TCF4

ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子

TCF4
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2KWF
識別子
エイリアス	TCF4、E2-2、ITF-2、ITF2、PTHS、SEF-2、SEF2、SEF2-1、SEF2-1A、SEF2-1B、SEF2-1D、TCF-4、bHLHb19、FECD3、転写因子4、CDG2T
外部ID	オミム：602272; MGI : 98506;ホモロジーン: 2407;ジーンカード：TCF4; OMA :TCF4 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 18番染色体（ヒト）[1] バンド 18q21.2 始める 55,222,185 bp [1] 終わり 55,664,787 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 18番染色体（マウス）[2] バンド 18|18 E2 始める 69,343,356 bp [2] 終わり 69,689,079 bp [2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 内皮細胞 ヒップの皮膚 心膜 嗅内皮質 頭頂葉 アキレス腱 中心後回 ブロードマン野23 滑膜関節 神経節隆起 上位の表現 吻側回遊流 神経節隆起 内側神経節隆起 鉤状部 心室帯 バレル皮質 小脳葉 真皮 内頸動脈 海馬本体 より多くの参照表現データ バイオGPS 該当なし
遺伝子オントロジー 分子機能 タンパク質二量体化活性 タンパク質ホモ二量体化活性 DNA結合転写因子活性 DNA結合転写活性化因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 bHLH転写因子結合 Eボックスバインディング タンパク質C末端結合 タンパク質結合 同一のタンパク質結合 TFIIBクラス転写因子結合 タンパク質ヘテロ二量体形成活性 DNA結合 RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合 DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 細胞成分 転写調節因子複合体 核 β-カテニン-TCF複合体 β-カテニン-TCF7L2複合体 生物学的プロセス 細胞分化 転写の制御、DNAテンプレート タンパク質-DNA複合体の組み立て 転写、DNAテンプレート 神経系の発達 転写の正の制御、DNAテンプレート DNAテンプレート転写、開始 RNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写開始 RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 ニューロン分化の正の調節 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 6925 21413 アンサンブル ENSG00000196628 ENSMUSG00000053477 ユニプロット P15884 Q60722 RefSeq (mRNA) NM_001083962 NM_001243226 NM_001243227 NM_001243228 NM_001243230 NM_001243231 NM_001243232 NM_001243233 NM_001243234 NM_001243235 NM_001243236 NM_001306207 NM_001306208 NM_003199 NM_001330604 NM_001330605 NM_001348211 NM_001348212 NM_001348213 NM_001348214 NM_001348215 NM_001348216 NM_001348217 NM_001348218 NM_001348219 NM_001348220 NM_001369572 NM_001369573 NM_001369574 NM_001369575 NM_001369576 NM_001369577 NM_001369578 NM_001369579 NM_001369580 NM_001369581 NM_001369582 NM_001369583 NM_001369584 NM_001369585 NM_001369586 NM_001369567 NM_001369568 NM_001369569 NM_001369570 NM_001369571 NM_001083967 NM_013685 NM_001361126 NM_001361127 NM_001361128 NM_001361129 RefSeq（タンパク質） NP_001077431 NP_001230155 NP_001230156 NP_001230157 NP_001230159 NP_001230160 NP_001230161 NP_001230162 NP_001230163 NP_001230164 NP_001230165 NP_001293136 NP_001293137 NP_001317533 NP_001317534 NP_003190 NP_001335140 NP_001335141 NP_001335142 NP_001335143 NP_001335144 NP_001335145 NP_001335146 NP_001335147 NP_001335148 NP_001335149 NP_001356501 NP_001356502 NP_001356503 NP_001356504 NP_001356505 NP_001356506 NP_001356507 NP_001356508 NP_001356509 NP_001356510 NP_001356511 NP_001356512 NP_001356513 NP_001356514 NP_001356515 NP_001356496 NP_001356497 NP_001356498 NP_001356499 NP_001356500 NP_001077436 NP_038713 NP_001348055 NP_001348056 NP_001348057 NP_001348058 場所（UCSC） 18章: 55.22 – 55.66 MB 18章: 69.34 – 69.69 Mb PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
人間の表示/編集 マウスの表示/編集

転写因子4 （TCF-4）は免疫グロブリン転写因子2 （ITF-2）としても知られ、ヒトでは染色体18q21.2に位置するTCF4遺伝子によってコードされるタンパク質です。^[5]

関数

TCF4タンパク質は転写因子として機能し、免疫グロブリンエンハンサーμ-E5/κ-E2モチーフに結合します。TCF4は、通常SSTR2 -INR、すなわちソマトスタチン受容体2イニシエーターエレメントに存在するEボックス（5'-CANNTG-3'）に結合して転写を活性化します。TCF4は、DNAに結合して神経分化を開始することにより、妊娠中の胎児の神経発達に主に関与しています。発達初期には中枢神経系、体節、生殖隆起に存在します。発達後期には甲状腺、胸腺、腎臓に存在し、成人期にはリンパ球、筋肉、成熟ニューロン、消化器系に存在します。^{[6] [7] [8]}

臨床的意義

TCF4の変異はピット・ホプキンス症候群（PTHS）を引き起こします。これらの変異により、TCF4タンパク質はDNAに適切に結合できなくなり、神経系の分化を制御できなくなります。TCF4の機能喪失はWntシグナル伝達の低下を招き、結果として神経前駆細胞の増殖が減少することが示唆されています。^[9]研究された症例のほとんどにおいて、これらの変異はde novoであり、患者の他の家族には見られない新しい変異でした。ピット・ホプキンス症候群の一般的な症状には、口が広い、胃腸障害、微細運動能力の発達遅延、言語および呼吸障害、てんかん、その他の脳障害などがあります。^{[10] [11]}

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000196628 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000053477 – Ensembl、2017年5月
3. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Henthorn P, McCarrick-Walmsley R, Kadesch T (1990年2月). 「正に作用する転写因子ITF-2をコードするcDNAの配列」. Nucleic Acids Research . 18 (3): 678. doi :10.1093/nar/18.3.678. PMC 333500. PMID 2308860  . 
6. de Pontual L, Mathieu Y, Golzio C, Rio M, Malan V, Boddaert N, et al. (2009年4月). 「ピット・ホプキンス症候群におけるTCF4遺伝子の変異、機能、および発現に関する研究」. Human Mutation . 30 (4): 669– 676. doi : 10.1002/humu.20935 . PMID  19235238. S2CID  25375730.
7. Pscherer A, Dörflinger U, Kirfel J, Gawlas K, Rüschoff J, Buettner R, Schüle R (1996年12月). 「ヘリックス・ループ・ヘリックス転写因子SEF-2は、ヒトソマトスタチン受容体II遺伝子のプロモーターにおける新規イニシエーターエレメントの活性を制御する」. The EMBO Journal . 15 (23): 6680– 6690. doi :10.1002/j.1460-2075.1996.tb01058.x. PMC 452492. PMID 8978694  . 
8. D'Rozario M, Zhang T, Waddell EA, Zhang Y, Sahin C, Sharoni M, et al. (2016年4月). 「I型bHLHタンパク質DaughterlessとTcf4は、分裂後ニューロンにおけるニューレキシンを抑制することで神経突起の分岐とシナプス形成を制限する」. Cell Reports . 15 (2): 386– 397. doi : 10.1016/j.celrep.2016.03.034. PMC 4946342. PMID  27050508. 
9. Papes F, Camargo AP, de Souza JS, Carvalho VM, Szeto RA, LaMontagne E, et al. (2022年5月). 「転写因子4の機能喪失は、前駆細胞の増殖および皮質ニューロン含量の減少と関連する」. Nature Communications . 13 (1) 2387. Bibcode :2022NatCo..13.2387P. doi :10.1038/s41467-022-29942-w. PMC 9061776. PMID  35501322 . 
10. Amiel J, Rio M, de Pontual L, Redon R, Malan V, Boddaert N, et al. (2007年5月). 「クラスI塩基性ヘリックス・ループ・ヘリックス転写因子をコードするTCF4の変異は、自律神経機能不全を伴う重篤なてんかん性脳症であるピット・ホプキンス症候群の原因である」. American Journal of Human Genetics . 80 (5): 988– 993. doi :10.1086/515582. PMC 1852736. PMID 17436254  . 
11. Zweier C, Peippo MM, Hoyer J, Sousa S, Bottani A, Clayton-Smith J, 他 (2007年5月). 「TCF4のハプロ不全は間欠性過換気を伴う症候群性精神遅滞（ピット・ホプキンス症候群）を引き起こす」. American Journal of Human Genetics . 80 (5): 994– 1001. doi :10.1086/515583. PMC 1852727. PMID  17436255 . 

さらに読む

• Herbst A, Helferich S, Behrens A, Göke B, Kolligs FT (2009年10月). 「転写因子ITF-2Aはp21(Cip1)を介して細胞周期停止を誘導する」.生化学および生物理学的研究通信. 387 (4): 736– 740. doi :10.1016/j.bbrc.2009.07.102. PMID  19635457.
• Cisse B, Caton ML, Lehner M, Maeda T, Scheu S, Locksley R, et al. (2008年10月). 「転写因子E2-2は形質細胞様樹状細胞の発達に必須かつ特異的な制御因子である」. Cell . 135 (1): 37– 48. doi :10.1016/j.cell.2008.09.016. PMC 2631034.  PMID 18854153  .
• Bain G, Murre C (1998年4月). 「Bリンパ球およびTリンパ球の発達におけるEタンパク質の役割」. Seminars in Immunology . 10 (2): 143–153 . doi :10.1006/smim.1998.0116. PMID  9618760.
• Yerges LM, Klei L, Cauley JA, Roeder K, Kammerer CM, Moffett SP, 他 (2009年12月). 「高齢男性における大腿骨頸部および腰椎の体積骨密度に関連する383個の候補遺伝子の高密度関連研究」. Journal of Bone and Mineral Research . 24 (12): 2039– 2049. doi :10.1359/jbmr.090524. PMC  2791518. PMID  19453261 .
• Purcell SM, Wray NR, Stone JL, Visscher PM, O'Donovan MC, Sullivan PF, Sklar P (2009年8月). 「共通ポリジェニック変異は統合失調症および双極性障害のリスクに寄与する」. Nature . 460 (7256): 748– 752. Bibcode :2009Natur.460..748P. doi :10.1038/nature08185. PMC  3912837. PMID  19571811 .
• Kalscheuer VM, Feenstra I, Van Ravenswaaij-Arts CM, Smeets DF, Menzel C, Ullmann R, 他 (2008年8月). 「精神遅滞を伴うが古典的ピット・ホプキンス症候群を呈さない女児におけるTCF4遺伝子の破壊」. American Journal of Medical Genetics. Part A. 146A ( 16): 2053– 2059. doi :10.1002/ajmg.a.32419. PMID  18627065. S2CID  205309738.
• Herbst A, Bommer GT, Kriegl L, Jung A, Behrens A, Csanadi E, et al. (2009年8月). 「ITF-2は染色体18q21のアレル欠失により阻害され、腺腫-癌移行期にはITF-2Bの発現が消失する」. Gastroenterology . 137 (2): 639–48 , 648.e1-9. doi :10.1053/j.gastro.2009.04.049. PMID  19394332.
• Nagasawa M, Schmidlin H, Hazekamp MG, Schotte R, Blom B (2008年9月). 「ヒト形質細胞様樹状細胞の発達は、塩基性ヘリックス・ループ・ヘリックス因子E2-2とEts因子Spi-Bの複合作用に依存する」. European Journal of Immunology . 38 (9): 2389– 2400. doi :10.1002/eji.200838470. PMID  18792017. S2CID  205784742.
• Rosenfeld JA, Leppig K, Ballif BC, Thiese H, Erdie-Lalena C, Bawle E, 他 (2009年11月). 「ピット・ホプキンス症候群を引き起こすTCF4遺伝子変異の遺伝子型・表現型解析により、ミスセンス変異に伴う発作活動の増加が示された」. Genetics in Medicine . 11 (11): 797– 805. doi : 10.1097/GIM.0b013e3181bd38a9 . PMID  19938247.
• Stefansson H, Ophoff RA, Steinberg S, Andreassen OA, Cichon S, Rujescu D, et al. (2009年8月). 「統合失調症のリスクを高める共通変異」. Nature . 460 (7256): 744– 747. Bibcode :2009Natur.460..744S. doi :10.1038/nature08186. PMC  3077530. PMID  19571808 .

外部リンク

• TCF4+タンパク質、+ヒト（米国国立医学図書館医学件名表題集（MeSH））
• ファクターブックTCF4

この記事には、パブリック ドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。

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