ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
MAFB 利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2WT7、2WTY、4AUW
識別子 エイリアス MAFB 、KRML、MCTO、MAF bZIP転写因子B、DURS3 外部ID オミム :608968; MGI : 104555; ホモロジーン : 31315; ジーンカード :MAFB; OMA :MAFB - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) キリスト 染色体2(マウス) [2] バンド 2 H2|2 80.92 cM 始める 1億6020万5623 塩基対 [2] 終わり 1億6020万8985 塩基対 [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) 上位の表現 糸球体 ヒップの皮膚 歯茎 後腎糸球体 歯肉上皮 滑膜 人間のペニス 滑膜関節 乳首 腕の皮膚
上位の表現 大臼歯 骨髄間質 側頭筋 糸球体 胸鎖乳突筋 リップ 外耳の皮膚 二腹筋 肝臓の左葉 太ももの筋肉
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遺伝子オントロジー 分子機能 DNA結合 DNA結合転写因子活性 DNA結合転写活性化因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 転写因子結合 RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合 タンパク質結合 タンパク質ホモ二量体化活性 タンパク質ヘテロ二量体形成活性 配列特異的な二本鎖DNA結合 DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 配列特異的DNA結合 細胞成分 生物学的プロセス 胸腺におけるT細胞の分化 破骨細胞分化の負の制御 脳のセグメンテーション 胸腺の発達 RNAポリメラーゼIIによる転写 呼吸器系による呼吸ガス交換 セグメント仕様 赤血球分化の負の調節 神経系の発達 転写、DNAテンプレート ロンボメア6の発達 ロンボメア5の開発 内耳の形態形成 感覚器官の発達 RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 転写の制御、DNAテンプレート 外転神経形成 RNAポリメラーゼIIによる転写の調節 出典:Amigo / QuickGO
ウィキデータ
転写因子MafB( V-maf筋腱膜線維肉腫癌遺伝子ホモログB とも呼ばれる)は 、ヒトでは MAFB 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。この遺伝子は 染色体20番染色体長腕 11.2-13.1にマッピングされ、単一のエクソンから構成され、約3 kbの範囲に及ぶ。 [5] [6]
関数 MafBは、系統特異的な造血の 制御において重要な役割を果たす、 塩基性ロイシンジッパー( bZIP ) 転写因子です。コードされている核タンパク質は、 骨髄細胞における ETS1 を介した赤血球特異的遺伝子の転写を 抑制します 。 [6]
臨床的意義 マウスMafb遺伝子の変異は、後脳の分節異常と、頭を振ったり、ぐるぐる回ったりするなどの活動亢進行動を示す変異マウスKreisler(kr)の原因です。 [7] このマウスは出生時に腎不全で死亡しますが、Mafb -/- マウスは中枢性無呼吸で死亡します。 [8]
最近、 MAFB付近の 一塩基多型(SNP)が非症候性の 口唇裂および口蓋裂 と関連することがわかった 。 [9] GENEVA口唇裂コンソーシアム研究は、欧州、米国、中国、台湾、シンガポール、韓国、フィリピンの1,908の症例親トリオを対象としたゲノム関連研究で、MAFBが口唇裂および/または口蓋裂と関連しており、欧州集団よりもアジア集団で ゲノムワイドな意義 が強いことが初めて確認された。集団の違いは、利用可能なマーカーによる範囲の変動または真の対立遺伝子異質性を反映している可能性がある。 [10]マウスモデルでは、Mafb mRNAおよびタンパク質が胎生13.5日から14.5日の間に頭蓋顔面外 胚葉 および神経堤由来中胚葉の両方で検出された 。発現は口蓋棚周囲の上皮および口蓋癒合中の内側縁上皮で強く発現した。融合後、Mafbの発現は間葉系組織と比較して口腔上皮で強くなった。 [9] さらに、シークエンシング解析により、フィリピン人集団において新たな ミスセンス変異 H131Qが検出され、この変異は対照群と比較して症例群で有意に多く認められた。 [9] MAFB遺伝子の両側の遺伝子が乏しい領域には、口蓋の発達に関与することが知られている転写因子の結合部位が多数含まれている。 [11]
参考文献 ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000204103 – Ensembl 、2017年5月 ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000074622 – Ensembl 、2017年5月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ Wang PW, Eisenbart JD, Cordes SP, Barsh GS, Stoffel M, Le Beau MM (1999年8月). 「ヒトKRML(MAFB):cDNAクローニング、ゲノム構造、および骨髄性白血病における腫瘍抑制遺伝子候補としての評価」. Genomics . 59 (3): 275–81 . doi :10.1006/geno.1999.5884. PMID 10444328. ^ ab "Entrez Gene: MAFB v-maf 筋腱膜線維肉腫癌遺伝子ホモログ B (鳥類)". ^ Cordes SP, Barsh GS (1994年12月). 「マウス分節遺伝子krは新規な基本ドメイン-ロイシンジッパー転写因子をコードする」. Cell . 79 (6): 1025–34 . doi :10.1016/0092-8674(94)90033-7. PMID 8001130. S2CID 19938958. ^ Artner I, Blanchi B, Raum JC, Guo M, Kaneko T, Cordes S, Sieweke M, Stein R (2007年3月). 「MafBは膵島β細胞の成熟に必須である」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 104 (10): 3853–8 . Bibcode :2007PNAS..104.3853A. doi : 10.1073/pnas.0700013104 . PMC 1803762. PMID 17360442 . ^ abc ビーティ TH、マレー JC、マラジータ ML、マンガー RG、ルジンスキー I、ヘットマンスキー JB、リャン KY、ウー T、マレー T、ファリン MD、レデット RA、レイモンド G、シュヴェンダー H、ジン SC、クーパー ME、ダンワルド M、マンシラ MA、レスリー E、ブラード S、リドラル AC、モレノ LM、メネゼス R、ヴィエイラ AR、ペトリン A、ウィルコックス AJ、ライ RT、ジャブ EW、ウーチョウ YH、チェン PK、ワン H、イェ X、ファン S、ヨー V、チョン SS、ジー SH、シー B、クリステンセン K、メルビー M、ドヒニー KF、ピュー EW、リン H、カスティージャ EE、チェイゼル AE、マ L、フィールド LL、ブロディ L、パンギリナン F、ミルズJL、モロイAM、Kirke PN、Scott JM、Scott JM、Arcos-Burgos M、Scott AF (2010年6月). 「口唇裂(口蓋裂を伴う場合と伴わない場合)のゲノムワイド関連解析により、MAFBおよびABCA4近傍のリスクバリアントが同定された」 Nature Genetics . 42 (6): 525–9 . doi :10.1038/ng.580. PMC 2941216. PMID 20436469 . ^ Dixon MJ, Marazita ML, Beaty TH, Murray JC. 2011. 口唇裂・口蓋裂:遺伝的および環境的影響の理解. Nature Reviews Genetics . 12: 167-178 ^ Dixon MJ, Marazita ML, Beaty TH, Murray JC. 2011. 口唇裂・口蓋裂:遺伝的および環境的影響の理解. Nature Reviews Genetics . 12: 167-178
さらに読む Cordes SP, Barsh GS (1994年12月). 「マウス分節遺伝子krは新規な基本ドメイン-ロイシンジッパー転写因子をコードする」. Cell . 79 (6): 1025–34 . doi :10.1016/0092-8674(94)90033-7. PMID 8001130. S2CID 19938958. Sieweke MH, Tekotte H, Frampton J, Graf T (1996年4月). 「MafBはEts-1の相互作用パートナーであり、赤血球分化を阻害するリプレッサーである」. Cell . 85 (1): 49– 60. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81081-8 . PMID 8620536. S2CID 14498161. Stoffel M, Le Beau MM, Espinosa R, Bohlander SF, Le Paslier D, Cohen D, Xiang KS, Cox NJ, Fajans SS, Bell GI (1996年4月). 「糖尿病感受性遺伝子MODY1および骨髄性白血病関連遺伝子を含む20番染色体領域の酵母人工染色体に基づく地図」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 93 (9): 3937–41 . Bibcode :1996PNAS...93.3937S. doi : 10.1073/pnas.93.9.3937 . PMC 39463. PMID 8632993 . Li R, Pei H, Watson DK, Papas TS (2000年2月). 「EAP1/DaxxはETS1と相互作用し、ETS1標的遺伝子の転写活性化を抑制する」. Oncogene . 19 (6): 745–53 . doi :10.1038/sj.onc.1203385. PMID 10698492. S2CID 22299529. 山田 憲治、富田 秀、吉浦 健、近藤 誠、和久井 健、福島 雄一、池川 聡、中村 雄一、雨宮 剛、新川 暢 (2000年7月). 「常染色体優性遺伝性後極白内障遺伝子座はヒト染色体20p12-q12にマッピングされる」. European Journal of Human Genetics . 8 (7): 535–9 . doi : 10.1038/sj.ejhg.5200485 . PMID 10909854. Rosenberger G, Jantke I, Gal A, Kutsche K (2003年1月). 「alphaPIX (ARHGEF6) と beta-parvin (PARVB) の相互作用は、alphaPIX がインテグリンを介したシグナル伝達に関与していることを示唆している」. Human Molecular Genetics . 12 (2): 155–67 . doi : 10.1093/hmg/ddg019 . PMID 12499396. 橋爪 H、ハマライネン H、Sun Q、Sucharczuk A、Lahesmaa R (2003 年 1 月)。 「インビトロでの初期分化中のヘルパーT細胞におけるmafB発現の下方制御」。 スカンジナビア免疫学ジャーナル 。 57 (1): 28–34 . 土井 : 10.1046/j.1365-3083.2003.01181.x 。 PMID 12542795。 Fernández-Calotti PX, Salamone G, Gamberale R, Trevani A, Vermeulen M, Geffner J, Giordano M (2003年1月). 「単球におけるmac-1発現のダウンレギュレーション:表面結合IgGによる」. Scandinavian Journal of Immunology . 57 (1): 35– 44. doi :10.1046/j.1365-3083.2003.01187.x. hdl : 11336/54949 . PMID 12542796. S2CID 41273554. Mechta-Grigoriou F、Giudicelli F、Pujades C、Charnay P、Yaniv M (2003 年 6 月)。 「発達後後脳におけるc-jun制御と機能」。 発生生物学 。 258 (2): 419–31 . 土井 : 10.1016/S0012-1606(03)00135-0 。 PMID 12798298。 Kim JC, Badano JL, Sibold S, Esmail MA, Hill J, Hoskins BE, Leitch CC, Venner K, Ansley SJ, Ross AJ, Leroux MR, Katsanis N, Beales PL (2004年5月). 「バルデット・ビードルタンパク質BBS4は、輸送体を中心体周囲領域に輸送し、微小管の固定と細胞周期の進行に必須である」 Nature Genetics . 36 (5): 462–70 . doi : 10.1038/ng1352 . PMID 15107855. Sevinsky JR, Whalen AM, Ahn NG (2004年5月). 「細胞外シグナル制御キナーゼはMafB/Kreislerを介して巨核球GPIIb/CD41遺伝子を誘導する」. Molecular and Cellular Biology . 24 (10): 4534–45 . doi :10.1128/MCB.24.10.4534-4545.2004. PMC 400447. PMID 15121870 . Petersen HH, Hilpert J, Jacobsen C, Lauwers A, Roebroek AJ, Willnow TE (2004年5月). 「低密度リポタンパク質受容体関連タンパク質は後脳発達の制御因子であるMafBと相互作用する」. FEBS Letters . 565 ( 1–3 ): 23–7 . Bibcode :2004FEBSL.565...23P. doi : 10.1016/j.febslet.2004.03.069 . PMID 15135046. S2CID 44547712. Bakri Y, Sarrazin S, Mayer UP, Tillmanns S, Nerlov C, Boned A, Sieweke MH (2005年4月). 「MafBとPU.1のバランスがマクロファージと樹状細胞の運命を決定する」 Blood . 105 (7): 2707–16 . doi : 10.1182/blood-2004-04-1448 . PMID 15598817. Gemelli C, Montanari M, Tenedini E, Zanocco Marani T, Vignudelli T, Siena M, Zini R, Salati S, Tagliafico E, Manfredini R, Grande A, Ferrari S (2006年10月). 「ウイルス媒介性MafB形質導入はヒトCD34陽性造血幹/前駆細胞の単球へのコミットメントを誘導する」. Cell Death and Differentiation . 13 (10): 1686–96 . doi : 10.1038/sj.cdd.4401860 . PMID 16456583. Lee LC, Zhang AY, Chong AK, Pham H, Longaker MT , Chang J (2006年2月). 「デュピュイトラン病における新規遺伝子MafBの発現」. The Journal of Hand Surgery . 31 (2): 211–8 . doi :10.1016/j.jhsa.2005.09.007. PMID 16473681.
外部リンク この記事には、 パブリック ドメイン である 米国国立医学図書館 のテキストが組み込まれています。
(1)基本領域
(1.1)基本 ロイシンジッパー ( bZIP ) (1.2)基本ヘリックスループヘリックス ( bHLH )
グループA グループB グループC bHLH- PAS グループD グループE グループF bHLH-COE
(1.3) bHLH-ZIP (1.4)NF-1 (1.5)RF-X (1.6)基本ヘリックス・スパン・ヘリックス(bHSH)
(2.1) 核内受容体 ( Cys4 )
(2.2)その他の Cys4 (2.3)システイン 2 ヒスチジン 2 (2.4)システイン 6 (2.5)交互構成 (2.6)WRKY
(4) マイナーグルーブコンタクトを有するβ-スキャフォールド因子