ヒトのタンパク質コード遺伝子
TLX1 識別子 エイリアス TLX1 、HOX11、TCL3、T細胞白血病ホメオボックス1、T細胞白血病ホメオボックス1 外部ID オミム : 186770; MGI : 98769; ホモロジーン : 4031; ジーンカード :TLX1; OMA :TLX1 - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) キリスト 19番染色体(マウス) [2] バンド 19 C3|19 38.45 cM 始める 45,139,119 bp [2] 終わり 45,145,382 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) 上位の表現 脾臓 睾丸 小唾液腺 生殖腺 肝臓の右葉 横行結腸粘膜 十二指腸 扁桃腺 心臓の心室 左心室
上位の表現 背側腸間膜 舌 中耳 顎下腺 外耳 耳介 外耳の皮膚 女性の尿道 男性尿道 耳管
より多くの参照表現データ
バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合 DNA結合 配列特異的DNA結合 DNA結合転写活性化因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 タンパク質結合 DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 DNA結合転写因子活性 細胞成分 生物学的プロセス 多細胞生物の発達 転写の制御、DNAテンプレート RNAポリメラーゼIIによる転写 RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 RNAポリメラーゼIIによる転写の調節 出典:Amigo / QuickGO
ウィキデータ
T細胞白血病ホメオボックスタンパク質1 は、ヒトでは TLX1 遺伝子によってコードされる タンパク質 であり 、当初は HOX11 と命名されていました。 [5] [6] [7] [8] [9]
相互作用 TLX1はPPP1CC [10] 、 PPP2CB [10] 、 PPP2CA [10] と 相互作用する ことが示されている 。
参考文献 ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000107807 – Ensembl 、2017年5月 ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000025215 – Ensembl 、2017年5月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ Hatano M, Roberts CW, Minden M, Crist WM, Korsmeyer SJ (1991年7月). 「T細胞白血病におけるt(10;14)によるホメオボックス遺伝子HOX11の脱制御」. Science . 253 (5015): 79– 82. Bibcode :1991Sci...253...79H. doi :10.1126/science.1676542. PMID : 1676542. ^ McAlpine PJ, Shows TB (1990年7月). 「ヒトホメオボックス遺伝子の命名法」. Genomics . 7 (3): 460. doi :10.1016/0888-7543(90)90186-X. PMID 1973146. ^ 「Entrez Gene: TLX1 T細胞白血病ホメオボックス1」。 ^ Kennedy MA, Gonzalez-Sarmiento R, Kees UR, Lampert F, Dear N, Boehm T, Rabbitts TH (1991年10月). 「HOX11:ヒト染色体10q24上のホメオボックス含有T細胞癌遺伝子」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 88 (20): 8900–4 . Bibcode :1991PNAS...88.8900K. doi : 10.1073/pnas.88.20.8900 . PMC 52618. PMID 1681546 . ^ Dubé ID, Kamel-Reid S, Yuan CC, Lu M, Wu X, Corpus G, Raimondi SC, Crist WM, Carroll AJ, Minowada J (1991年12月). 「染色体転座t(10;14)を伴うリンパ系腫瘍において、10番染色体の切断点に新規ヒトホメオボックス遺伝子が位置する」 Blood . 78 (11): 2996– 3003. doi : 10.1182/blood.V78.11.2996.2996 . PMID 1683261. ^ abc Kawabe T, Muslin AJ , Korsmeyer SJ (1997年1月). 「HOX11はタンパク質ホスファターゼPP2AおよびPP1と相互作用し、G2/M期細胞周期チェックポイントを破壊する」 Nature 385 (6615): 454–8 . Bibcode :1997Natur.385..454K. doi :10.1038/385454a0. PMID 9009195. S2CID 608633.
さらに読む Allen TD, Zhu YX, Hawley TS, Hawley RG (2000年10月). 「T細胞白血病におけるHOX11相互作用パートナーとしてのTALEホメオプロテイン」. 白血病・リンパ腫 . 39 ( 3–4 ): 241–56 . doi :10.3109/10428190009065824. PMID 11342305. S2CID 27407074. Lu M, Zhang N, Ho AD (1992年7月). 「ヒトホメオボックスプロトオンコジーンHOX-11(TCL-3)のゲノム構成とT細胞における内因性発現」. Oncogene . 7 (7): 1325–30 . PMID 1352396. Kennedy MA, Gonzalez-Sarmiento R, Kees UR, Lampert F, Dear N, Boehm T, Rabbitts TH (1991年10月). 「ヒト染色体10q24上のホメオボックス含有T細胞癌遺伝子、HOX11」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 88 (20): 8900–4 . Bibcode :1991PNAS...88.8900K. doi : 10.1073/pnas.88.20.8900 . PMC 52618. PMID 1681546 . Lu M, Gong ZY, Shen WF, Ho AD (1991年10月). 「T細胞白血病において染色体転座によって変化したTCL-3プロトオンコゲンはホメオボックスタンパク質をコードする」. EMBOジャーナル . 10 (10): 2905–10 . doi :10.1002/j.1460-2075.1991.tb07840.x. PMC 453003. PMID 1717256 . Dear TN, Colledge WH, Carlton MB, Lavenir I, Larson T, Smith AJ, Warren AJ, Evans MJ, Sofroniew MV, Rabbitts TH (1995年9月). 「Hox11遺伝子は脾臓発生における細胞生存に必須である」. Development . 121 (9): 2909–15 . doi :10.1242/dev.121.9.2909. PMID 7555717. TN様、Sanchez-Garcia I、Rabbitts TH (1993年5月). 「HOX11遺伝子は、ホメオボックス遺伝子の明確なファミリーに属するDNA結合核内転写因子をコードする」 米国科学アカデミー紀要 . 90 (10): 4431–5 . Bibcode : 1993PNAS...90.4431D. doi : 10.1073/pnas.90.10.4431 . PMC 46525. PMID 8099440 . Kawabe T, Muslin AJ, Korsmeyer SJ (1997年1月). 「HOX11はタンパク質ホスファターゼPP2AおよびPP1と相互作用し、G2/M期細胞周期チェックポイントを破壊する」 Nature 385 ( 6615): 454–8 . Bibcode :1997Natur.385..454K. doi :10.1038/385454a0. PMID 9009195. S2CID 608633. Brake RL, Kees UR, Watt PM (1998年10月). 「複数のネガティブエレメントがHOX11プロトオンコゲンの抑制に寄与する」. Oncogene . 17 (14): 1787–95 . doi : 10.1038/sj.onc.1202078 . PMID 9778044. Zhang N, Shen W, Hawley RG, Lu M (1999年4月). 「HOX11はCTF1と相互作用し、造血前駆細胞の不死化を媒介する」. Oncogene . 18 (13): 2273–9 . doi : 10.1038/sj.onc.1202545 . PMID 10327073. Watt PM, Ranford PR, Kees UR (1999年6月). 「HOX11がん遺伝子周囲の10q24遺伝子座の配列は、T-ALL細胞株で発現する新規遺伝子HUG1を明らかにする」. Gene . 234 (1): 169–76 . doi :10.1016/S0378-1119(99)00157-2. PMID 10393251. Brake RL, Kees UR, Watt PM (2002年5月). 「PBX2を含む複合体はプロトオンコジーンHOX11の活性化に寄与する」. 生化学および生物理学的研究通信 . 294 (1): 23– 34. doi :10.1016/S0006-291X(02)00426-6. PMID 12054735. Bodenmiller DM, Baxter CS, Hansen DV, Potter SS (2002年4月). 「Hoxa 11配列の系統解析により、転移因子が存在しないことが明らかになり、転写因子結合部位は保存されており、アンチセンスコード機能が示唆される」. DNA Sequence . 13 (2): 77– 83. doi :10.1080/10425170290029981. PMID 12180349. S2CID 38713800. カヴェ H、スシュー S、プルードンム C、ポッペ B、ロベール A、ユッテブルック A、マレット M、ブータール P、ブノワ Y、モーヴュー L、ルッツ P、メシノー F、グラデル N、マジンゲ F、デュポン M、マルグリット G、ページ MP、ベルトラン Y、プルヴィエ E、ブルニー G、バスタード C、プランツ D、ヴァンデ ヴェルデ私、Hagemeijer A、Speleman F、Lessard M、Otten J、Vilmer E、Dastugue N (2004 年 1 月)。 「小児T細胞悪性腫瘍におけるt(5;14)(q35;q32)、HOX11発現、およびSIL-TAL融合に関連するHOX11L2発現の臨床的重要性:EORTC研究58881および58951の結果」。 血 。 103 (2): 442–50 . doi : 10.1182/blood-2003-05-1495 . PMID 14504110. Hoffmann K, Dixon DN, Greene WK, Ford J, Taplin R, Kees UR (2004年12月). 「マイクロアレイモデルシステムによるプロトオンコゲンHOX11の潜在的な新規標的遺伝子の同定」. Genes, Chromosomes & Cancer . 41 (4): 309–20 . doi :10.1002/gcc.20104. PMID 15384172. S2CID 19475690. Riz I, Hawley RG (2005年8月). 「T細胞急性リンパ芽球性白血病におけるHOX11/TLX1がん遺伝子によるG1/S期転写ネットワークの調節」. Oncogene . 24 (36): 5561–75 . doi :10.1038/sj.onc.1208727. PMC 2408753. PMID 15897879 . Heidari M, Rice KL, Phillips JK, Kees UR, Greene WK (2006年2月). 「核内がんタンパク質TLX1/HOX11は白血病T細胞におけるセントロメリックサテライト2DNAと会合する」. 白血病 . 20 (2): 304–12 . doi : 10.1038/sj.leu.2404071 . PMID 16357834. Chen E, Lim MS, Rosic-Kablar S, Liu J, Jolicoeur P, Dubé ID, Hough MR (2006年4月). 「有糸分裂制御因子の発現異常はHOX11トランスジェニックマウスにおけるB細胞リンパ腫形成と関連する」. Oncogene . 25 (18): 2575–87 . doi : 10.1038/sj.onc.1209285 . PMID 16407851.
(1)基本領域
(1.1)基本 ロイシンジッパー ( bZIP ) (1.2)基本ヘリックスループヘリックス ( bHLH )
グループA グループB グループC bHLH- PAS グループD グループE グループF bHLH-COE
(1.3) bHLH-ZIP (1.4)NF-1 (1.5)RF-X (1.6)基本ヘリックス・スパン・ヘリックス(bHSH)
(2.1) 核内受容体 ( Cys4 )
(2.2)その他の Cys4 (2.3)システイン 2 ヒスチジン 2 (2.4)システイン 6 (2.5)交互構成 (2.6)WRKY
(4) マイナーグルーブコンタクトを有するβ-スキャフォールド因子