御、DNAテンプレート; 多細胞生物の成長; 肺の発達; 気管の形態形成; 細気管支の発達; 乳腺の発達に関与する細胞間シグナル伝達; 乳腺上皮細胞の増殖の調節; 乳腺胞の発達; 肺杯細胞の分化; 転写、DNAテンプレート; 乳腺上皮細胞の分化; 赤血球分化の負の調節; 呼吸器系による呼吸ガス交換; 気管軟骨の形態形成; 胎児骨格系の発達; 上皮の形態形成; 多細胞生物の発達; 甲状腺の発達; 小葉気管支上皮の発達; 間葉系上皮細胞シグナル伝達; アポトーシス過程の正の調節; 腸管上皮細胞の成熟; 血管新生の負の調節; 軟骨の形態形成; 肺胞の発達; 肺関連間葉の発達; 肺の形態形成に関与する上皮管の分岐; 細胞の移動; 骨髄細胞分化の正の調節; 前後パターンの指定; RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御; RNAポリメラーゼIIによる転写;
	出典：Amigo / QuickGO
オーソログ
	3202
	15402
	ENSG00000106004
	ENSMUSG00000038253
	P20719
	P09021
	NM_019102
	NM_010453
	NP_061975
	NP_034583
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

ホメオボックスタンパク質Hox-A5は、ヒトではHOXA5遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]^[6]^[7]

関数

脊椎動物では、ホメオボックス遺伝子と呼ばれる転写因子群をコードする遺伝子は、4本の別々の染色体上のA、B、C、Dというクラスターに存在します。これらのタンパク質の発現は、胚発生中に空間的および時間的に制御されています。この遺伝子は7番染色体上のAクラスターの一部であり、遺伝子発現、形態形成、および分化を制御する可能性のあるDNA結合転写因子をコードしています。この遺伝子のメチル化は発現の喪失につながる可能性があり、コードされているタンパク質は腫瘍抑制因子p53の発現をアップレギュレーションするため、腫瘍形成において重要な役割を果たす可能性があります。^[7]

HoxA5は、少なくとも部分的にはDNAメチル化によって制御されている。^{[8] HoxA5は、}PTENのダウンレギュレーションによって腫瘍抑制因子p53とAKT1をアップレギュレーションすることが示されている。^{[9] HoxA5の抑制は}血管腫の成長を減弱させることが示されている。^[10] HoxA5は遺伝子発現に広範囲に影響を及ぼし、乳がん細胞株で誘導されると約300個の遺伝子がアップレギュレーションされる。^{[11] HoxA5タンパク質伝達ドメインの過剰発現は、}TNFα誘導性単球の HUVECへの結合を阻害することによって示される炎症を防ぐ。^[12]^[13]

HoxA5プロモーターのメチル化プロファイルを、最も分化度の低い細胞（ヒト胚性幹細胞）から最も内皮細胞に類似した細胞（ヒト臍帯静脈内皮細胞、HUVEC）まで比較すると、HoxA5プロモーターは非分化細胞では通常高度にメチル化されており、細胞が内皮細胞系譜に分化するにつれて脱メチル化されることが示された。^{[14] HoxA5のプロモーターには}C-Amp応答エレメント（CRE）が含まれている。^{[8] HUVECの}CpG密度の高いHoxA5プロモーターには POL2とCTCFの結合が豊富に存在し、転写活性を示している。^[14]

臨床的意義

急性骨髄性白血病（AML）ではHoxA5が抑制されており、DNMT阻害剤であるデシタビン（5Aza）がこの疾患の治療に用いられています。AMLではHoxA5が高メチル化していることが知られていますが、デシタビンがこれらの遺伝子を直接標的として脱メチル化するかどうかはまだ示されていません。^[15]^[16] HOXA5は、膠芽腫のがん遺伝子としてもノミネートされています。^[17]

参照

ホメオボックス

参考文献

^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000106004 – Ensembl、2017年5月
^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000038253 – Ensembl、2017年5月
^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
^ McAlpine PJ, Shows TB (1990年7月). 「ヒトホメオボックス遺伝子の命名法」. Genomics . 7 (3): 460. doi :10.1016/0888-7543(90)90186-X. PMID 1973146.
^ Scott MP (1992年11月). 「脊椎動物ホメオボックス遺伝子命名法」. Cell . 71 (4): 551–3 . doi :10.1016/0092-8674(92)90588-4. PMID 1358459. S2CID 13370372.
^ ab "Entrez Gene: HOXA5 ホメオボックス A5".
^ ab Dunn J, Thabet S, Jo H (2015年7月). 「血流依存性エピジェネティックDNAメチル化と内皮細胞遺伝子発現および動脈硬化」.動脈硬化・血栓症・血管生物学. 35 (7): 1562–9 . doi :10.1161/ATVBAHA.115.305042. PMC 4754957. PMID 25953647 .
^ Arderiu G, Cuevas I, Chen A, Carrio M, East L, Boudreau NJ (2007). 「HoxA5はAkt1の増加を介して接着結合を安定化させる」. Cell Adhesion & Migration . 1 (4): 185–95 . doi :10.4161/cam.1.4.5448. PMC 2634105. PMID 19262140 .
^ Zhu Y, Cuevas IC, Gabriel RA, Su H, Nishimura S, Gao P, Fields A, Hao Q, Young WL, Yang GY, Boudreau NJ (2009年6月). 「転写因子HoxA5の発現回復は脳内の実験的血管腫の増殖を阻害する」Journal of Neuropathology and Experimental Neurology . 68 (6): 626–32 . doi :10.1097/NEN.0b013e3181a491ce. PMC 2728585. PMID 19458547 .
^ Chen H, Rubin E, Zhang H, Chung S, Jie CC, Garrett E, Biswal S, Sukumar S (2005年5月). 「HOXA5の転写標的の同定」. The Journal of Biological Chemistry . 280 (19): 19373–80 . doi : 10.1074/jbc.M413528200 . PMID 15757903.
^ Lee JY, Park KS, Cho EJ, Joo HK, Lee SK, Lee SD, Park JB, Chang SJ, Jeon BH (2011年7月). 「ヒトHOXA5ホメオドメインによるタンパク質伝達の促進と血管炎症への応用」.生化学および生物物理学的研究通信. 410 (2): 312–6 . Bibcode :2011BBRC..410..312L. doi :10.1016/j.bbrc.2011.05.139. PMID 21664342.
^ Chen Y, Gorski DH (2008年2月). 「抗血管新生ホメオボックス遺伝子GAXおよびHOXA5をダウンレギュレーションするマイクロRNA（miR-130a）による血管新生制御」Blood . 111 (3): 1217–26 . doi :10.1182/blood-2007-07-104133. PMC 2214763. PMID 17957028 .
^ ab Dunn J, Simmons R, Thabet S, Jo H (2015年10月). 「内皮細胞のせん断応力応答とアテローム性動脈硬化におけるエピジェネティクスの役割」.国際生化学・細胞生物学誌. 67 : 167–76 . doi :10.1016/j.biocel.2015.05.001. PMC 4592147. PMID 25979369 .
^ Strathdee G, Sim A, Soutar R, Holyoake TL, Brown R (2007年2月). 「HOXA5は正常細胞および急性骨髄性白血病の発症過程において、細胞型特異的なCpGアイランドメチル化の標的となる」. Carcinogenesis . 28 (2): 299– 309. doi : 10.1093/carcin/bgl133 . PMID 16861263.
^ Kim SY, Hwang SH, Song EJ, Shin HJ, Jung JS, Lee EY (2010年10月). 「急性骨髄性白血病におけるHOXA5の高メチル化レベルは短期転帰と関連している」. The Korean Journal of Laboratory Medicine . 30 (5): 469–73 . doi : 10.3343/kjlm.2010.30.5.469 . PMID 20890077.
^ Cimino PJ, Kim Y, Wu HJ, Alexander J, Wirsching HG, Szulzewsky F, Pitter K, Ozawa T, Wang J, Vazquez J, Arora S, Rabadan R, Levine R, Michor F, Holland EC (2018). 「IDH野生型膠芽腫における7番染色体全体の獲得に対する選択的優位性はHOXA5発現の増加によってもたらされる」. Genes & Development . 32 ( 7–8 ): 512– 523. doi : 10.1101/gad.312157.118 . PMC 5959235. PMID 29632085 .

外部リンク

HOXA5+タンパク質、+ヒト（米国国立医学図書館医学件名表題集（MeSH））

この記事には、パブリックドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。

ヒト7番染色体上の遺伝子に関するこの記事はスタブです。この記事を拡張することで、Wikipedia に貢献できます。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000106004 – Ensembl、2017年5月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000038253 – Ensembl、2017年5月

[3] 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[4] 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[pmid1973146-5] McAlpine PJ, Shows TB (1990年7月). 「ヒトホメオボックス遺伝子の命名法」. Genomics . 7 (3): 460. doi :10.1016/0888-7543(90)90186-X. PMID 1973146.

[pmid1358459-6] Scott MP (1992年11月). 「脊椎動物ホメオボックス遺伝子命名法」. Cell . 71 (4): 551–3 . doi :10.1016/0092-8674(92)90588-4. PMID 1358459. S2CID 13370372.

[entrez-7] "Entrez Gene: HOXA5 ホメオボックス A5".

[ReferenceA-8] Dunn J, Thabet S, Jo H (2015年7月). 「血流依存性エピジェネティックDNAメチル化と内皮細胞遺伝子発現および動脈硬化」.動脈硬化・血栓症・血管生物学. 35 (7): 1562–9 . doi :10.1161/ATVBAHA.115.305042. PMC 4754957. PMID 25953647 .

[9] Arderiu G, Cuevas I, Chen A, Carrio M, East L, Boudreau NJ (2007). 「HoxA5はAkt1の増加を介して接着結合を安定化させる」. Cell Adhesion & Migration . 1 (4): 185–95 . doi :10.4161/cam.1.4.5448. PMC 2634105. PMID 19262140 .

[10] Zhu Y, Cuevas IC, Gabriel RA, Su H, Nishimura S, Gao P, Fields A, Hao Q, Young WL, Yang GY, Boudreau NJ (2009年6月). 「転写因子HoxA5の発現回復は脳内の実験的血管腫の増殖を阻害する」Journal of Neuropathology and Experimental Neurology . 68 (6): 626–32 . doi :10.1097/NEN.0b013e3181a491ce. PMC 2728585. PMID 19458547 .

[11] Chen H, Rubin E, Zhang H, Chung S, Jie CC, Garrett E, Biswal S, Sukumar S (2005年5月). 「HOXA5の転写標的の同定」. The Journal of Biological Chemistry . 280 (19): 19373–80 . doi : 10.1074/jbc.M413528200 . PMID 15757903.

[12] Lee JY, Park KS, Cho EJ, Joo HK, Lee SK, Lee SD, Park JB, Chang SJ, Jeon BH (2011年7月). 「ヒトHOXA5ホメオドメインによるタンパク質伝達の促進と血管炎症への応用」.生化学および生物物理学的研究通信. 410 (2): 312–6 . Bibcode :2011BBRC..410..312L. doi :10.1016/j.bbrc.2011.05.139. PMID 21664342.

[13] Chen Y, Gorski DH (2008年2月). 「抗血管新生ホメオボックス遺伝子GAXおよびHOXA5をダウンレギュレーションするマイクロRNA（miR-130a）による血管新生制御」Blood . 111 (3): 1217–26 . doi :10.1182/blood-2007-07-104133. PMC 2214763. PMID 17957028 .

[Dunn_2015-14] Dunn J, Simmons R, Thabet S, Jo H (2015年10月). 「内皮細胞のせん断応力応答とアテローム性動脈硬化におけるエピジェネティクスの役割」.国際生化学・細胞生物学誌. 67 : 167–76 . doi :10.1016/j.biocel.2015.05.001. PMC 4592147. PMID 25979369 .

[15] Strathdee G, Sim A, Soutar R, Holyoake TL, Brown R (2007年2月). 「HOXA5は正常細胞および急性骨髄性白血病の発症過程において、細胞型特異的なCpGアイランドメチル化の標的となる」. Carcinogenesis . 28 (2): 299– 309. doi : 10.1093/carcin/bgl133 . PMID 16861263.

[16] Kim SY, Hwang SH, Song EJ, Shin HJ, Jung JS, Lee EY (2010年10月). 「急性骨髄性白血病におけるHOXA5の高メチル化レベルは短期転帰と関連している」. The Korean Journal of Laboratory Medicine . 30 (5): 469–73 . doi : 10.3343/kjlm.2010.30.5.469 . PMID 20890077.

[17] Cimino PJ, Kim Y, Wu HJ, Alexander J, Wirsching HG, Szulzewsky F, Pitter K, Ozawa T, Wang J, Vazquez J, Arora S, Rabadan R, Levine R, Michor F, Holland EC (2018). 「IDH野生型膠芽腫における7番染色体全体の獲得に対する選択的優位性はHOXA5発現の増加によってもたらされる」. Genes & Development . 32 ( 7–8 ): 512– 523. doi : 10.1101/gad.312157.118 . PMC 5959235. PMID 29632085 .