真核生物における遺伝子群の転写を制御するタンパク質
SPIB 識別子 エイリアス SPIB 、SPI-B、Spi-B転写因子 外部ID オミム :606802; MGI : 892986; ホモロジーン : 79220; ジーンカード :SPIB; OMA :SPIB - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) キリスト 7番染色体(マウス) [2] バンド 7 B3|7 28.83 cM 始める 44,175,417 bp [2] 終わり 44,181,495 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) 上位の表現 リンパ節 横行結腸粘膜 付録 顆粒球 口腔粘膜細胞 脾臓 直腸 回腸粘膜 鼻咽頭上皮 血
上位の表現 腸間膜リンパ節 脾臓 脛大腿関節 血 顆粒球 皮下脂肪組織 顎下腺 骨髄 胸腺 大腿骨
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バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 DNA結合転写因子活性 配列特異的DNA結合 DNA結合 RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合 DNA結合転写活性化因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 細胞成分 生物学的プロセス RNAポリメラーゼIIによる転写の調節 細胞分化 転写の制御、DNAテンプレート 転写、DNAテンプレート RNAポリメラーゼIIによる転写 RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 出典:Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_003121 NM_001243998 NM_001243999 NM_001244000
RefSeq(タンパク質) NP_001230927 NP_001230928 NP_001230929 NP_003112
場所(UCSC) 19章: 50.42 – 50.43 MB 7章: 44.18 – 44.18 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
転写因子Spi-B は、ヒトでは SPIB 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6]
関数 SPI1(MIM 165170)とSPIBは、ETS(ETS1; MIM 164720参照)転写因子のサブファミリーに属します。ETSタンパク質は、特異的なDNA結合を媒介するETSドメインを共有しています。SPIBとSPI1は、プリンを多く含む配列であるPUボックス(5-プライム-GAGGAA-3-プライム)に結合します。[OMIM提供] [6]
相互作用 SPIBはMAPK3 [7] および MAPK8 と 相互作用する ことが示されている 。 [7]
参考文献 ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000269404 – Ensembl 、2017年5月 ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000008193 – Ensembl 、2017年5月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ Ray D, Bosselut R, Ghysdael J, Mattei MG, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (1992年10月). 「推定腫瘍タンパク質Spi-1/PU.1に関連する転写因子Spi-Bの特性評価」. Molecular and Cellular Biology . 12 (10): 4297–304 . doi :10.1128/mcb.12.10.4297. PMC 360353. PMID 1406622 . ^ ab "Entrez Gene: SPIB Spi-B転写因子(Spi-1/PU.1関連)". ^ ab Mao C, Ray-Gallet D, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (1996年2月). 「Spi-BおよびSpi-1転写因子の異なるリン酸化」. Oncogene . 12 (4): 863–73 . PMID 8632909.
さらに読む 丸山 憲治、菅野 誠(1994年1月). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡便法」. 遺伝子 . 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298. Mao C, Ray-Gallet D, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (1996年2月). 「Spi-BおよびSpi-1転写因子の異なるリン酸化」. Oncogene . 12 (4): 863–73 . PMID 8632909. Ray-Gallet D, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (1996年6月). 「Spi-B転写因子の選択的スプライシングアイソフォーム」. 生化学および生物理学的研究通信 . 223 (2): 257–63 . Bibcode :1996BBRC..223..257R. doi :10.1006/bbrc.1996.0881. PMID: 8670269. 鈴木雄三、中川吉智、丸山健、須山明生、菅野誠一(1997年10月)「全長エンリッチドcDNAライブラリーおよび5'末端エンリッチドcDNAライブラリーの構築と特性解析」 Gene . 200 ( 1–2 ): 149–56 . doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149. Rao S, Matsumura A, Yoon J, Simon MC (1999年4月). 「SPI-Bは、独自のプロリン、セリン、およびスレオニンドメインを介して転写を活性化し、PU.1とは異なるDNA結合親和性を示す」. The Journal of Biological Chemistry . 274 (16): 11115–24 . doi : 10.1074/jbc.274.16.11115 . PMID 10196196. Nagy M, Chapuis B, Matthes T (2002年2月). 「正常ヒト形質細胞および多発性骨髄腫細胞における転写因子Pu.1、Spi-B、Blimp-1、BSAP、およびoct-2の発現」. British Journal of Haematology . 116 (2): 429–35 . doi : 10.1046/j.1365-2141.2002.03271.x . PMID 11841448. S2CID 22132659. 山本 浩、木原(根岸)文、山田 剛、鈴木 正、中野 剛、及川 哲也(2002年2月)「造血系Ets転写因子Spi-Bと共活性化因子CREB結合タンパク質の相互作用とc-Mybとのネガティブクロストーク」 細胞増殖・分化 誌、 13 (2): 69-75 . PMID 11864910. Schotte R, Rissoan MC, Bendriss-Vermare N, Bridon JM, Duhen T, Weijer K, Brière F, Spits H (2003年2月). 「転写因子Spi-Bは形質細胞様樹状細胞前駆細胞で発現し、T細胞、B細胞、NK細胞の分化を阻害する」 Blood . 101 (3): 1015–23 . doi : 10.1182/blood-2002-02-0438 . PMID 12393575. Schotte R, Nagasawa M, Weijer K, Spits H, Blom B (2004年12月). 「ETS転写因子Spi-Bはヒト形質細胞様樹状細胞の発達に必須である」 (PDF) . The Journal of Experimental Medicine . 200 (11): 1503–9 . doi :10.1084/jem.20041231. PMC 2211952. PMID 15583020 . ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實・岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ=グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグ DS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、 ゾグビ HY 、スモリャル A、ボサク S、セケーラ R、ドゥセット スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M (2005 年 10 月)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。 自然 。 437 (7062): 1173–8 . Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026. Geng CD, Vedeckis WV (2005年12月). 「c-Mybおよびc-Etsファミリー転写因子は分子スイッチとして作用し、ヒトグルココルチコイド受容体1Aプロモーターの相反するステロイド制御を媒介する」 The Journal of Biological Chemistry . 280 (52): 43264–71 . doi : 10.1074/jbc.M508245200 . PMID 16263717. Dontje W, Schotte R, Cupedo T, Nagasawa M, Scheeren F, Gimeno R, Spits H, Blom B (2006年3月). 「Delta-like1誘導性Notch1シグナル伝達はGATA-3およびSpi-Bの制御を介してヒト形質細胞様樹状細胞とT細胞系の分化決定を制御する」 Blood . 107 (6): 2446–52 . doi : 10.1182/blood-2005-05-2090 . PMID 16317090.
外部リンク 米国国立医学図書館の 医学主題標目表 (MeSH)における SPIB+タンパク質、+ヒト この記事には、 パブリック ドメイン である 米国国立医学図書館 のテキストが組み込まれています。
(1)基本領域
(1.1)基本 ロイシンジッパー ( bZIP ) (1.2)基本ヘリックスループヘリックス ( bHLH )
グループA グループB グループC bHLH- PAS グループD グループE グループF bHLH-COE
(1.3) bHLH-ZIP (1.4)NF-1 (1.5)RF-X (1.6)基本ヘリックス・スパン・ヘリックス(bHSH)
(2.1) 核内受容体 ( Cys4 )
(2.2)その他の Cys4 (2.3)システイン 2 ヒスチジン 2 (2.4)システイン 6 (2.5)交互構成 (2.6)WRKY
(4) マイナーグルーブコンタクトを有するβ-スキャフォールド因子