ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
ATF2 利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 1BHI、1T2K、4H36
識別子 エイリアス ATF2 、CRE-BP1、CREB-2、CREB2、HB16、TREB7、活性化転写因子2 外部ID オミム : 123811; MGI : 109349; ホモロジーン :31061; ジーンカード :ATF2; OMA :ATF2 - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) キリスト 染色体2(マウス) [2] バンド 2|2 C3 始める 73,816,509 bp [2] 終わり 73,892,639 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) 上位の表現 内皮細胞 胚上皮 ブロードマン野23 精巣上体 精巣上体頭 副鼻腔粘膜 緻密部 精巣上体尾部 神経節隆起 脈絡叢上皮
上位の表現 視床下部室傍核 内側背側核 視床下部背内側核 ハベヌラ 弓状核 腹側被蓋野 嗅結節 外側中隔核 前扁桃体領域 鉤状部
より多くの参照表現データ
バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 トランスフェラーゼ活性 RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合 DNA結合 配列特異的DNA結合 RNAポリメラーゼII転写調節領域配列特異的DNA結合 cAMP応答要素結合タンパク質結合 DNA結合転写因子活性 DNA結合転写活性化因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 転写コアクチベーター活性 クロマチン結合 金属イオン結合 タンパク質結合 シス調節領域配列特異的DNA結合 核酸結合 転写因子活性、RNAポリメラーゼII遠位エンハンサー配列特異的結合 タンパク質キナーゼ結合 cAMP応答要素結合 ヒストンアセチルトランスフェラーゼ活性 DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 転写因子結合 タンパク質ヘテロ二量体形成活性 細胞成分 細胞質 膜 核質 ミトコンドリア外膜 ミトコンドリア 核 二本鎖切断部位 生物学的プロセス 転写の制御、DNAテンプレート RNAポリメラーゼIIによる転写の調節 有糸分裂S細胞内DNA損傷チェックポイントシグナル伝達 流出路の形態形成 水不足への対応 DNA結合転写因子活性の正の調節 RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御 RNAポリメラーゼIIによる転写 トランスフォーミング成長因子β2産生の正の調節 転写、DNAテンプレート DNA損傷刺激に対する細胞応答 浸透圧ストレスへの反応 ニューロンのアポトーシス過程の正の調節 DNA結合転写因子活性の調節 アポトーシス過程に関与するミトコンドリア膜透過性の正の調節 上皮細胞増殖の負の調節 脂肪組織の発達 脂肪細胞の分化 RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 アメロジェネシス ヒストンのアセチル化 心筋筋芽細胞増殖の正の制御 遺伝子発現の正の調節 血管新生の負の調節 出典:Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001256090 NM_001256091 NM_001256092 NM_001256093 NM_001256094 NM_001880
NM_001025093 NM_001284369 NM_001284370 NM_001284371 NM_001284372 NM_001284373 NM_001284374 NM_001284376 NM_009715
RefSeq(タンパク質) NP_001243019 NP_001243020 NP_001243021 NP_001243022 NP_001243023 NP_001871
NP_001020264 NP_001271298 NP_001271299 NP_001271300 NP_001271301 NP_001271302 NP_001271303 NP_001271305 NP_033845
場所(UCSC) 2章: 175.07 – 175.17 Mb 2番目の文字: 73.82 – 73.89 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
活性化転写因子2 ( ATF2 とも呼ばれる) は、ヒトでは ATF2 遺伝子 によってコードされる タンパク質 である。 [5]
関数 この遺伝子は、 DNA結合タンパク質の ロイシンジッパー ファミリーに属する 転写因子をコードしています。このタンパク質は、八量体回文構造である cAMP応答配列(CRE)に結合します。このタンパク質は c-Jun とホモ二量体またはヘテロ二量体を形成します 。また、このタンパク質は ヒストンアセチルトランスフェラーゼ(HAT)でもあり、in vitroでヒストンH2BおよびH4を特異的にアセチル化します。したがって、 クロマチン 構成成分に直接作用することで転写を活性化する配列特異的因子の一種である可能性があります 。他にも転写産物バリアントが同定されていますが、その生物学的妥当性は未だ確立されていません。 [5]
atf2遺伝子はヒト染色体2q32に位置する。 [6] ATF-2タンパク質は505個のアミノ酸から構成される。マウスを用いた研究では、ATF-2が神経系と骨格の発達に関与していることが示唆されている。 [7] ATF-2は通常、 ストレス活性化プロテインキナーゼp38 と JNK に収束するシグナルに反応して活性化される 。 [8]腫瘍プロモーターである ホルボール エステルによる細胞処理に反応してATF-2がリン酸化されること が実証されている。 [9]
いくつかの研究では、哺乳類の皮膚腫瘍の増殖と進行にATF-2の異常な活性化が関与していることが示唆されている。 [10] [11] ATF-2は変異 Rasタンパク質 によって引き起こされる腫瘍形成を媒介し [12] 、一部の上皮細胞の攻撃的な癌表現型の維持を制御する可能性がある。
ATF2は二本鎖切断 時に ATMによって C末端 ( マウスではセリン472と480、ヒトではセリン490と498)が リン酸化される ことも示されています 。 [13] これら2つのセリンの変異を持つマウスは放射線に敏感で、p53ノックアウト環境では腫瘍形成が容易です。
相互作用 活性化 転写因子2は 、
参照
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外部リンク
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外部リンク PDBe-KBは、ヒト環状AMP依存性転写因子ATF-2のPDBに登録されているすべての構造情報の概要を提供します。
(1)基本領域
(1.1)基本 ロイシンジッパー ( bZIP ) (1.2)基本ヘリックスループヘリックス ( bHLH )
グループA グループB グループC bHLH- PAS グループD グループE グループF bHLH-COE
(1.3) bHLH-ZIP (1.4)NF-1 (1.5)RF-X (1.6)基本ヘリックス・スパン・ヘリックス(bHSH)
(2.1) 核内受容体 ( Cys4 )
(2.2)その他の Cys4 (2.3)システイン 2 ヒスチジン 2 (2.4)システイン 6 (2.5)交互構成 (2.6)WRKY
(4) マイナーグルーブコンタクトを有するβ-スキャフォールド因子