SPI1

SPI1
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 1PUE
識別子
エイリアス	SPI1、OF、PU.1、SFPI1、SPI-1、SPI-A、Spi-1プロトオンコゲン、AGM10
外部ID	オミム: 165170 ; MGI : 98282 ;ホモロジーン: 2346 ;ジーンカード: SPI1 ; OMA : SPI1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 11番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 11p11.2 始める 47,354,860 bp [ 1 ] 終わり 47,378,547 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 2番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 2 E1|2 50.44 cM 始める 90,912,735 bp [ 2 ] 終わり 90,946,101 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 顆粒球 単球 右肺 左肺の上葉 脾臓 血 骨髄細胞 付録 右冠動脈 リンパ節 上位の表現 顆粒球 脛大腿関節 腸間膜リンパ節 骨髄間質 脾臓 血 胸腺髄質 胚 リップ 足首関節 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 DNA結合 配列特異的DNA結合 DNA結合転写活性化因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合 転写因子活性、RNAポリメラーゼIIコアプロモーター近位領域配列特異的結合 DNA結合転写抑制活性、RNAポリメラーゼII特異的 タンパク質結合 RNA結合 転写因子活性、RNAポリメラーゼII遠位エンハンサー配列特異的結合 DNA結合転写因子活性 NFATタンパク質結合 DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 転写因子結合 細胞成分 核 核質 転写調節因子複合体 生物学的プロセス 骨髄性白血球の分化 転写の制御、DNAテンプレート エタノールに対する細胞反応 体性幹細胞集団の維持 リンパ球分化 赤血球分化の調節 骨髄樹状細胞の分化 RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御 MHCクラスII生合成プロセスの負の制御 リンパ系前駆細胞の分化 転写、DNAテンプレート マクロファージの分化 解剖学的構造の回帰 ヒストンH4のアセチル化の負の制御 遺伝子発現の負の調節、エピジェネティック 血管の発達 顆粒球分化 血管形態形成に関与するアポトーシス過程 ヒストンH3のアセチル化 赤血球分化 CpGアイランドの過剰メチル化 RNAポリメラーゼIIによるpri-miRNA転写の正の制御 RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 転写の負の制御、DNAテンプレート 転写の正の制御、DNAテンプレート RNAポリメラーゼIIによる転写の調節 RNAポリメラーゼIIによるpri-miRNA転写 細胞分化 インターロイキン-6を介したシグナル伝達経路 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 6688 20375 アンサンブル ENSG00000066336 ENSMUSG00000002111 ユニプロット P17947 P17433 RefSeq (mRNA) NM_001080547 NM_003120 NM_011355 NM_001378898 NM_001378899 RefSeq（タンパク質） NP_001074016 NP_003111 NP_035485 NP_001365827 NP_001365828 場所（UCSC） 11章: 47.35 – 47.38 Mb 2番目の文字: 90.91 – 90.95 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
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転写因子PU.1は、ヒトではSPI1遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[ 5 ]}

関数

この遺伝子は、骨髄細胞およびBリンパ球細胞の分化において遺伝子発現を活性化するETSドメイン転写因子をコードしている。^{[ 6 ]}核タンパク質は、標的遺伝子のエンハンサーに存在するPUボックスと呼ばれるプリンに富む配列に結合し、他の転写因子や補因子と協調して標的遺伝子の発現を制御する。また、標的遺伝子の選択的スプライシングも制御することができる。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする複数の転写バリアントが見出されている。^{[ 7 ]}

PU.1転写因子は造血と細胞運命決定に必須である。PU.1はSWI/SNF、^{[ 8 ]} 、 TFIID、GATA-2、GATA-1、c-Junなどの様々な制御因子と物理的に相互作用することができる。これらの因子間のタンパク質間相互作用は、PU.1依存性の細胞運命決定を制御することができる。PU.1は、サイトカインを含む造血細胞中の3000個の遺伝子の発現を調節することができる。単球、顆粒球、B細胞、NK細胞で発現しているが、 T細胞、網状赤血球、巨核球には発現していない。その転写は様々なメカニズムによって制御されている。^{[ 9 ]}

PU.1は線維化促進システムの必須制御因子である。線維化状態では、PU.1の発現が乱れ、線維芽細胞における線維化関連遺伝子の上方制御が生じる。線維化促進線維芽細胞におけるPU.1の阻害は、線維芽細胞を休止状態に戻す。PU.1は、細胞外マトリックス産生線維化促進線維芽細胞で高発現しているのに対し、炎症性/ECM分解性線維芽細胞および休止期線維芽細胞では発現が低下している。線維化状態でPU.1を発現している細胞の大部分は、少数の浸潤リンパ球を含む線維芽細胞である。PU.1は、休止期および炎症性線維芽細胞を線維化促進線維芽細胞へと分極させる。^{[ 10 ]}

構造

ETS ドメインは、PU.1 およびその他の ETS ファミリー転写因子の DNA 結合モジュールです。

相互作用

SPI1 は以下と相互作用することが示されています。

• FUS、^{[ 11 ]}
• GATA2 , ^{[ 12 ]}
• IRF4、^{[ 13 ] [ 14 ]}および
• ノノ[ ^{15 ]​}

参考文献

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さらに読む

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外部リンク

• ファクターブックPU.1

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